首页 > 文献资料
-
microRNA在高血压发病机制中的研究进展
高血压是心血管疾病发病和死亡的主要原因,其发病机制目前仍不明确.microRNA在许多生理病理过程中发挥着重要作用.近年来研究发现,部分miRNA可通过多种途径参与高血压相关信号传导网络的调控,广泛参与高血压病的发生、发展的各个环节,成为目前研究的热点.
-
冠心病血瘀证实质的系统生物学研究现状与思考
冠心病血瘀证实质的研究存在客观指标特异性和可重复性差的问题,系统生物学补充了以往单一指标、单一组织、单一系统等研究方法的不足.目前冠心病血瘀证的基因组学、蛋白质组学和代谢组学研究在思路上仍是还原分析的模式,与系统生物学的整合建模思想相差甚远.网络生物学和microRNA组学的出现为解决冠心病血瘀证实质研究的复杂性提供了新的思路和方法.
-
MicroRNA在埃博拉病毒感染中的作用研究进展
MicroRNA是一类通过影响RNA表达、抑制蛋白质翻译来调节基因表达的内源性非编码小分子RNA.自从2014年首次发现苏月型和扎伊尔型埃博拉病毒能够编码microRNA以来,不断有研究发现新的病毒microRNA以及其在埃博拉病毒复制、扩散、免疫逃逸中发挥的作用.宿主microRNA则参与到抗病毒防御机制中,但也面临着病毒蛋白对其调控的阻力包括相应宿主microRNA水平的变化以及RNA沉默抑制子的编码.深入研究埃博拉病毒与宿主在microRNA水平上的动态相互作用,有利于进一步了解埃博拉病毒的致病机制以及开发新的诊断、治疗策略.本文就microRNA在埃博拉病毒感染中的作用做一简要综述.
-
MicroRNA调控乙型脑炎病毒复制及发病机制的研究进展
流行性乙型脑炎病毒(JEV)是具有严重危害的人畜共患病病原,感染人后入侵中枢神经系统,致死或者留下永久性神经系统后遗症.JEV还可以感染猪群,造成种猪繁殖障碍,仔猪脑炎,给养猪业带来损失.MicroRNA作为一种在转录后水平发挥基因调控功能的非编码小分子RNA,参与到细胞生长、分化、凋亡和代谢等生命过程,并且在病毒感染入侵及宿主细胞的抗病毒方面起着重要的调节作用.此文综述了当前已证实的microRNA对JEV复制及发病机制的调控作用研究.了解宿主microRNA在JEV感染过程中的可能导致识别阻断JEV复制或细胞特异性调节病毒载体靶向的新机制,并提出了防控JEV的可能途径.
关键词： 乙型脑炎病毒(JEV) microRNA 病毒复制 发病机制 -
EB病毒编码microRNA的靶基因研究进展
EB病毒(EBV)是一种疱疹病毒,与多种肿瘤的发生密切相关.EBV可表达多种病毒microRNA (miRNA),并作用于细胞和病毒基因,参与信号转导、细胞增殖、分化等多种功能,这与EBV的致病机制密切相关.探索EBV编码miRNA相关靶基因及功能有助于进一步了解EBV的致病机制,也将为临床治疗提供新的启示.自EBV编码miRNA被发现以来,一些靶基因已经逐渐被验证.本文将对目前已验证的EBV编码miRNA的靶基因及功能进行综述.
-
MiRNA-146a的单核苷酸多态性rs2910164与2型糖尿病相关性的系统分析
目的 对miR-146a rs2910164 与T2DM相关性进行荟萃分析.方法 在Pubmed、EMBASE、以及CNKI、万方数据库进行文献检索,收集病例对照研究,对纳入的文献进行质量评价,并获取相关数据,使用Stata12进行meta分析.结果共检索文献499篇,终有4篇符合入选标准,其中病例组共2069人,对照组1950人.结果显示rs2910164的基因位点及各遗传模型与T2DM均无明显相关性,但以种族进行分层分析,在各遗传模型中纯合子模型及隐性模型提示与白种人T2DM有关,增加T2DM的发病风险(OR=1.79 95% CI 1.07~3.00, PH=0.216;GG+GC/CC:OR=1.80 95% CI 1.09~2.97, PH=0.314).在敏感性分析中去除Wang等人的研究,此基因位点及纯合子模型与T2DM有关,也提示增加T2DM的发病风险(G/C:OR=1.32 95% CI 1.05~1.67, PH =0.104;GG/CC:OR=1.97 95% CI 1.49~2.61, PH=0.420).结论 miR-146a rs2910164可能增加T2DM的患病风险,但仍需纳入更多高质量、更多不同种族的文献研究,进行综合分析.
-
肾间质纤维化中MicroRNA表达研究进展
MicroRNA (miRNA)是一种高度保守、内源性的非编码小分子RNA,主要参与生物体中转录后水平基因表达的调控.miRNAs在各种肾脏疾病的发病机制中起重要作用.肾间质纤维化是各种慢性肾脏病进展至终末期,终导致器官功能丢失的共同的病理过程和特征.转化生长因子β(TGF-β)在肾纤维化过程中是公认的一个重要的介质,它能刺激细胞外基质(ECM)的积聚并损害肾功能.近年研究发现,在肾脏组织中存在的一些miRNAs对肾脏纤维化的发生与发展有着重要的作用,深入地了解它们之间的关系可以为临床肾脏纤维化的治疗提供新的治疗靶点.
-
乳腺癌上皮间质转化标志物的研究进展
转移和复发是乳腺癌的主要死因.近年来研究发现,上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)是乳腺癌转移的主要机制之一.EMT是指细胞由上皮表型向间质表型转变的过程,目前许多研究者报道了EMT相关的基因、蛋白、microRNA以及激酶等的改变与乳腺癌侵袭和转移的关系,然而到目前为止,有关EMT标志物与乳腺癌的关系缺乏系统的总结.本文就EMT标志物与乳腺癌侵袭和转移的关系进行综述.
-
miR-184在碱烧伤大鼠角膜新生血管中的表达及靶基因预测分析
目的 初步探miR-184在碱烧伤诱导大鼠角膜新生血管形成过程中的作用和基因调控机制.方法 碱烧伤诱导大鼠角膜新生血管形成.基质胶上建立人脐静脉血管内皮细胞体外三维培养体系.应用qRT-PCR检测miR-184的体内外表达.生物信息学方法预测并分析miR-184靶基因.结果 初步建立起血管新生的体内外研究模型,miR-184在碱烧伤大鼠角膜新生血管角膜中的表达(0.145±0.013)较正常角膜(1.015±0.189)显著下降(P＜0.01),而在人脐静脉血管内皮细胞中相对表达量极少(0.007±0.004) (P ＜0.05).预测的靶基因与VEGF血管生成信号通路有关.结论 新生血管进程中伴随着miR-184表达量降低,提示其与血管新生密切相关,可能通过VEGF信号通路参与碱烧伤角膜新生血管形成.
-
肿瘤相关巨噬细胞microRNA表达谱及生物信息学分析
目的 研究肿瘤相关巨噬细胞( TAM) microRNA的表达谱.方法 建立小鼠乳腺癌细胞系4T1移植瘤模型,从移植瘤组织中分离TAM,用基因芯片检测microRNA表达谱,实时荧光定量PCR( real-time PCR)验证芯片结果并进行生物信息学分析,以小鼠腹腔巨噬细胞(PEC)为阴性对照.结果 与阴性对照细胞相比,TAM中有59个microRNAs表达量出现显著变化,其中23个microRNAs表达上调,有36个microRNAs表达下调；实时荧光定量PCR对miR-146a、miR-222、miR-31和miR-877的表达进行了验证,其结果与基因芯片检测结果一致；这些microRNAs参与了多个信号通路的调控.结论 microRNA表达谱及生物信息学分析表明microRNA在TAM分化过程的调控中有重要作用.
-
肝内及肝外胆管癌表达下调microRNAs表达谱的鉴定
目的 筛选并鉴定肝内及肝外胆管癌组织表达下调的miRNAs,进行初步的功能研究.方法 利用miRNA-基因芯片方法筛选肝内、肝外胆管癌组织特异表达下调或共同表达下调的miRNAs,选择real-time PCR方法进行验证；根据肝内及肝外胆管癌不同的下调miRNAs表达谱,选择差异明显且具有代表性的miRNAs,利用miRNA特异模拟物转染胆管癌细胞系QBC939,利用MTT试剂盒分析细胞增殖变化,研究表达下调miRNAs与胆管癌细胞增殖的关系.结果 表达分析显示,肝外胆管癌组织特异表达下调的miRNAs共25个,肝内胆管癌组织特异表达下调的miRNAs共15个,在肝内及肝外胆管癌组织均表达下调的miRNAs共6个.在胆管癌细胞系QBC939中分别过表达miR-181a、miR-596、miR-492以及miR-602可以明显抑制细胞增殖.结论 肝内及肝外胆管癌具有不同的miRNAs表达谱,表达下调的miRNAs可以明显抑制胆管癌细胞增殖.
-
胃癌SGC7901/DDP细胞microRNA的表达谱分析及其在耐药逆转中的作用
目的 分析胃癌SGC7901/DDP细胞microRNA表达谱及其耐药特性,研究筛选出的microRNA-200c对SGC7901/DDP细胞耐药的影响.方法 采用MTT法检测细胞的药物敏感性；应用microRNA芯片进行表达谱分析；运用生物信息学对筛选出的microRNA进行靶点预测和生物学进程分析.采用实时荧光定量RT-PCR检测microRNA-200c的表达；采用细胞转染分析microRNA-200c对SGC7901/DDP细胞药物敏感性的影响.结果 SGC7901/DDP细胞对顺铂、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的IC50均显著高于SGC7901细胞(P＜0.05).与SGC7901细胞相比,SGC7901/DDP细胞中表达上调和下调超过2倍的microRNA分别有5和14个.microRNA高低表达组预测的靶点均广泛参与信号传导、细胞周期、分化、凋亡及增殖等生物学进程.实时荧光定量PCR分析证实microRNA200c在SGC7901/DDP细胞中的表达显著降低(P＜0.05),microRNA-200c能够显著降低SGC7901/DDP细胞对顺铂、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的IC5o (P ＜0.05).结论 SGC7901/DDP细胞的多药耐药特性可能与microRNA表达谱的改变有关,其耐药表型的逆转可能与microRNA-200c的表达有关.
-
hsa-miR-10 b在3株宫颈癌细胞系中的表达及靶基因预测
目的：分析3株宫颈癌细胞系中hsa-miR-10b表达水平，并预测hsa-miR-10b的靶基因。方法用PCR技术检测3株宫颈癌细胞系中hsa-miR-10b表达水平；PubMed检索hsa-miR-10b相关文献；miRbase和NCBI分析其序列保守性及所在基因组特征；TargetScan、PicTar及miRanda数据库预测其靶基因，并结合已证实的靶基因对其进行功能和信号通路富集分析。结果与C-33A相比，HeLa和CaSki中hsa-miR-10b表达水平显著下调（P＜0.01）；hsa-miR-10b与多种肿瘤的发生发展有关；hsa-miR-10b定位于人染色体2q31.1，在各物种之间具有高度保守性；其靶基因主要参与转录、基因表达调控和细胞增殖等生物学过程（ P＜0.05），涉及肿瘤、细胞周期和ARF等信号通路（ P＜0.05）。结论 hsa-miR-10b功能广泛，与宫颈癌的发生发展密切相关，靶基因的预测为后续研究提供依据。
关键词： 生物信息学 microRNA hsa-miR-10b 靶基因预测 -
骨髓间充质干细胞向软骨细胞分化过程中miR130α的表达
目的 诱导骨髓间充质干细胞向软骨细胞分化,初步探索miR130α在骨髓间充质干细胞向软骨细胞分化过程中的调控作用.方法 体外TGF-β1诱导骨髓间充质干细胞向软骨细胞分化,免疫荧光法和免疫组化染色鉴定Ⅱ型胶原,阿辛兰染色鉴定氨基葡聚糖.用Real-time PCR法检测细胞miR130α的表达.结果 骨髓间充质干细胞在TGF-β1诱导下可分化为软骨细胞.培养7 d后,诱导培养组细胞miR130α表达的水平显著低于培养前的水平(P＜0.05).结论 骨髓间充质干细胞体外诱导可以分化为软骨细胞,在向软骨细胞分化的早期,miR130α表达降低伴随着软骨细胞的分化,提示与软骨形成的过程有关.
-
MicroRNA-205对人皮肤上皮细胞迁移能力的调控
目的 观察micmRNA-205(miR-205)在人皮肤上皮细胞中的表达抑制和过量表达对于该类细胞迁移能力的影响.方法 使用体外合成的miR-205抑制剂(antagomir-205)处理人皮肤上皮细胞并检测抑制效果,观察其对皮肤上皮细胞迁移的影响.在293TN细胞中包装并收获能过表达成熟miR-205的重组慢病毒颗粒,感染人皮肤上皮细胞并检测过表达效果,进一步观察其对皮肤细胞迁移的影响.结果 成功使用miR-205抑制剂实现对人皮肤上皮细胞内源性miR-205的抑制,证实其抑制了皮肤上皮细胞的迁移.成功获得过表达miR-205的重组慢病毒颗粒,证明miR-205可促进皮肤上皮细胞的迁移.结论 miR-205可以促进皮肤细胞的迁移.
-
利用RIP-Chip筛选结合多聚胞嘧啶结合蛋白2的microRNAs
目的 通过核糖核蛋白免疫沉淀-芯片技术(RIP-Chip)在人正常神经胶质细胞(HA)和神经胶质瘤细胞(T98G和U87MG)中筛选与多聚胞嘧啶结合蛋白2(PCBP2)相互作用的microRNA(miRNA).方法 选择兔抗人PCBP2抗体,用Western blot法检测PCBP2蛋白在HA、T98G和U87MG细胞中的表达.用兔IgG作为阴性对照,收集3种细胞的RIP蛋白和RNA样品,通过Western blot检测PCBP2蛋白富集效果,利用NanoDrop定量并经Agilent2100检测RNA完整性.选择Affymetrix miRNA 3.0芯片对RNA样品进行杂交,筛选富集4倍以上且P＜0.05的miRNA.结果 用PCBP2抗体进行RIP-Chip实验,终筛选和PCBP2相互作用的103条miRNA,1条前体miRNA和1条核仁小分子RNA;其中15条存在PCBP2的结合位点.结论 PCBP2可以通过识别靶序列或者以核糖核蛋白复合物形式在细胞内结合成熟的miRNA、前体miRNA或核仁小分子RNA.
-
永久性房颤的转录组分析及miRNA调控网络的建立
目的 探索永久性房颤(pAF)发病相关的关键miRNAs及其调控的靶基因.方法 联合应用表达谱芯片和miRNA芯片分析pAF患者(n=7)和健康成人(n=4)的左房组织,筛选pAF相关差异表达的miRNAs,进行靶基因预测后,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-analysis);利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与交集靶基因的调控网络(miRNA-gene-network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被调控的关键靶基因;采用RT-qPCR方法检验另一组pAF患者(n=5)和健康成人(n=4)的左房组织标本.结果 表达谱基因芯片发现610个mRNA有显著性改变(fold change＞2,P＜0.05),miRNA-靶基因调节网络发现与pAF显著相关的20个miRNAs和107个靶基因,相关度高的是miR-144、niR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p和miR-101;其调控的重要靶基因包括CACNB2、EFNB1、PTEN、TAOK1、RUNX1和TPM3等;RT-qPCR验证结果显示这些miRNAs和靶基因密切相关.结论 通过表达谱基因芯片与miRNAs芯片联合分析pAF左房组织标本,构建miRNA调控网络,发现pAF重要的miRNA-靶基因调控及功能,结果更加准确.
-
miR-181b慢病毒载体的构建及其对HEK-293T细胞MAPK1基因的靶向调控作用
目的 构建miR-181b慢病毒过表达载体,探讨其对HEK-293T细胞MAPK1基因的靶向调控作用.方法 分别构建pSicoR-miR-181b及pmiR-Report-MAPK1过表达载体,转染HEK-293T细胞后,用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测MAPK1 mRNA的表达、用Western blot检测MAPK1蛋白的表达及用双荧光素酶报告基因活性验证miR-181b与MAPK1的靶向调控关系.结果 成功构建了pSicoR-miR-181b及pmiR-Report-MAPK1重组质粒,miR-181b过表达明显抑制HEK-293T细胞MAPK1蛋白及mRNA表达水平(P＜0.05),抑制miR-181b的表达后,MAPK1的蛋白及mRNA的表达水平上调(P＜0.05).结论 成功构建pSicoR-miR-181b慢病毒载体,并证实通过靶向作用MAPK1-3'UTR的特异序列直接抑制MAPK1基因的表达.
-
全反式维甲酸对小鼠肝癌细胞Hepa1-6增殖、迁移、侵袭的影响及其机制
目的 探讨不同浓度的全反式维甲酸(ATRA)对小鼠肝癌细胞Hepa1-6体外增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响及肝癌细胞间质标志蛋白和miR200家族的表达情况.方法 以Hepa1-6小鼠肝癌细胞为研究对象,给予0、0.1、1.0和10.0μmol/L终浓度的ATRA处理,结晶紫染色检测细胞增殖,锥虫蓝拒染实验计数活细胞.Hoechst检测细胞凋亡,划痕实验检测迁徙能力,Transwell实验检测侵袭能力,荧光定量PCR(real-time PCR)法检测间质标志蛋白N-cadherin、sail和vimentin和0和10 μmol/L ATRA处理后的miR200家族的mRNA表达.结果 ATRA处理后Hepa1-6细胞的增殖、迁移、侵袭能力明显下降(P＜0.05),凋亡率增高(P＜0.05),间质标志蛋白N-cadherin、sail和vimentin的表达明显下调(P＜0.05),ATRA的浓度越高,这些作用越明显.10μmol/L ATRA处理后miRNA200a-3p,200c-3p,141-3p显著上调.结论 ATRA呈浓度依赖性促进肿瘤细胞Hepa1-6凋亡,抑制其增殖、迁移及侵袭能力,这可能与ATRA上调microRNA200家族,抑制细胞的间质表型有关.
-
MicroRNA在建立DJ-1基因敲减细胞模型中的应用
目的 与传统的siRNA方法建立基因敲减模型不同,探讨合成microRNA(miRNA)在DJ-1基因敲减细胞模型中的应用.方法 构建针对DJ-1基因的合成miRNA载体,合成DJ-1基因的siRNA干扰片段.在脂质体介导下,将上述两种小干扰RNA载体或片段分别转染MN9D细胞系,应用real-time PCR和Western blot检测目的 基因DJ-1的mRNA和蛋白表达.结果 与对照组相比,转染合成microRNA的MN9D细胞中,DJ-1的mRNA水平下调90%(P<0.05),蛋白水平下调70%～85%(P<0.05);而转染siRNA的MN9D细胞中,DJ-1的mRNA水平下调50%～70%(P<0.05),蛋白水平下调20%-50%(P<0.05).结论 microRNA与siRNA均可作为基因敲减的重要研究手段.与传统的siRNA相比,合成microRNA对目的 DJ-1的干扰效率更为显著.
