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DNA修复基因XRCC1和XPC多态性与胰腺癌风险关联研究
目的 探讨碱基切除修复相关基因XRCC1及核酸切除修复基因XPC基因多态与胰腺癌发病风险的关系.方法 采用病例-对照研究(胰腺癌新发病例101人,对照337人)方法,分析XRCC1 Arg399Gln、Arg194Trp及XPC第9内含子的AT双核苷酸的插入/缺失(PAT)多态与胰腺癌风险的关系.结果 经年龄、性别及吸烟、饮酒状态调整后,携带XRCC1 399Arg/Gln及Gln/Gln基因型的个体较399Arg/Arg者发生胰腺癌的风险有所降低,OR值分别为0.83(95%CI,0.52～1.34,P=0.41)和0.64(95%CI,0.21～1.66,P=0.30),但没有达到统计学显著水平.携带PAT+/+基因型者发生胰腺癌的风险为XPC/PAT-/-基因型者的0.30倍(95%CI,0.10～0.76,P=0.02).结论 XPC-PAT多态可能在胰腺癌的发生中起着一定的作用.
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DNA修复基因XPC poly(AT)多态与食管癌遗传易感性的研究
目的 探讨DNA修复基因XPC-PAT多态与食管癌遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照分子流行病学方法,分析了182例食管癌患者和375例正常对照的XPC-PAT基因型分布,比较不同基因型与食管癌风险的关系.结果 多因素回归分析表明,与LS和SS基因型比较,LL基因型与食管癌风险增高相关(校正OR 1.43;95% CI 1.01-2.02).性别分析表明,LL基因型与食管癌风险的关系主要表现在男性(校正OR 1.54,95% CI 1.02-2.32).年龄分析表明,LL基因型增加食管癌风险主要见于＞55岁的人群(校正OR 2.10,95% CI 1.27-3.47).该基因多态与吸烟状态及吸烟量无联合作用.结论 DNA修复基因XPC-PAT多态与食管癌风险相关.
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DNA修复基因XPC-PAT遗传多态与结直肠癌风险的临床分析
目的 研究DNA修复基因XPC-PAT多态与结直肠癌易感性的关系.方法 采用病例-对照分子流行病学方法,分析120例结直肠癌患者和150例正常人XPC基因型分布,并比较不同基因型与结直肠癌风险的关系.结果 正常人群中LL、LS和SS基因型频率分别为12.0%、47.3%和40.7%,而在结直癌患者中分别为5.8%、38.4%和58.8%.肿瘤患者中LL基因型的频率明显低于正常人(P=0.03).与SS基因型相比,携带LL基因型个体患结直肠癌的风险降低了2.5倍(OR 0.40,95%CI=0.18～0.99).结论 DNA修复基因XPC-PAT遗传多态与中国人结直肠癌风险相关.
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DNA修复基因XPD XPC XRCC4基因多态性与结直肠癌易感性的关联性研究
目的:探讨DNA修复基因XPD rs13181(codon751A/C,Lys751Gln)、rs238406(codon156C/A,Arg156Arg)、XPC rs2279017(i11C/A)和XRCC4 rs3734091(codon247T/C,Ala247Ser)的单核苷酸多态性与结直肠癌易感性的关系.方法:采用TaqMan技术对2013年4月至2016年1月北京肿瘤医院收治的338例结直肠癌患者(病例组)和315例健康者(对照组)进行多态位点基因型的检测.结果:XPD rs13181基因型GT和等位基因G增加个体结直肠癌的发病风险(GT>TT,adjusted OR=1.69,95%CI:1.15~2.47,P=0.007;G>T,adjusted OR=1.77,95%CI:1.19~2.64,P=0.005);XRCC4 rs3734091基因型GT和等位基因T增加个体结直肠癌的易感性(GT>GG,adjusted OR=9.02,95%CI:5.61~14.50,P<0.001;T>G,adjusted OR=4.06,95%CI:2.49~6.61,P<0.001);XPD rs13181和rs238406的单倍体型GT显著降低结直肠癌的发病风险(adjusted OR=0.39,95%CI:0.18~0.85,P=0.018).XPCrs2279017等位基因G和XRCC4 rs3734091等位基因T的联合效应(adjusted OR=28.43,95%CI:6.85~117.95,P<0.001)以及XPD rs13181等位基因G和XRCC4 rs3734091等位基因T的联合效应(adjusted OR=10.24,95%CI:4.69~22.35,P<0.001)显著增加个体结直肠癌的易感性.结论:XPD rs13181和XRCC4 rs3734091位点的多态性与结直肠癌的易感性相关.
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DNA修复基因XPC poly(AT)多态与食管癌遗传易感性
核苷酸切除修复(nucleotide excision repair, NER)是人类细胞重要的DNA损伤修复机制之一,XPC是核苷酸切除修复系统的重要成分[1].食管癌是我国常见的恶性肿瘤之一,其发生和发展与多种环境致癌因素尤其是暴露于DNA损伤物质相关.XPC在核苷酸切除修复过程中起重要作用,该基因多态可能与食管癌易感性有关.我们进行了有182例食管癌病人和375个正常对照的病例-对照研究,以探讨XPC多态对食管癌风险的影响.
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四川汉族人群着色性干皮病C基因多态性
目的:了解四川汉族人群XPC-A2920C和XPC-PAT基因多态性,并与其他地区和国家进行比较.方法:实验于2006-05/10在泸州医学院分子生物学实验室完成.采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性方法检测四川泸州地区208例健康无血缘关系个体XPC-A2920C和XPC-PAT位点基因型和单倍型频率分布.应用x2检验分析两位点基因型在四川汉族人群中的分布与其他人群的分布是否有差异,以P《0.05为有统计学意义,SHEsis软件进行连锁不平衡和单倍型分析,以D'》0.5具有连锁不平衡.结果:①A2920C位点检出3种基因型,AA,AC和CC的频率分别为45.7%,43.7%,10.6%.XPC-PAT位点3种基因型PAT-/-,PAT+/-,PAT+/+的频率分别为45.2%,43.7%,11.1%.基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P》0.05),具有群体代表性.②单倍型A PAT-,A PAT+,C PAT一,C PAT+频率分别为65.6%,1.9%,1.4%,31.1%.两位点存在连锁不平衡(D'=0.958).③A2920C基因型频率分布与日本、韩国人群比较有统计学意义(AA:45.7%,12.2%,34.8%;AC:43.7%,45.0%,51.5%;CC:10.6%,42.8%,13.7%;P均《0.01).XPC-PAT基因型频率分布与美国、西班牙人群比较有统计学意义(PAT-/-:45.2%,34.4%,30.6%;PAT+/-:43.7%,49.4%,48.7%;PAT+/+:11.1%,16.2%,20.6%;P《0.05).结论:A2920C和PAT多态性均检出3种基因型,其多态性分布存在种族和地区差异.
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XPC、XPD、XPG基因多态与膀胱癌及其病理参数的相关性研究
目的:探讨XPC (rs2228000、rs2228001、rs2470352)、XPD(rs13181)、XPG(rs17655)3个基因的5个多态性位点的基因型与膀胱癌及其病理参数的相关性.方法:采用病例对照研究,采用Massarray SNP检测技术对287例膀胱癌患者和282例正常人XPC、XPD、XPG基因的5个基因多态性位点的基因型分布进行分析.采用Logistic回归模型分析各基因型与膀胱癌发病的关系并比较不同基因型与膀胱癌及其病理参数的关系.结果:XPC rs2228000位点在病例及对照组中分布有显著性差异(x2=21.949,P＜0.001),其中CT及TT基因型在病例组中的频率显著高于对照组,差异有统计学意义(CT vs CC:OR=2.01,95％ CI 1.41～2.88;TT vs CC:OR=3.06,95％CI 1.70～5.49);T等位基因携带者在病例组中的分布频率亦高于对照组,差异有统计学意义(CT/TT vs CC:OR=2.16,95％CI 1.58～3.11).rs17655、rs2228000及rs2228001位点的基因型分布频率在不同分化程度的肿瘤中差异有统计学意义(rs17655:x2=10.013,P=0.040;rs2228000:x2=13.836,P=0.008;rs2228001:x2=14.315,P=0.006),rs2228000位点的基因型分布频率与远端转移差异有统计学意义(rs2228000:x2=12.204,P=0.002).结论:XPCrs2228000位点与膀胱癌的发病相关,含T等位基因个体膀胱癌的相对风险高,且与膀胱癌的肿瘤分化程度及淋巴结远端转移相关.rs2228001及XPG rs17655位点的基因多态性与肿瘤的分化程度相关.
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局部晚期宫颈癌细胞中XPC、ERCC1的表达与新辅助化疗疗效的关系
目的:研究局部晚期宫颈癌(LACC)细胞中XPC、ERCC1的表达与宫颈癌新辅助化疗(NACT)敏感性的关系,为临床克服和预示NACT耐受提供研究资料.方法:选取1999年6月至2006年6月间在浙江大学医学院附属妇产科医院住院、临床诊断为Ⅰb2～Ⅱb期的LACC患者77例,用免疫组化Envision二步法显示宫颈癌细胞中XPC和ERCC1的表达水平,并分析其及各种临床和病理参数与疗效的关系.结果:77例患者中有效60例,有效率为77.9%(60/77).XPC和ERCC1蛋白表达免疫组化定位均在细胞核,显示LACC中NACT无效者XPC蛋白的表达强于有效者,差异有显著性(P<0.05);NACT无效者ERCC1蛋白的表达强于有效者,差异有显著性(P<0.01).XPC、ERCC1蛋白表达存在高度一致,两者之间呈正相关(rs=0.418,P<0.01).结论:局部晚期宫颈癌新辅助化疗具有较高的临床应用价值;XPC和ERCC1异常表达参与了局部晚期宫颈癌铂类耐受过程,异常上调表达的XPC和ERCC1蛋白可导致对铂类为基础NACT的耐受.
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实时荧光定量PCR检测直肠癌XPC基因表达
目的 检测核苷酸切除修复(NER)基因XPC在直肠癌及直肠组织中的表达.方法 采用实时定量荧光PCR法,检测16例手术后切除的新鲜直肠癌组织及6例癌旁直肠组织中XPC基因表达水平.结果 直肠癌中XPC基因水平明显高于正常直肠组织.结论 高表达的XPC基因直接在NER早期发挥着重要作用,在一定程度上导致直肠癌患者对化疗药物的敏感性降低.
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胃癌发生与XPC基因单倍型的关系
目的 探讨XPC基因多态性位点rs2228000和rs2228001位点与胃癌发生风险的关系.方法 采用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对203例胃癌患者和210例对照者进行XPC基因rs2228000位点和rs2228001位点多态性检测;并采用PHASE 2.0软件构建这两个多态性位点的单倍型,以非条件Logistic回归校正混杂因素,进行多态性与胃癌风险相关性的统计学分析.结果 XPC基因多态性位点rs2228000与rs2228001在胃癌与正常对照组之间差异无统计学意义(P>0.05).该两个SNPs构建的单倍型AT与CT与胃癌的易感关联的差异有统计学意义(P<0.01),OR值分别为2.62,10.51;分层分析显示AT与cT单倍型在性别、吸烟、饮酒、年龄分层中的差异均有统计学意义(P<0.05),且在AT单倍型中随年龄的增大,OR值逐渐增高,在<50岁、50～60岁、>60岁3个年龄层中OR值分别为1.91(95%CI:1.08～3.38)、3.49(95%CI:1.50～8.15)、5.43(95%CI:1.58～18.67).结论 XPC基因rs2228000与rs2228001多态性位点的单倍型与胃癌的发生明显相关.
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XPC基因多态性与食管鳞状细胞癌、贲门腺癌的发病风险
目的 探讨DNA修复基因XPC第9内含子PAT+/-和第15外显子A2920C 单核苷酸多态性(SNP)与河北省食管癌、贲门癌高发区磁县和涉县人群食管鳞状细胞癌(ESCC)和贲门腺癌(GCA)遗传易感性的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测327名ESCC患者、253名GCA患者和612名健康对照个体的XPC基因第9内含子PAT+/-及第15外显子A2920C SNP的基因型,比较各组间等位基因及基因型频率的分布.结果 XPC基因第9内含子PAT+/-和第15外显子A2920C的基因型及等位基因型频率在ESCC患者组、GCA患者组和对照组之间,其总体分布均无显著性差异(P＞0.05).根据吸烟状况和上消化道肿瘤家族史分层分析发现,与A/A基因型比较,携带C/C基因型可能增加非吸烟个体ESCC的发病风险 (经性别、年龄和上消化道肿瘤家族史校正后的OR=2.09,95%CI=1.14～3.81).结论 XPC基因第15外显子C/C基因型可能是影响河北省食管癌、贲门癌高发区磁县和涉县非吸烟人群ESCC发病风险的因素之一.
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XPD和XPC基因多态性与广东地区汉族人群喉癌遗传易感性研究
目的:探讨DNA修复基因XPD(751 Lys/Gln多态)、XPC(PAT多态)基因多态性与广东地区汉族人群喉癌遗传易感性的关系.方法:采用病例-对照研究的方法,运用PCR及PCR-RFLP、基因测序等技术检测233例广东地区汉族人群喉癌和102例健康对照组外周血中XPD(751 Lys/Gln多态)、XPC(PAT多态)基因的多态性.分析DNA修复基因XPD(751 Lys/Gln多态)、XPC(PAT多态)基因多态性与喉癌临床病理特征之间的关系.采用统计软件SPSS13.0处理数据,用Logistic回归模型进行因素间的相关检验,以OR值及其95％CI表示关联强度.结果:233例喉癌患者中XPD各基因型与对照组基因型频率总体分布差异无统计学意义(x2=0.28).分层分析结果显示,携带杂合突变型(Lys/Gln)、纯合突变型(Gln/Gln)的个体,其患喉癌的风险分别增加0.88、1.04倍,差异无统计学意义.233例喉癌患者中XPC各基因型PAT-/-(SS)、PAT+/-(SL)、PAT+/+(LL)与对照组XPC基因型频率总体分布差异无统计学意义(x2=2.85).分层分析结果显示,携带XPC PAT+/-(SL)、PAT+/+(LL)的个体,其患喉癌的风险分别增加1.65、1.14倍,差异无统计学意义.结论:XPC、XPD基因多态性可能与喉癌的遗传易感性无关.
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脑胶质瘤Wip1基因与DNA损伤修复关系的研究
目的 研究U251脑胶质瘤细胞Wip1基因对DNA核苷酸切除修复酶XPA、XPC的影响.方法 体外培养人胶质瘤细胞株U251,wip1(-)组采用携带Wip1基因RNA干扰载体的慢病毒沉默Wip1基因,经实时定量PCR验证.对照组(NC组)采用阴性对照病毒感染.使用替莫唑胺(temozolomide,TMZ)进行干预,将细胞分为NC组、NC+TMZ组、Wip1(-)组和wip1 (-)+TMZ组.CCK-8法检测各组细胞的增殖,实时定量PCR检测细胞XPA、XPC mRNA表达,免疫印迹检测细胞XPA、XPC蛋白表达.结果 TMZ干预后48 h、72 h、96 h、120h、144h,Wip1 (-)+TMZ组细胞增殖率低于其他3组(P＜0.05).TMZ干预48 h后,NC+TMZ组细胞XP和XPC mRNA表达远远高于NC组(P＜0.05),同时XPA和XPC蛋白表达远远高于NC组(P＜0.05).TMZ干预48 h后,Wip1(-)+TMZ组细胞XPC mRNA和XPA蛋白表达水平明显高于Wip1(-)组(P＜0.05).结论 Wip1基因与U251脑胶质瘤细胞DNA损伤修复有关,可通过调节下游产物XPA与XPC参与细胞核苷酸切除修复过程.
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XPC基因Ala499Val、Lys939Gln多态与食管癌、贲门癌发病风险的关联
背景与目的:XPC基因参与核苷酸切除修复,该基因存在单核苷酸多态性(SNP)位点,并可能通过SNP位点碱基的改变影响其修复能力及疾病易感性.本研究旨在探讨XPC基因第8外显子Ala499Val及第15外显子Lys939Gln SNP与河北省食管癌、贲门癌高发区-磁县和涉县人群食管鳞状细胞癌(esophageal sguamous cell carcinoma,ESCC)和贲门腺癌(gastric cardiac adenocorcinoma,GCA)遗传易感性的关系.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测327例ESCC患者、253例GCA患者和612名健康对照的XPC基因第8外显子Ala499Val及第15外显子Lys939Gln SNP的基因型.结果:ESCC患者组、GCA患者组上消化道肿瘤家族史阳性个体比例明显高于对照组,上消化道肿瘤家族史可增加ESCC、GCA的发病风险(经性别和年龄校正后的OR=1.76和1.77,95%CI=1.34～2.32和1.31～2.39).ESCC患者组和对照组的XPC基因第8外显子C、T等位基因频率及C/C、C/T、T/T基因型分布差异均无显著性(P＞0.05).GCA患者组T等位基因频率(26.5%)显著低于对照组(32.5%),两组相比差异有显著性(X2=6.12,P=0.01);与C/C基因型相比,携带C/T基因型可显著降低GCA的发病风险(0R=0.62,95%CI=0.45～0.84).根据吸烟状况和上消化道肿瘤家族史进行分层分析发现,与C/C基因型相比,携带C/T基因型可显著降低吸烟个体和家族史阴性个体GCA的发病风险(OR均等于0.57,95%CI=0.36～0.91和0.37～0.88).在ESCC、GCA患者组和对照组之间,XPC第15外显子A、C等位基因频率及A/A、A/C、C/C基因型分布差异均无显著性(P＞0.05).根据吸烟状况和上消化道肿瘤家族史进行分层分析发现,与A/A基因型相比,携带C/C基因型可显著增加非吸烟个体ESCC的发病风险(0R=2.05,95%CI=1.15～3.66).单体型分析显示,A/T、A/C、C/T、C/C四种单体型,在ESCC患者组与对照组之间分布差异无显著性(P＞0.05);在GCA患者组与对照组之间分布差异有显著性(P=0.02).与A/T单体型相比,携带A/C、C/C单体型可显著增加GCA的发病风险(OR=1.35和1.46,95%CI=1.01～1.81和1.06～2.00).结论:在河北省食管癌、贲门癌高发区-磁县和涉县人群中,携带XPC基因第8外显子C/T基因型可能明显降低GCA的发病风险;第15外显子Lys939Gln SNP可能与ESCC、GCA的发病风险无关,但分层分析发现携带第15外显子C/C基因型可能增加非吸烟个体ESCC的发病风险;携带A/C、C/C单体型可能增加GCA的发病风险.
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核苷酸切除修复系统基因遗传多态与晚期非小细胞肺癌患者铂类药物敏感性关系
背景与目的:肿瘤细胞对铂类药物的化疗敏感性与个体的DNA损伤修复能力关系密切,本研究探讨核苷酸切除修复系统(nucleotide excision repair,NER)的重要成员XPC、XPD和ERCC1基因的遗传多态与晚期非小细胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)患者对铂类药物敏感性的关系.方法:对接受含铂类药物化疗的200例晚期NSCLC患者进行临床疗效评价.以聚合酶链-扩增片段长度多态性(PCR-AFLP)和限制性片段长度多态性(RFLP)的方法检测XPC-PAT、XPD Lys751Gln(rs1052559)和ERCC1 C8092A(rs1052559)多态的基因型,比较不同基因型与化疗敏感性的关系.结果:结合疗效情况,XPC-PAT遗传多态各基因型在化疗有效组(CR+PR)和无效组(SD+PD)中的分布频率差异有显著性(χ2检验,P=0.023),携带XPCLL基因型个体的化疗敏感性是XPCSS基因型携带者的3.04倍(95%CI为1.25～7.41,P=0.015).没有发现XPD Lys751Gln和ERCC1 C8092A多态与化疗敏感性的相关性.但联合分析后发现,核苷酸切除修复系统的这三个遗传多态在晚期NSCLC患者对铂类药物敏感性中存在一定的联合作用(趋势检验,P=0.021).结论:核苷酸切除修复系统中XPC-PAT、XPD Lys751Gln和ERCC1 C8092A遗传多态可能与NSCLC患者对铂类药物敏感性相关.
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XPC Lys939Gln和Ala499Val基因多态与宫颈癌发生的关系
目的 探讨核酸切除修复基因XPC Lys939Gln、Ala499Val单核苷酸多态位点与广东地区汉族妇女的宫颈癌发生的关系.方法 采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态方法,比较已经病理确诊的131例宫颈癌患者(宫颈癌组)与257例宫颈组织正常对照者(对照组)的Lys939Gln、Ala499Val基因型分布的差异,采用非条件logistic回归方法分析该多态位点与宫颈癌发生的关系.结果 XPC基因的Lys939Gln、Ala499Val多态位点在宫颈癌组与对照组的基因型频率分布差异无统计学意义(P =0.875,P=0.384).以Lys/Lys、Ala/Ala基因型做参照,与其他两型比较均不能增加宫颈癌的发病风险(P＞0.05).结论 广东地区汉族妇女的宫颈癌发生风险与DNA修复基因Lys939Gln、Ala499Val多态无关.
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DNA修复基因XPC研究进展
体内存在多种修复DNA损伤的机制,核苷酸切除修复(NER)是重要的DNA损伤修复系统,着色性干皮病基因组C(XPC)是NER系统的重要成分,它与HHR23B形成复合物[1],参与DNA损伤识别和NER的启动[2],其基因突变可引起整个核苷酸切除通路的缺陷和着色性干皮病表型.因此对XPC的生物学特性及功能与NER、肿瘤之间关系的研究具有重要的意义.广大学者对XPC的生物学特性及功能、多态性与NER、肿瘤的关系已有了大量的研究,现对其进行综述如下.
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单核苷酸多态与头颈部鳞状细胞癌发生风险的研究进展
核苷酸切除修复是人类重要的DNA损伤修复机制,ERCC2/XPD和XPC是重要的核苷酸切除修复基因产物,在遗传组学的研究上发挥重要作用.本文就ERCC2/XPD和XPC单核苷酸多态与头颈部鳞状细胞癌发生风险的研究进展作一综述.
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着色性干皮病一家系的XP基因突变检测
目的：检测1个着色性干皮病家系的XPA和XPC基因突变。方法收集1个着色性干皮病家系的临床资料，采集先证者及其家庭成员的外周血标本，提取外周血白细胞中的DNA，采用PCR反应扩增XPA和XPC所有外显子编码区及其侧翼序列，通过对PCR反应产物直接测序进行序列分析。结果该着色性干皮病家系未发现XPA和XPC的致病性基因突变。结论尽管XPA和XPC是国内比较常见的着色性干皮病亚型，但该家系可能属于其他的亚型。
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60Co γ射线诱导正常人淋巴母细胞XPCmRNA表达的剂量相关性研究
目的:研究正常人淋巴母细胞AHH-1电离辐射作用后XPC mRNA表达的剂量效应关系,探索建立一种基于基因表达变化的新型辐射生物剂量分子标志物的可能性.方法:剂量为1、2、4、6、8和10Gy的60Coγ射线照射AHH-1细胞后4、10、24h收集细胞,应用实时荧光定量PCR技术对XPC mRNA表达水平进行相对定量检测.结果:在0～10 Gy的γ射线照射后4h,AHH-1细胞中XPC mRNA表达水平就显著增加,并达到第1个高峰,维持至10h左右或有所降低,随后继续上升,持续时间可达24h.在0～8 Gy剂量范围内辐射诱导XPC mRNA表达丰度随照射剂量的升高而上调,具有显著的剂量依赖性.结论:正常人淋巴母细胞XPC mRNA表达水平与电离辐射之间具有良好的剂量效应和时间效应关系,有成为新的辐射生物剂量计的潜力.
