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万博节皮菌感染引起的头皮脓癣1例
脓癣是相对少见的儿童皮肤癣菌感染,主要由亲动物性或亲人性的小孢子菌属和毛癣菌属感染,如犬小孢子菌、石膏样小孢子菌、须癣毛癣菌、断发毛癣菌等[1-3],此类皮肤癣菌感染可引起宿主强烈变态反应,主要表现为头皮脱发和毛囊性脓疱,可融合成痈状脓肿,愈合后可形成瘢痕及永久性脱发,严重影响患儿的身心健康.我们报告1例由患体癣的宠物兔引起的儿童脓癣,并进行菌种分型鉴定及临床诊治,随访.
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分子标记技术在铁皮石斛中的应用
兰科石斛属植物铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo),国家濒危珍惜中药材,具有卓越的药用价值.该文在系统的文献调研基础上,首次对分子标记技术在铁皮石斛中的应用进行了归纳与总结.据统计,自2000年以后,该植物中分子标记技术的应用报道主要集中于RAPD/SSR/ISSR/ETS/SNP等标记技术.上述技术在铁皮石斛种质鉴定和亲缘关系分析中有重要应用,对深入研究铁皮石斛有重要意义.通过文章的总结,期望使该技术能被更好地研究与利用.
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新疆产中药肉苁蓉的RAPD分析
通过19个10碱基随机引物对新疆中药肉苁蓉(Cistanche)3个不同种进行PCR扩增,用人工栽培品种作为对照,共扩增出153个多态位点,建立了它们的基因组DNA指纹图谱.通过计算遗传相似性系数,建立UPGMA聚类图.结果表明:不同种之间存在一定差异,但差异不大;人工栽培种与同一产地野生种之间基因图谱完全一致,具有相似的遗传特性.
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金钗石斛及其相似种RAPD优化和DNA多态性分析
目的:以金钗石斛为材料,建立石斛的RAPD优化条件,应用于石斛相似种的DNA多态性分析.方法:分别设置模板DNA,Mg2+,Taq DNA聚合酶,dNTPs,引物的浓度梯度,优化RAPD反应体系.结果:在25 μl总反应体系中,以上反应物的用量分别为100 ng,3.0 mmol/L,1.0 U,0.2 mmol/L,0.4 μmol/L时所获得的石斛属DNA指纹图谱谱带型清晰、重复性好.其中用S48 扩增的DNA指纹图谱具有更大的相似性,适合于石斛真伪鉴别;而S90 扩增的片段具有明显的多态性,适合于石斛遗传分化研究.结论:优化后的RAPD方法可作为研究石斛属植物的遗传多样性及真伪鉴别的有效方法.
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RAPD分析野生和栽培柴胡亲缘关系
目的 探讨不同居群北柴胡及其近缘种狭叶柴胡、大叶柴胡亲缘关系,对其进行分子标记鉴定.方法 采用RAPD技术对柴胡属3个栽培类型和4个野生居群进行亲缘关系分析.DPS v7.05软件计算Jaccard遗传距离,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树系图.结果 7条随机引物共扩增出71条DNA片段,其中91.5％的扩增条带表现出多态性,遗传距离在0.230 8～0.975 6.聚类分析结果表明利用RAPD技术可将全部供试材料区分开.结论 柴胡属种质资源在分子水平上存在较大差异.RAPD分子标记法可以鉴定柴胡属种质资源并揭示其亲缘关系,为药材柴胡的栽培育种及资源保护提供重要参考.
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野生和栽培茅苍术RAPD分析
目的 获取野生与栽培茅苍术差异遗传信息.方法 运用RAPD分子标记方法,从DNA水平上分析野生与栽培茅苍术的遗传变异.结果 筛选了60个随机引物,从中选取18个多态性强、重复性好的引物进行扩增,共检测到228个位点,110个多态性位点,多态位点比率为48.25％;野生与栽培茅苍术的遗传距离为0.32.结论 野生和栽培茅苍术基因组DNA存在显著差异,研究工作为茅苍术优良种质资源鉴定和可持续利用提供科学依据.
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不同产地泽泻RAPD分析
目的 为获取不同产地泽泻差异遗传信息提供基础和科学依据.方法 运用RAPD分子标记方法 ,从DNA水平上分析福建、江西、四川产泽泻的遗传多样性.结果 筛选了80个随机引物,从中选取28个多态性强、重复性好的引物进行扩增,共检测到269个位点,171个多态性位点,多态位点比率为63.6%;泽泻种内遗传物质差异远小于种间差异.结论 不同产地泽泻具有较高的遗传多样性,RAPD分子标记方法 可以用来鉴定不同产地的泽泻.
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大鼠不同脑区基因组DNA的RAPD分子标记
目的比较3月龄SD大鼠不同脑区(皮层、海马、纹状体、下丘脑、小脑)基因组DNA多态性.方法 RAPD-PCR技术分析脑DNA多态性图谱.结果脑不同区域RAPD标记不尽相同,即纹状体、下丘脑为1543、1269、994、472、377 bp 5条条带,海马仅377 bp 1条条带,皮层为1543、1269、994、472 bp 4条条带,小脑为1269、994、377 bp 3条条带.结论脑不同区域存在DNA多态性,这可能反映出大鼠不同脑区基因组DNA的差异,并构成各脑区保持相对独立功能的结构基础.
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浙江绍兴地区洋葱伯克霍尔德菌的基因分型及其耐药性
目的 分析浙江省绍兴地区洋葱伯克霍尔德菌(BC)的基因型及其耐药情况.方法 对临床分离的80株BC复合群进行特异性引物PCR鉴定及huA基因测序确认;应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对确认的菌株进行基因分型,分析菌株间的同源性.对各型菌株行药敏试验.结果 80株BC复合群recA基因PCR扩增全部阳性,经hisA基因测序确认BC复合群可分为6个菌种,其中主要的是BC,占85.0％(68株).RAPD技术将68株BC分为4个型别,A型45株,占72.6％,D型10株,C型和B型分别为5株和2株.药敏试验显示:A型和D型BC对青霉素类、头孢一至三代、氨基糖苷类和亚胺培南的50％抑菌浓度(MIC50)和90％抑菌浓度(MIC90)均较高,耐药率均≥80.0％,但本地区主要流行菌株(A型)对左氧氟沙星和甲氧苄啶臌胺甲噁唑具有较好的敏感性,耐药率为24.4％和28.9％.结论 绍兴地区BC的基因型以A型为主,左氧氟沙星和甲氧苄啶/磺胺甲噁唑可作为临床治疗BC感染的首选用药.
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青阳参及其近缘种的RAPD研究
目的 针对青阳参Cynanchum otophyllum Schneid.存在混淆种类和种内变异较大的情况,对青阳参和与其相混淆的隔山消C. wilfordii(Maxim.)Hemsl.和昆明杯冠藤C. wallichiiWight进行种间鉴别,并对青阳参的4个居群进行遗传多样性分析.方法 运用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术进行分析,用Shannon指数和Nei指数评价青阳参的遗传多样性,用UPGMA类平均法进行聚类分析亲缘关系.结果 利用筛选出的10个随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,共得到72条带,其中多态性带有70条,多态性百分率为97.22%.由Shannon指数计算青阳参4个居群内的遗传多样性比率为68.52%,高于居群间的31.48%;同时由Nei指数估计青阳参4个居群中有69.44%的遗传变异来自居群内,高于居群间的30.56%.采用UPGMA聚类法得出反映各种间亲缘关系的树状图.结论 运用RAPD方法 可以进行青阳参和隔山消两个种同昆明杯冠藤的种间鉴别;虽然居群间已有较高分化,但青阳参遗传变异主要分布在居群内.
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四种不同产地白术的DNA随机扩增多态性研究
[目的]分析不同产地白术的遗传多样性，为白术的种质鉴定提供依据。[方法]运用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术，分析浙江、湖北、安徽、河南产白术的遗传多样性，利用PopGen32软件计算遗传距离，运用UPGMA法进行聚类分析并构建树状图。[结果]共筛选了70个随机引物，从中挑选出14条多态性强、重复性好的引物，总共检测出215个位点，多态性位点138个，多态位点比率为64.2％，UPGMA聚类可以将不同来源的白术很好地区分开来。[结论]不同产地间的白术存在丰富的遗传多样性，RAPD分子标记方法可以用来鉴定不同产地的白术。
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三七花粉流的初步研究
目的 研究三七花粉流扩散趋势.方法 利用随机扩增多态性DNA(RAPD)的方法,对拟定父本和随机挑选母本的子代进行亲本分析.结果 拟定父本植株花粉在距其1.5 m同心圆上的密度为50.9％,在距其3m同心圆上的密度为31.3％,在距其4.5 m同心圆上的密度为24.9％.结论 三七花粉的传播距离应≥4.5m.
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半夏与其伪品掌叶半夏的RAPD鉴别
目的建立半夏及其伪品掌叶半夏的快速简单的分子鉴定方法.方法 SDS法提取半夏和掌叶半夏的基因组DNA,20个10碱基随机引物(S1-S20,上海生工)用于RAPD-PCR分析.结果 20个引物中有7个有效稳定的引物在半夏和掌叶半夏之间能显示出多态性指纹图谱,其中Si0和S17在半夏和掌叶半夏之间显示较大差异.结论 利用引物S10和S17进行RAPD-PCR能有效鉴别半夏和掌叶半夏.
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半夏基因组DNA的提取及鉴定
目的探讨不同DNA提取方法对半夏DNA质量及RAPD-PCR标记结果的影响.方法对用不同方法提取的DNA进行电泳、紫外吸收A260/A280和RAPD-PCR分析.结果不同方法提取的DNA质量和产率差异不显著,对RAPD结果无影响.结论半夏在DNA提取前加入氯仿对材料预处理,可获得较高质量的DNA进行PCR扩增.
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文山三七栽培群体变异类型的分子鉴定
目的了解三七栽培群体的遗传背景及变异情况,为三七育种提供依据.方法采用RAPD方法分析三七栽培群体的NDA变化.结果从160个10bp的寡核苷酸引物中筛选出8个条带清晰、重复性好的特异性引物对三七栽培群体中的七个变异类型共34个样品进行了PCR扩增,共扩增出了49条带,其中多态性条带37条,变异类型之间的多态性差异达75.5%,同一类型不同个体间的多态性差异为75.2%,结论三七栽培群体从遗传背景来看还是一个杂合群体,具有丰富的遗传多样性.
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用RAPD技术对安徽省三地钉螺遗传差异的初步研究
目的 采用随机扩增多态性技术(RAPD)研究安徽省3个代表性地区的钉螺的遗传多样性.方法 提取钉螺足部的基因组DNA,用随机引物进行扩增,扩增产物经8%的聚丙烯酰胺凝胶电泳,0.6%硝酸银染色.根据扩增结果,计算不同地域株钉螺的遗传距离,并聚类分析.结果 三个地区钉螺标本的PCR扩增产物均呈现多态性.经聚类分析,其中广德钉螺与宁国钉螺关系近,可归为一类,而贵池钉螺则单为一类.结论 安徽省三个有代表性区域的钉螺存在一定的亲缘关系,但种内发生了遗传变异,血吸虫病不易感区和有螺无病区的螺群遗传距离接近,两地钉螺的遗传相似系数与钉螺的易感性相一致.但对于不易感和有螺无病区的钉螺是否与易感区的钉螺在遗传学上产生较特异的变化,还将通过分子生物学方法进一步研究.
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随机扩增多态性DNA技术对我国大陆光壳钉螺遗传多样性的初步探讨
目的探索随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对大陆光壳钉螺遗传多态性研究的可行性,以获得不同地区光壳钉螺基因组DNA水平上的差异信息.方法随机引物对大陆光壳钉螺基因组DNA进行PCR扩增,产物经8%聚丙烯酰胺凝胶电泳、0.6%的硝酸银染色,记录结果并分析.结果2条引物S15(5'CATGCAGGCG3')、S18(5'ACAGCCTGCT3')在螺群间显示出多样性,并且扩增结果稳定可重复.对9个地区钉螺共扩增出82个条带,19.51%的条带为9个地区螺群所共有.S15扩增结果中,云南和四川的螺群在770 bp、390 bp处均有特异性条带产生,另外四川在570 bp处产生其它螺群均没有的条带.S18的扩增产物中,福建福清的钉螺400bp以下无条带产生.云南和四川的螺群分别在380 bp与400bp处产生特异性条带,在750 bp处产生共有的特异性条带.而江苏东台和福建福清的钉螺在950bp处产生其他地区的钉螺所没有的特异性条带.这些特异性的条带和特征在同一采集点个体间可以重复.结论RAPD技术可为钉螺的遗传变异分析研究提供分子水平上的信息.我国各地光壳钉螺间存在较大的遗传变异,其变异程度和钉螺采集地的地理分布有一定的关系.
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应用RAPD技术对我国11个地域株并殖吸虫遗传变异的初步探讨
目的 对来自中国3省9地11个地域株并殖吸虫进行遗传变异研究,明确它们的亲缘关系,为并殖吸虫的分类提供依据,尤其为湖北省并殖吸虫流行区划分提供分子生物学依据;探讨采用不同虫期标本及其不同保存方法 对该研究的影响.方法 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对11个地域株并殖吸虫进行PCR扩增,根据扩增产物琼脂糖凝胶电泳的带型,计算各株并殖吸虫的遗传距离,并绘制系统进化树.结果 RAPD技术将11个地域株并殖吸虫分为3类:①江西武宁、浙江兰亭、湖北温泉和湖北赤壁;②湖北走马(a)、湖北走马(b)、湖北五峰(a)、湖北五峰(b)、湖北十堰和湖北五里;③湖北神农架.结论 11个地域株并殖吸虫在基因水平上存在差异,其中有种间和种内差异.我国湖北、江西和浙江3省存在3种并殖吸虫:卫氏并殖吸虫、斯氏并殖吸虫和一种尚未定种的神农架并殖吸虫;湖北存在除卫氏、斯氏并殖吸虫外不明种的神农架并殖吸虫.采用不同虫期(成虫和囊蚴)标本及其不同保存方法 不影响遗传变异研究的结果 .
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卫氏并殖吸虫致病品系PCR-RAPD分子标记的初步研究
目的探讨卫氏并殖吸虫致病品系PCR-RAPD分子标记.方法应用随机扩增多态DNA(PCR-RAPD)技术,对浙江宁海小汀、宁海西溪、遂昌、临安等地卫氏并殖吸虫囊蚴进行遗传变异研究.结果通过8条寡核苷酸随机引物扩增,B17-1600bp为浙江宁海小汀肺吸虫种群特异性DNA片段,A9-680bp为浙江宁海西溪,遂昌、临安三地肺吸虫种群共有特异性DNA片段.结论结果提示B17-1600bp,A9-680bp可作为卫氏并殖吸虫不同致病品系的分子标记.
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用RAPD技术对湖北大口等3地的钉螺遗传差异初探
目的 对3个不同地点的湖北钉螺的遗传差异进行研究.方法 采用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)技术,对湖北省三个不同地域的钉螺进行PCR扩增,根据DNA扩增产物的琼脂糖凝胶电泳结果,计算湖北钉螺之间的遗传距离,绘制系统进化树,并结合形态学观察,生态环境调查,综合分析得出结论.结果 不同地点湖北钉螺标本PCR 扩增产物均呈多态性,钟祥市的大口与冷水距离很近,但两地的钉螺遗传距离大于远安县与钟祥市钉螺的遗传距离.大口林场的钉螺壳顶磨损明显.结论 生态环境对遗传变异的影响较大,地理距离与遗传距离不成正比.
