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人类肿瘤组织中非编码RNA-NC28和NC119的鉴定及表达
目的 寻找并验证与肿瘤相关的非编码RNA.方法 采用RT-PCR和Northern blot分析非编码RNA在肿瘤组织及细胞系中的表达情况.结果 RT-PCR在实体肿瘤和细胞系中鉴定了2个非编码RNA-NC28和NC119的表达,Northern blot检测发现NC28转录子长度大约为1 800个核苷酸,NC119转录子长度大约为1 200个核苷酸.结论 这两种非编码RNA具有一定的肿瘤共享性,非编码RNA在肿瘤发生发展中可能发挥一定作用.
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非编码RNA与哺乳动物生殖细胞生长发育
基因转录后调控是表观遗传学的主要内容，是指通过DNA层面的修饰使原来拥有相同基因型的不同组织或细胞呈现出不同的表型和功能。非编码RNA作为此表观遗传调控的主要执行者之一，能够在转录水平调控蛋白质丰度，在生殖系统中更是发挥了基础调节者的作用。广义的非编码RNA包含了rRNA、tRNA、微小RNA （miRNA）、小干扰RNA （siRNA）、Piwi蛋白相互作用的RNA （piRNA）和长链非编码RNA （lncRNA）等。由于rRNA、tRNA已被人们较为熟知，文章主要选取miRNA、siRNA、piRNA等非编码RNA，针对其近期的研究进展，阐述该类非编码RNA在哺乳动物生殖细胞中的表达以及对生殖细胞发生、成熟的影响及作用机制。与此同时，还对另一类非编码RNA———lncRNA做基本的介绍。
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非编码RNA在生殖调节中的研究进展
非编码RNA(ncRNAs)在高等生物体内大量存在,组成十分复杂的生物调控网络,是目前生物医学领域的研究热点.小干扰RNA(siRNA)、微小RNA(miRNA)和PIWI相互作用RNA(piRNA)作为细胞内基因调控网络的重要成员影响细胞的各种生命活动.近年研究表明,ncRNA通过沉默转座元件和调控编码基因等方式在生殖细胞发育、分化、凋亡及激素合成的调控过程中发挥重要作用,ncRNA的异常表达与多囊卵巢综合征(PCOS)和卵巢功能早衰(POF)等生殖疾病密切相关.综述ncRNA在卵泡和胚胎发育以及精子生成等方面的作用及其研究进展.
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circRNA404524在PM2.5致BEAS-2B细胞炎症过程中的功能及机制研究
目的 研究circRNA 404524在PM2.5致永生化人支气管上皮样细胞(BEAS-2B)炎症过程中表达改变,探索circRNA在PM2.5致气道炎症过程中的功能及机制.方法 BEAS-2B细胞分为6组:NT组(DMSO),PM2.5组(75 μg/ml PM25),NC组(转染空载体质粒+DMSO),NC+PM2.5组(转染空载体质粒+75μg/ml PM2.5),OE组(转染circRNA 404524+DMSO),OE+PM2.5组(转染circRNA 404524+75μgml PM2.5).使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测circRNA404524在75 μg/ml PM2.5染毒BEAS-2B细胞中的表达水平,同时通过转染circRNA 404524拘过表达载体联合75 μg/ml PM2.5染毒后检测circRNA404524、IL-6及IL-8的表达水平.检测circRNA 404524在BEAS-2B细胞胞浆/胞核的表达水平,分析其表达位置.通过KEGG生物信息学软件分析circRNA 404524可能参与调控的基因通路,而后检测NF-κB炎症通路关键基因的表达水平.结果 与NT组相比,circRNA 404524在PM2.5组表达下调,相对变化倍数为2.63,差异有统计学意义(P＜0.01).转染circRNA 404524过表达载体后,通过检测发现,相比于NC组,OE组中circRNA 404524上调154.74倍,差异有统计学意义(P＜0.01).检测炎症因子表达水平发现,与NC组相比,OE组中IL-6及IL-8表达均下调,差异均具有统计学意义(P＜0.05),NC+PM25组中IL-6和IL-8表达均上调,差异均具有统计学意义(P＜0.01).胞浆胞核定位结果显示circRNA 404524主要在胞核表达,检测NF-κB炎症通路关键基因的表达水平发现,相比于NC组,OE组中IKK-alpha、IKB-alpha及NFKB1表达均下调,NC+PM2.5组中表达均上调,差异均具有统计学意义(P＜0.05).结论 circRNA 404524在PM2.5染毒的BEAS-2B细胞中低表达,将其过表达后,PM2.5引起的炎症水平降低,提示其在PM2.5染毒致BEAS-2B细胞炎症过程中发挥抑炎基因的作用,并可能通过对NF-κB炎症通路的调控发挥功能.
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竞争性内源RNA新模式:环状RNA
环状RNA(circRNA)广泛存在于各种生物细胞中,具有结构稳定、丰度高和组织特异性表达等特征.新近研究显示,circRNA是竞争性内源RNA (ceRNA)的重要成员,通过与靶微小RNA(miRNA)结合,调控相关RNA的表达,在基因调节和表达等方面发挥着重要功能.circRNA不仅丰富了人们对真核生物和ceRNA调控作用网络的认识,而且提示circRNA可作为疾病诊断的生物学新标志物,在药物开发和疾病诊治中具有良好的应用前景.然而目前对于circRNA的研究还十分有限,本文就circRNA的相关研究进行综述,以供进一步研究.
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非编码RNA在分化型甲状腺癌分子诊断中的作用
分化型甲状腺癌占全部甲状腺癌的90％以上,主要包括乳头状癌和滤泡状癌.目前,细针穿刺抽吸活检是术前诊断甲状腺肿瘤的金标准,但仍存在一定的局限性,且临床上尚无理想的分子标志物用于确诊.非编码RNA是无蛋白编码功能的RNA,主要包括微小RNA (miRNA)和长链非编码RNA (lncRNA),二者在甲状腺癌的发生、发展中起重要作用,其在分化型甲状腺癌分子诊断中的作用日益受到人们的关注,有望成为甲状腺癌诊断与分类的理想标志物.
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非编码RNA在喉鳞状细胞癌中的研究进展
非编码RNA是一类不编码蛋白质的RNA,包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,ln-cRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)等.非编码RNA不仅在生物调节过程中扮演着重要角色,在包括肿瘤在内的多种疾病的发生机制中也起到了不可或缺的作用,其在喉癌的诊断、预后评估及治疗中同样具有重要的临床价值.喉鳞状细胞癌是喉癌中常见的病理学类型,近年来发病率有明显增高的趋势,已严重危害人类健康及生存质量.本文总结了近年国内外研究,对miRNA、lncRNA和circRNA在喉癌发生发展的作用机制进行综述.
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肝缺血再灌注损伤过程中细胞自噬的研究进展
自噬是真核细胞在自噬相关基因(ATG)的调控下利用溶酶体对自身受损的细胞器和大分子物质进行生物学降解的过程.肝缺血再灌注损伤(LIRI)是肝脏手术及失血性休克后肝功能障碍和衰竭主要的致病因素,而且也是早期肝移植失败以及移植排斥反应增加的原因.目前临床上移植供肝主要来源于DCD,但由于移植供肝的短缺,使得边缘供肝使用的增加,更加重了肝缺血再灌注损伤.因此,怎样降低肝缺血再灌注损伤,成为改善移植物功能的关键问题.大量文献研究表明,自噬与肝缺血再灌注损伤有着密切关系.本文就近年来自噬在肝缺血再灌注损伤的作用进行综述,以期进一步深入了解和认识自噬在肝缺血再灌注损伤中的重要影响和潜在的治疗价值.
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环状RNA在心血管疾病中的研究进展
环状RNA是一类非编码RNA,呈共价闭合环状结构,结构稳定、高度保守,具有组织特异性和发育阶段特异性表达的特征.环状RNA的功能仍不清楚,目前认为其有以下功能:microRNAs海绵、调节剪切或转录、与RNA结合蛋白相互作用调节基因表达.有报道发现环状RNA在衰老、胰岛素分泌、组织发育、动脉粥样硬化性血管疾病、心肌肥厚和肿瘤中发挥重要作用.本文对环状RNA的结构、分类、功能及其在心血管系统疾病中的作用进行综述.
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细胞外囊泡研究新进展
背景：细胞外囊泡是细胞旁分泌产生的一种亚细胞成分，近年来学界研究的热点——外泌体、膜微粒及微囊泡等均在其范畴。
目的：就细胞外囊泡定义分类、形成释放过程、分离鉴定方法、生物学意义及其在临床疾病和生物医学研究中应用等方面的新进展作一综述。
方法：由第一作者在PubMed、CNKI等数据库中进行文献检索，关键词为”Extracel ular Vesicles，exosome， microvesicle，microparticle”及“细胞外囊泡、外泌体、微囊泡、膜微粒”。检索时间为2006年7月至2016年8月。
结果与结论：共纳入44篇文献。几乎所有的细胞都能产生细胞外囊泡，其中含有脂质、蛋白质、核酸(DNA、mRNA及microRNA、lncRNA、circRNA等noncodingRNA)等多种母细胞来源的生物活性成份，这些信息物质包裹在囊泡中或携带于膜上。他们参与炎症免疫反应、细胞间信号通讯、细胞存活与凋亡、血管新生、血栓形成、自噬等，在生理状态维持及疾病的进程中发挥重要作用。特定类型的细胞外囊泡有望成为辅助疾病诊断及预后判断的新分子标记物；在抗肿瘤治疗、再生医学、免疫调节等方面也有着广阔前景；能为干细胞治疗非细胞途径开辟新路径；有可能作为疫苗或药物的天然载体为临床治疗带来福音。细胞外囊泡分泌的分子机制及其作用于靶细胞引起生物学功能变化的具体成分及其信号通路尚在研究中，以研究miRNA者为主，近年来lncRNA、circRNA开始成为新星逐渐走进学者视野。 -
LncRNAs和miRNAs在毛乳头细胞衰老与毛囊再生中的作用
毛乳头(dermal papilla,DP)细胞衰老能使毛囊失去诱导功能,是雄激素性脱发的主要机制.而Wnt信号通路与DP细胞衰老进程虽密切相关,但具体机制不明确.长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)和非编码单链小RNA (microRNAs,miRNAs)以各种不同的方式在基因表达的各个水平发挥着重要作用,并已证实在Wnt信号通路也存在这样的调控方式.因此,备受关注的lncRNAs和miRNAs,很可能是通过激活Wnt信号通路而发挥DP细胞的抗衰老作用,终维持毛囊诱导功能.笔者结合国内外文献,旨在通过对与DP细胞、毛囊再生以及与某些细胞衰老密切相关的lncRNAs/miRNAs和Wnt信号通路调控方式作一总结,以探讨完善脱发的分子机制,并提出可能的药物治疗靶点,从而为DP细胞衰老机制的研究提供新的思路.
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树突状细胞分化发育及功能的表观遗传学调控机制的研究进展
树突状细胞(DCs)是体内功能强的专职抗原提呈细胞,具有摄取、加工、处理和呈递抗原以及激活初始T淋巴细胞的功能.近年来研究发现,DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、基因组印记以及非编码RNA等表观遗传学修饰能调控相关基因的表达,同时树突状细胞的分化发育及功能也受到表观遗传学调控.研究从DNA甲基化修饰、组蛋白修饰和非编码RNA,了解近年来很有必要树突状细胞的分化发育及功能的表观遗传学调控机制很有意义.
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非编码RNA及其调控功能的研究进展
过去认为,在生命活动中RNA只是配角,其作用是将遗传信息从DNA传递给蛋白质,而细胞内存在的小分子RNA(后来称之为非编码RNA,non-coding RNA,ncRNA)只不过是一些降解产物;但随着研究的不断深入,RNA生物学功能的多样性以及ncRNA调控功能的重要性得到了深刻认识.
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自闭症谱系障碍与ncRNA基因研究进展
自闭症谱系障碍(autism spectrum disorder,ASD)是一类常见的神经发育疾病,主要表现为社交互动和交流障碍、兴趣狭隘以及重复刻板行为三大核心症状.目前病因学研究认为,ASD是一种复杂的精神疾病,具有高度遗传和病因异质性等特点.越来越多的证据显示,非编码RNA也参与其中.本文综述近十年来非编码RNA基因与ASD关系的研究进展,重点比较ASD研究中microRNA作用,并讨论ncRNA作为潜在生物标志物分子的潜力.
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MicroRNAs研究新进展
MicrpRNAs(miRNAas)是一类长约21～28nt的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)[1].该类RNA普遍存在于生物界,具有高度的保守性.在个体发育过程中,参与基因表达调控,具有"管家"作用.Lin-4与Let-7是目前研究较为清楚的两种MicroRNA.新的MicroRNA的不断发现及其生理功能的精确定位,将会建立一种新的调节性RNAs种类.
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非编码RNA调控离子通道在心血管疾病中的研究进展
非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)是指不能翻译成蛋白的功能性RNA分子,其在心血管疾病的发生发展过程中发挥了极其重要的作用.近年来的研究表明ncRNAs参与调控了多种与心血管疾病相关的离子通道的表达.该文将对目前ncRNAs调控离子通道在心血管疾病中的新研究进展作一综述.
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非编码RNA在DNA损伤应答与修复中的作用
DNA 损伤应答（ DDR ）与修复是细胞维持基因组稳定性的主要机制。越来越多的证据表明许多非编码 RNA （ ncRNA ）在 DDR 与修复中起关键作用，参与 DDR 与修复的ncRNA 包括 miRNA、diRNAs、DDRNAs 及 lncRNA。本文侧重介绍这些 ncRNA 在 ATM／ATR 介导的 DNA 损伤应答信号传导通路及它们在各种 DNA 修复过程，特别是负责双链断裂（ DSB ）修复的同源重组修复（ HR ）及非同源末端连接（ NHEJ ）修复中的作用。接着，总结了参与 DDR与修复的 ncRNA 调控及功能的异常与多种肿瘤发生、发展及预后的相关性，后提出揭示与DDR 相关的 RNA 结合蛋白与其相互作用的 ncRNA 的关系是今后 ncRNA 研究领域的重要方向。
关键词： 非编码RNA DNA损伤应答与修复 RNA结合蛋白 -
非编码RNA在非小细胞肺癌脑转移中的研究进展
近年来越来越多的研究显示非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)在恶性肿瘤的发生发展过程中具有重要作用,其中微小RNA(microRNA,miRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)占有举足轻重的地位.非编码RNA在肺癌中的表达情况,以及其用于肺癌诊断、预后及治疗的价值已经在大量的研究中有过报道,近,非编码RNA在脑转移瘤发展中的作用也得到了确定.非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是肺癌常见的亚型,而脑转移是导致NSCLC常见的死因,目前对于NSCLC脑转移瘤的诊治仍很困难.本综述总结了非编码RNA在NSCLC脑转移过程中的研究进展.
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环形RNA在疾病中的研究进展
环形RNA(circular RNA,circRNA)是由前体RNA的3'末端和5'末端首尾相连形成的环状非编码RNA,可竞争内源性RNA,调节基因的表达.环形RNA在发现之初,被认为是由于错误剪接产生的,未引起重视,随着RNA测序和生物信息等技术的发展,大量的环形RNA被发现,并逐渐成为非编码RNA的研究热点.虽然目前对其功能了解甚少,但已有的研究表明环形RNA可以对基因转录后进行调控.本文将从环形RNA的发现过程、形成机制、生物学功能、与疾病的关系以及研究中存在的问题进行综述,有助于进一步研究中心法则,同时为疾病诊治提供新的方向.
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非编码RNA诱导的表观遗传学与肿瘤的发生
ncRNA可以通过多种遗传机理调控DNA的结构、RNA的表达和稳定性以及蛋白质的翻译和功能,近研究证实小RNA可以通过指导基因组表现修饰DNA甲基化和组蛋白修饰引起癌遗传学途径基因失能与获能,增加基因组不稳定,印记丢失等途径参与肿瘤的发生发展.探索ncRNA对肿瘤细胞中基因的异常表达的影响和作用有助于将癌基因组学与表观遗传学的研究结合起来.为研发防治肿瘤的新方法和新途径提供新的思路.
