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  • 湖南药用植物菝葜种质资源亲缘关系研究

    作者:仇萍;盛孝邦;彭琦;魏然;刘春林;黄宇明;张光贤;宋思才

    目的:探讨湖南药用植物菝葜种质资源的亲缘关系.方法:以湖南金刚藤主产区的15个菝葜材料为研究对象,用RAPD技术对其进行亲缘关系分析.在建立适合菝葜植物的PCR-RAPD反应体系的基础上,从45个随机引物(10 mer)中筛选出14条,对所有供试材料进行正式扩增,共获得14张DNA指纹图谱,144条DNA谱带,其中有135条为多态带.建立了基于RAPD的菝葜植物亲缘关系树形图.结果:成功地将湖南金刚藤主产区的菝葜植物划分为明山类、会同类、靖州类、雪峰山类和鸡公界类的菝葜归为会雪类、靖鸡类和明山类.会雪类与靖鸡类与明山菝葜相比较,会雪类与靖鸡类的亲缘关系又较近.结论:本研究揭示了湖南省不同菝葜类型之间亲缘关系,这个研究结果是国内外首次对湖南不同菝葜类型之间亲缘关系的报道.

  • 大肠埃希菌耐药性变化及其DNA多态性分析

    作者:何晓锋;曹晋桂;张虎;马文杰;王敏;吴镝;焦力群

    目的 了解某院2001-2005年大肠埃希菌耐药性变化趋势并对其DNA多态性进行分析.方法 采用VITEK全自动微生物鉴定仪对大肠埃希菌临床分离株进行鉴定;Kirby-bauer(K-B)法进行药敏试验;对分离菌株中的10株敏感株和10株耐药株进行随机引物聚合酶链反应(PCR)扩增.结果 大肠埃希菌对除亚胺培南、阿莫西林/克拉维酸以外的其他抗菌药物敏感率均呈下降趋势.10株敏感菌呈9种基因型;10株耐药菌仅呈3种基因型,其中6株菌为同一谱型.结论 大肠埃希菌对常用抗菌药物耐药率高,耐药范围广,并且其耐药表型与其基因型之间具有一定的相关性.

  • 药材玉竹RAPD反应体系的优化

    作者:林丽美;刘塔斯;龚力民;吴泽宇;胡胜全

    目的 寻找玉竹的佳RAPD反应体系,保证实验结果的稳定可靠性.方法 采用单因素多水平的梯度实验和正交设计实验相结合,对两种不同实验方法所得结果进行分析.结果 确定了适合于玉竹的佳RAPD反应体系.结论 优化的RAPD反应体系是保证实验结果稳定可靠的重要因素之一.

    关键词: 玉竹 RAPD
  • ICU机械通气性鲍曼氏不动杆菌感染的同源性分析

    作者:赵颜忠;周建党

    目的:了解鲍曼氏不动杆菌引起机械通气性肺炎主要克隆株及流行状况.方法:运用随机引物扩增PCR(RAPD)技术对32株鲍曼氏不动杆菌进行指纹图谱与聚类分析.结果:32株鲍曼氏不动杆菌经RAPD分为5个基因型,Ⅰ至Ⅴ型分别占16株、1株、2株、4株和9株.结论:鲍曼氏不动杆菌在医院内存在克隆传播,Ⅰ型与Ⅴ型鲍曼氏不动杆菌是我院ICU病房机械通气性肺炎的主要基因型,临床应加强对这2型鲍曼氏不动杆菌的监控,以防止院内感染与爆发流行.

  • 百合种质资源间亲缘关系及RAPD指纹图谱分析

    作者:童巧珍;周日宝;刘湘丹;盛孝邦;王朝晖

    目的 探讨百合种质资源间亲缘关系的遗传多样性.方法 利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)分子标记技术进行遗传多样性研究.结果 35条随机引物用于PCR扩增,共得到769个扩增住点,628个住点具有多态性,占81.7%,其中江苏省引种栽培的2个农家品系(尖头系扣平头系)种源之间的遗传变异小,湖南衡山野外的大百合和甘肃引种的细叶百合种源之间遗传变异大:根据RAPD标记划分16个百合种源在阈值为0.940 7时分为2个RAPD群,即分别属于百合科的百合属和大百合属;阈值为0.579 0时,百合属分为3个种,即分别为百合、卷丹和细叶百合.结论 分子标记可用于百合种质资源的分类、真伪鉴定、选育良种.

  • 4种肺经草的RAPD分析

    作者:刘富林;郭纯;周小江;刘春林;毕巍娜

    目的 探索民间民族药肺经草的鉴定新方法.方法 用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对4种肺经草进行基因组DNA多态性分析,并构建聚类树状图.结果 4种肺经草品种中,薄片变豆莱与天蓝变豆菜、软雀花与变豆菜分别聚为一类.结论 从分子水平上为肺经草的品质评价提供科学依据.

    关键词: 肺经草 RAPD 聚类分析
  • 药用百合DNA提取和RAPD条件的优化

    作者:童巧珍;盛孝邦;刘湘丹;周日宝;吴佳

    目的 确定药用百合佳随机扩增多态DNA(RAPD)分析方法 .方法 以药用百合新鲜鳞叶为材料,研究DNA的提取方法 ,并对影响RAPD反应的各因素进行优化.结果 药用百合RAPD反应体系及程序为:在40 μL反应体系中,含40 ng模板DNA,0.3 μmol/L随机引物,0.2 mmol/L dNTPs,1.7 mmol/L Mg2+,3 μL 10×PCRBuffer,1.5 U Taq酶;扩增程序为:第一步94℃预变性2 min,第二步94℃变性1 min,第三步36℃退火45s,第四步72℃延伸90s.返回至第二步重复40个循环,第六步72℃延伸10 min,后4℃保存以备电泳.结论 建立了药用百合RAPD的优化反应体系及程序.

  • 珠海横琴岛嗜人按蚊的生态习性调查及其与陆地嗜人按蚊基因组DNA的RAPD分析

    作者:阮峰;陈晓光;谭爱军;潘波;吴军;朱泰华

    目的:了解横琴岛嗜人按蚊生态学特性以及与陆地嗜人按蚊基因组DNA的差异.方法:生态学调查以及统计学方法研究嗜人按蚊生态学习性;用RAPD-PCR的方法,比较横琴岛嗜人按蚊与陆地嗜人按蚊基因组DNA的差异.结果:横琴岛嗜人按蚊吸人血又吸牛血,但更嗜人血;通宵都有吸血活动,凌晨1~3点是吸血高峰;吸了牛血的嗜人按蚊偏野栖.结论:横琴岛嗜人按蚊与陆地嗜人按蚊基因组DNA有较大差异.

  • RAPD技术在肠炎沙门氏菌同源性分析中的应用

    作者:邓志爱;李孝权;李钏华;张欣强;柴巧学;莫自耀

    目的研究2004年广州市3起肠炎沙门氏菌食源性疾病分离的20株菌株和来源于从业人员健康体检的18株肠炎沙门氏菌的分子特征,为肠炎沙门氏菌食源性疾病的流行病学溯源和疫情控制提供有效手段.方法采用随机引物扩增多态性DNA分析(randomly amplified polymorphic DNA analysis,RAPD)对38株肠炎沙门氏菌进行分子分型,结合SPSS软件构建以上菌株的带型关系系统树状图,对菌株进行基因多态性分析.结果38株肠炎沙门氏菌的RAPD结果经聚类分析可分为3个聚类群,分属3个不同的克隆.结论RAPD技术可用于肠炎沙门氏菌食源性疾病的流行病学调查和溯源.

  • 对约氏疟原虫不同易感性的大劣按蚊和斯氏按蚊基因组RAPD序列比较

    作者:孙恩涛;张锡林;秦志辉

    目的 分析对约氏疟原虫不易感的大劣按蚊和易感的斯氏按蚊基因组RAPD谱带并测序,探讨媒介按蚊基因型与疟原虫基因型间的相互关系.方法 用已筛选的一条随机引物,随机扩增大劣按蚊和斯氏按蚊成蚊的基因组DNA,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳后,对相同迁移率的DNA条带克隆、测序,并采用相关在线程序及软件进行序列比较分析.结果 大劣按蚊和斯氏按蚊RAPD谱带具有明显的种间差异,但有4对相同迁移率的条带.序列分析显示4对DNA条带在序列长度和组成上呈现多态性,序列的GC含量和简单重复序列存在差异,序列相似性介于48%~52%之间.结论 大劣按蚊和斯氏按蚊之间存在不同的遗传背景,其基因多态性可能与产生对约氏疟原虫的易感性不同有关,为进一步研究按蚊与疟原虫之间的相互作用奠定了基础.

  • 山东同一种植基地不同形态栝楼的遗传多样性和亲缘关系研究

    作者:宋艳梅;李健;李峰

    目的:探讨山东同一种植基地不同形态栝楼的遗传多样性和亲缘关系.方法:用8对随机引物对同一种植基地原植株形态具有明显差异的栝楼进行RAPD分析.采用Biosens Gel Imaging System软件对RAPD扩增条带进行检测,并绘制指纹图谱.以NTSYS-pc软件系统计算7个样品的遗传相似系数,进行聚类分析.结果:8对引物共扩增出56条带,32条多态性条带.7个栝楼样品之间RAPD条带多态性高,遗传多样性丰富.聚类图显示不同样品间的亲缘关系具有一定的差异.结论:同一种植基地的栝楼具有相似的遗传物质基础,但也存在明显的个体差异.

  • 通关藤及其混淆品的RAPD鉴别研究

    作者:张慧;裴志东;倪冲;康廷国

    目的:应用RAPD技术鉴别通关藤及其混淆品,并分析同种不同产地通关藤基因同源性.方法:CTAB法提取7个不同产地的通关藤及其6种混淆品的DNA,以20条随机引物进行非特异扩增.结果:随机引物285( GGG AAC CCG T)可稳定扩增不同产地通关藤药材的DNA,随机引物E01 (CCC AAG GTC C)可有效的鉴别通关藤及其混淆品.结论:RAPD法可准确鉴别正品通关藤及其混淆品,不同产地通关藤的基因具有同源性.

  • RAPD法鉴别几种益母草属生药

    作者:张国梅;徐腾;王晖

    目的:尝试用RAPD法对几种来源于益母草属植物的生药进行鉴别.方法:用CTAB法提取材料基因组DNA;选取50种随机引物,进行聚合酶链式反应.结果:从5种近期采集材料中成功获得质量较高的基因组DNA;近10条引物扩增出多态性条带;其中,S1145(TGGAAGCAGG)的图谱显示出良好的多态性,且比较稳定,重现性较好.结论:用RAPD法可成功鉴别益母草类生药.

    关键词: 益母草 RAPD
  • 文山野生金线莲的RAPD鉴别

    作者:张铁;李洪超;刘伟

    目的:对金线莲DNA分子标记进行研究.方法:以文山地区药用金线莲原植物滇越金线兰及3种叶面特征不同的花叶开唇兰为材料提取基因组DNA,选择适合的随机引物和PCR反应体系,扩增分析金线莲的带谱.结果:16条引物共得到108条带谱,其中有95条多态性谱带,多态百分比为87.96%,且4种材料都具特异性条带.结论:实验材料之间遗传差异性较大,花叶开唇兰可能已经形成了新的变型或变种.获得的特异性条带可用于区分干燥的金线莲药材.

    关键词: 文山 金线莲 鉴别 RAPD
  • 绞股蓝的RAPD指纹图谱鉴定及其特异DNA片段克隆、序列分析

    作者:蒋军富;李雄英;吴耀生;罗育;赵瑞强;蓝秀万

    目的:在DNA分子水平上鉴定绞股蓝及其伪品乌蔹莓.方法:用筛选出的两条随机引物(WGS001,WGS004)对不同采集地绞股蓝及乌蔹莓基因组DNA进行PCR扩增,将引物WGS004扩增7份绞股蓝样品中的具有相同迁移率的1条500 bp左右的DNA片段进行克隆、测序、一致性分析,并在NCBI上作Blastn比对检索.结果:以上两条引物能分别扩增得到绞股蓝与乌蔹莓样品基因组的差异性DNA片段,这些片段可以明确区别绞股蓝与乌蔹莓.经克隆获得的7条绞股蓝DNA序列间的一致性在45.7%~94.5%之间,在NCBI上检索后未见相似序列的报道,为新序列.结论:RAPD技术可有效地鉴别绞股蓝和乌蔹莓,本研究克隆得到一段绞股蓝DNA序列,为绞股蓝的品种鉴定、辅助选择育种等研究奠定了基础.

  • RAPD技术分析积雪草的分子标记特征

    作者:阮元;莫荣浩;李敏;黄浏清;罗育;李雄英;周娟;吴耀生

    目的:采用RAPD技术,对积雪草DNA分子标记进行研究.方法:以不同来源的积雪草为样本提取基因组DNA,通过优化PCR反应体系,选择适合的随机引物,扩增分析积雪草的特征条带.结果:经优化反应体系扩增,获得不同来源及不同生长环境的积雪草特异的种群条带,具有高度稳定的遗传特征.积雪草的种群特征带与绞股蓝、烟草、乌蔹莓等其他不同科属的植物有明显的区别.结论:所建立的RAPD分析方法扩增不同来源的积雪草显示高度的均一性,可用于积雪草真品和混淆品的鉴别.

  • 应用RAPD技术分析市售海风藤

    作者:刘艳菊;陈家春;李吉莹;白杨

    目的:寻求分子水平分析海风藤与山蒟的鉴别方法.方法:采用RAPD技术进行PcR扩增,筛选随机引物.结果:筛选出10条扩增效果好的引物.结论:通过对扩增DNA图谱进行多态性分析,结果表明海风藤之间有丰富的遗传多样性,相似性分析结果表明,山蒟与海风藤之间的相似系数较小,遗传差异较大.

    关键词: RAPD 海风藤 山蒟
  • 中药材厚朴的随机扩增多态性DNA指纹图谱研究

    作者:刘文生;朱建明;何斌;苏应娟

    目的:鉴别中药材厚朴及其伪品、混淆品.方法:采用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)技术扩增植物基因组DNA样品.结果:此种分子生物学鉴别方法可以获得清晰可靠的DNA指纹图谱,根据琼脂糖凝胶上显示的DNA带型差异可准确区分出厚朴、凹叶厚朴和其伪品、混淆品.结论:RAPD方法可以准确、快速、简便地鉴定中药材厚朴及其伪、混品,尤其在正确引种方面具有很高的价值.

    关键词: 中药材 厚朴 RAPD
  • 两种药用石斛RAPD反应的实验简报

    作者:王爱民;季申

    从20种随机引物中筛选出:对美花石斛(Dendrobium loddigesii)和束花石斛(D.chrysanthum)扩增具有较明显多态性的3种引物,其中S12扩增差异性为显著.

  • 阳春砂与几种常见姜科伪充品的RAPD分析

    作者:王培训;黄丰;周联;曹柳英;梁瑞燕;徐鸿华;刘军民

    本文采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术研究了姜科植物几种常见的中药材.结果显示,扩增结果具有良好的分辨性.阳春砂与海南砂、绿壳砂、缩砂、草果、益智仁、白豆蔻、草豆蔻等常见的姜科近缘伪充品之间呈现明显指纹差异,呈现多态性的引物占所选的12.17%,根据这些多态性可进行鉴别.不同产地的阳春砂RAPD指纹基本一致.用NJ方法构建了分子系统树,揭示阳春砂与绿壳砂、海南砂亲缘关系较近,而与草豆蔻、草果等关系较远,此结果与传统的分类方法基本一致.

    关键词: 阳春砂 RAPD
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