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集中式供水污染致诺如病毒感染性腹泻暴发的调查
目的 了解一起感染性腹泻暴发的病因、感染来源,采取针对性措施控制疫情蔓延.方法 对涉疫的Y镇北部5个村委会的现住居民进行回顾性队列研究,用统一的调查表登记2007年11月20日以来所有有腹泻或呕吐症状之一者.对Y镇北部5个村委会的供水系统、3个自然村的环境及部分患者家庭进行现场卫生学调查.面访部分病例.用Real-time PCR和巢式PCR方法 检测患者粪便标本诺如病毒核酸.结果 2007年11月24日至12月3日,Y镇北部饮用A自备自来水的村民共发生腹泻或呕吐病例435例,发病率12.93%.病例分布在饮用A自备自来水的所有村委会,高发病率21.23%(100/471),低5.21%(20J/3s4),饮用A自备自来水与发病之间有关联性(RR=9246,95%C/:6.25～13.68).发病时间集中在25-27日,占85.9%(262/305).调查S2村委会某自然村年龄别发病率分别为,0岁～组20.0%(3/15)、10岁～组17.3%(9/52)、20岁～15.2%(16/105)、60岁以上23.3%(7/30),各年龄组差异无统计学意义(X2=1.15,P>0.05).病例大多病情较轻,经门诊对症治疗后痊愈,无住院和死亡病例.现场调查和水质日常监测发现水处理过程存在消毒不落实的情况.A自备自来水水质检测细菌学指标不合格.患者2份呕吐物和1份粪便未检出沙门菌、志贺菌和金黄色葡萄球菌,3份患者粪便和3份患者肛拭诺如病毒检测,Real-timePCR 3份阳性,巢式PCR 6份阳性.对供水管网进行清洗消毒后病例迅速递减.采取消毒饮用水和健康教育等综合措施后,疫情迅速得到有效控制.结论 本次疫情为一起诺如病毒感染性腹泻暴发,可能是因A自备自来水受污染而引起的暴发.
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2009-2011年广州环境与临床标本中诺如病毒的分子流行病学特征
目的 调查2009-2011年广州诺如病毒的分子流行病学特征.方法 分别收集广州市2010年1月至2011年5月的环境水样183份、2009年6月至2011年6月的海产品1162份和2009年7月至2010年12月的腹泻患者粪便标本1066份,以实时荧光定量逆转录PCR (qRT-PCR)检测诺如病毒,对扩增阳性标本测序后与GenBank中的诺如病毒参考株比较,绘制系统进化树.结果环境水样中诺如病毒阳性率为19.67％(36/183),海产品中的阳性率为8.26％(96/1162),腹泻患者粪便标本中的阳性率为37.05％(395/1066);扩增阳性样品中的诺如病毒可分为10株代表株,其中7个代表株(共208份标本)的基因型为G2-4型,并且水样、海产品和粪便标本同源性很高,相似度达94％ ～ 100％.结论 广州诺如病毒流行优势株为G2-4型,同时标本中阳性率较高.
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新型GⅡ.4诺如病毒重组株感染疫情的分子流行病学研究
目的 分析老年护理院诺如病毒(norovirus,NoV)胃肠炎疫情流行病学特征及其所感染病毒的基因型别.方法 2013年1月29日,上海市金山区某老年护理院发生了一起由NoV感染引起的急性胃肠炎疫情,以26例患者作为研究对象,对其进行个案调查.采用单纯随机抽样方法,抽取未经治疗的9例患者,采集其粪便或肛拭子样本9份,再从中抽取4例患者,采集其病房门把手表面涂抹样本或马桶坐垫表面涂抹样本4份.运用荧光RT-PCR对样本进行NoV核酸检测,对核酸检测阳性的样本进行常规RT-PCR,对PCR产物进行纯化回收及测序,测序序列经核酸比对确认,应用Clustal X、MEGA 5.1等软件分析基因序列,构建系统进化树.结果 在26例患者中,男性7例,女性19例.经荧光RT-PCR检测的13份样本中,NoV核酸阳性8份.序列比对分析结果显示,获得测序信号的Jinshan08、Jinshan12分离株间核苷酸序列同源性为100％ 进化树分析结果显示,在RdRp区,Jinshan08 、Jinshan12分离株与GⅡ.e/NV2634/BCN/Spain/2008株等在进化树的同一分支上,可信度为99％,在Capsid的N/S区,2分离株与Lordsdal株等在进化树的同一分支上,可信度为97％.结论 本次疫情是由新GⅡ.4型NoV重组株感染引起的急性胃肠炎暴发疫情.
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广东省某牡蛎养殖区人群血清抗体阻断诺如病毒GII.4与HBGA受体结合
目的 研究广东省某牡蛎养殖区人群血清抗体阻断诺如病毒GII.4与HBGA受体结合的作用.方法 分别于2015年1月和2016年12月,采用随机数字表法,以广东省长沙湾牡蛎养殖区为调查点,抽取18岁及以上常住人口为实验组对象,排除具有任何已知的免疫抑制状态或免疫缺陷疾病或正在接受免疫抑制治疗者,以及调查时处于妊娠状态者,2015年1月共抽取调查对象195名, 2016年12月共抽取调查对象164名,两次问卷有效回收率均为100%.于2015年11—12月,在匹配年龄、性别条件下,从广东省4个不同内陆地区抽取普通人群为对照组,共169名,问卷有效回收率为100%.采集实验组和对照组对象唾液标本,运用ELISA法对实验组和对照组对象HBGA受体型别进行鉴定,检测调查对象血清抗体水平及其吸光度值,利用诺如病毒体外中和替代模型测定血清抗体阻断诺如病毒GII.4与HBGA受体结合的效率.结果2015年实验组、2016年实验组和对照组对象的年龄分别为(50.68±15.17)、(52.52±15.90)和(51.37±13.32)岁(F=0.21,P=0.650);男性分别占35.9% (70名)、36.6%(60名)、40.8%(69名)(χ2=0.93,P=0.334).2015年实验组、2016年实验组以及对照组对象血清抗体吸光度值分别为4.202±0.083、4.305±0.075和3.748±0.083(F=13.28,P<0.001);3组血清抗体阳性率均为100%.2015年实验组对象血清抗体阻断率为50%时,抗体几何平均滴度(GMT)为423.1±40.11,对照组对象血清抗体阻断率为50%时,抗体GMT为248.2±25.63(t=3.73,P<0.001).结论 牡蛎养殖区人群较普通人群有更多的诺如病毒暴露与感染机会,血清抗体阻断能力强,该人群较普通人群对GII.4感染具有更高抵抗能力.
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三种水中诺如病毒富集方法的比较
诺如病毒是一种重要的食源性及水源性病毒,该病毒常通过污染水源引起急性胃肠炎的暴发[1].21世纪以来,在全球范围内,很多国家都报道了诺如病毒感染的暴发事件[2-3].由于水中诺如病毒含量较低,往往需要经过富集才能通过荧光定量PCR仪检测到.本研究对应用广泛的3种病毒富集方法,絮凝沉淀法、聚二乙醇(polyethylene glycol , PEG)沉淀法和阴离子膜法进行了比较评价,通过计算诺如病毒的回收率,以获得一种较好的方法[4-6],应用于实际检测工作中.
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诺如病毒感染暴发调查和预防控制技术指南（2015版）
诺如病毒变异快、环境抵抗力强、感染剂量低，感染后潜伏期短、排毒时间长、免疫保护时间短，且传播途径多样、全人群普遍易感。诺如病毒感染发病的主要表现为腹泻和/或呕吐，国际上通常称之为急性胃肠炎。中国一直将其列入丙类传染病中“其他感染性腹泻病(除霍乱、细菌性和阿米巴性痢疾、伤寒和副伤寒以外的感染性腹泻病)”进行报告管理，这在一定程度上影响了以呕吐为主要症状的诺如病毒感染病例及其暴发的报告。诺如病毒是全球急性胃肠炎散发病例和暴发疫情的主要致病原，疾病负担严重[1-2]。2013年以来，中国其他感染性腹泻病暴发多以诺如病毒暴发疫情为主，尤其是2014年冬季以来，诺如病毒暴发疫情大幅增加，显著高于历年水平。
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诺罗病毒引起医院感染性腹泻的调查与控制
目的 调查某院诺罗病毒引起的1次腹泻暴发流行的危险因素,为预防与控制类似事件提供参考依据.方法 对发生腹泻的两个病区15例患者在2006年11月12-15日期间发生的腹泻感染进行流行病学分析.结果 15例患者中有7例为散发病例,8例为同一病原菌腹泻,完善的医院感染监测系统能及时监测到疫情,并有效控制腹泻流行,同时通过北京市医院感染管理质量控制和改进中心平台能做到信息共享,使各医院有所借鉴,避免了全市范围内的医院感染腹泻的流行引起不必要的恐慌.结论 社会因素、老年患者体弱、自体免疫力低下等原因是引起诺罗病毒性腹泻感染流行的主要原因;提示完善的医院感染管理监测网络可以及时、敏感地发现医院感染流行趋势,而有针对地采取有效防控措施,及时的信息交流是防止感染蔓延的主要手段,加强医院感染监测网络的建设是预防与控制医院感染的关键.
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广州地区儿童诺如病毒性腹泻的分子流行病学研究
目的 应用TaqMan实时荧光逆转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)法检测诺如病毒(norovirus,NV)的发病情况,为儿童NV腹泻的临床治疗或病毒爆发流行的预防、控制及疫苗的研制提供流行病学资料.方法 随机收集2006年12月至2007年12月广州地区急性腹泻病患儿水样便或蛋花汤样便,应用针对病毒ORF1与ORF2连接区域设计的引物及TaqMan探针进行实时荧光RT-PCR检测标本.并将NV阳性标本进行克隆并测序,结合检测结果以确定此周期内NV的流行情况及优势毒株.结果 本研究从1260份标本中检测出NV阳性257份(20.40%),其中G Ⅰ型87份(6.90%),GⅡ型214份(16.98%),G Ⅰ和GⅡ混合感染44份.测序分析后发现G Ⅰ毒株检出率依次为G Ⅰ-3、G Ⅰ-2及GⅠ-4;GⅡ毒株检出率依次为GⅡ-4、GⅡ-3及GⅡ-7.NV主要感染年龄为2岁以内婴幼儿,发病高峰期在11至12月.结论 NV已经成为广州地区婴幼儿腹泻的重要病原体之一,GⅡ-4型是2007年主要流行病毒株.
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诺罗病毒性肠炎的观察与护理
目的:探讨诺罗病毒性肠炎的护理方法.方法:回顾性总结234例诺罗病毒性肠炎患者的病情观察及护理体会.结果:经积极治疗和精心护理,234例患者在3 d左右痊愈.结论:针对诺罗病毒性肠炎的流行特点及传播途径,采取严格的消毒隔离措施、禁食、补液、对症护理,能迅速地缓解病情,有效地控制疾病的传播.
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2010-2013年上海长宁地区成年人急性病毒性胃肠炎的流行病学研究
目的：研究上海长宁地区成年人急性病毒性胃肠炎的流行病学特点。方法收集2010年6月至2013年12月上海长宁地区成年急性胃肠炎患者的粪便标本1554例，采用酶联免疫吸附测定法及多重聚合酶链反应法进行多种病毒检测。结果在1554例病例中，年龄（46.19±15.59）岁，其中男691例，女863例。共检出病毒感染患者407例，检出率26.19%，其中97.05%（395/407）为单一病毒感染，2.95%（12/407）为混合感染。单一病毒感染中轮状病毒189例，诺罗病毒148例，札幌病毒37例，星状病毒14例，腺病毒7例。在不同的月份中，流行高峰在每年的10月至次年2月；病毒阳性组水样泻、呕吐、发热发生率均高于病毒阴性组[95.09%（387/407）比88.14%（1011/1147）、31.20%（127/407）比18.83%（216/1147）、11.06%（45/407）比7.59%（87/1147）]，差异有统计学意义（P＜0.01或＜0.05）。结论成年人急性病毒性胃肠炎以轮状病毒感染多见，有较高的水样泻、呕吐及发热发生率，流行高峰在冬季。
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708例腹泻患者粪标本病毒检测及临床特点
目的 了解成人散发性腹泻病毒感染情况,为临床防治提供依据.方法 收集上海市第五人民医院肠道门诊2012年5月至2013年4月腹泻患者粪便标本708份,送上海市闵行区疾病预防控制中心采用反转录(RT)-PCR进行病毒检测.统计学处理采用Pearson卡方检验和Fisher确切概率检验.结果 708份粪便标本中,检出诺如病毒G Ⅰ型7份,占0.99％;诺如病毒GⅡ型150份,占21.19％;轮状病毒21份,占2.97％;星状病毒3份,占0.42％;腺病毒4份,占0.56％.男性腹泻患者感染诺如病毒GⅡ占26.80％,高于女性的15.32％,差异有统计学意义(x2=13.957,P＜0.01).结论 本组腹泻患者粪便标本检测结果以诺如病毒GⅡ型多见,男性高于女性,其次为轮状病毒、星状病毒和腺病毒感染.本组成人腹泻病例病程短,预后良好.
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某高校1起诺如病毒感染暴发调查
目的 通过对某高校1起诺如病毒感染性腹泻疫情的调查分析,寻找感染来源、传播途径及其危险因素,为今后的有效防控提供依据.方法 对疫期发生胃肠不适的患者进行流行病学调查,采取食物预留样本,疑似病例的呕吐物、排泄物应用酶联免疫法进行诺如病毒检测.结果 此次疫情从2017年9月20-24日全校共有胃肠不适约603例,筛选出疑似249例,病原学检测确诊159例,检出率为52.5％,其中厨工12例,占7.14％.结论 此次感染性腹泻的疫情暴发是由诺如病毒引起,主要是食物、餐具污染和生活接触所致,与厨工的传播密切关联.
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1起学校诺如病毒急性胃肠炎暴发的病原学检测
目的 对1起学校急性胃肠炎暴发疫情进行病原学检测分析.方法 对该学校暴发疫情的急性胃肠炎病例、厨房工作人员及病例对照采集肛拭子标本,提取核酸RNA,应用实时荧光RT-PCR试剂盒进行诺如病毒、札如病毒、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测,对阳性标本进行核衣壳编码区RT-PCR扩增、序列测定和系统进化分析.结果 21份患者肛拭样本中有16份GII型诺如病毒实时荧光RT-PCR阳性;所有标本的札如病毒、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测阴性.14份诺如病毒核酸阳性标本获得321bp目标片段序列,彼此间核苷酸相似性100％,提示同一来源;GenBank的BLAST结果显示,本次诺如病毒疫情毒株与GⅡ.2的参考株AY 134748(Snowmoutain/1976/US)、X81879 (Melksham/1989)同源性高,进化树上处于同一进化分支,属于GⅡ.2群.结论 该起学校急性胃肠炎暴发疫情是由诺如病毒GⅡ.2感染所致.
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在诺如病毒感染疫情中发现GⅠ和GⅡ型混合感染病例
目的 明确急性胃肠炎疫情病原体,为控制疫情提供依据. 方法 采用实时荧光RT-PCR法对急性胃肠炎疫情患者标本进行GⅠ型和GⅡ诺如病毒RNA检测. 结果 阳性标本均检出GⅠ型诺如病毒核酸,其中1份阳性标本GⅡ诺如病毒核酸同时阳性. 结论 首次在大连地区诺如病毒疫情中发现GⅠ和GⅡ型混合感染病例.
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2014年宁波地区诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情分析
目的 了解宁波地区诺如病毒(又称诺罗病毒)急性胃肠炎暴发疫情的病毒基因型,为预测病毒流行趋势提供依据. 方法 收集2014年宁波市12 起急性胃肠炎暴发疫情的病例样本及相关流行病学资料, 所有样本用荧光RT-PCR方法检测诺如病毒和轮状病毒核酸. 诺如病毒核酸阳性样本进一步扩增病毒VP1基因片段,进行序列比对及遗传进化分析. 结果 从12起急性胃肠炎暴发疫情中查明9起疫情病原为GⅠ.2、GⅡ.6 和 GⅡ.17型诺如病毒,其中6起由GⅡ.17型诺如病毒所致疫情均发生于12月份,波及5所学校和1所养老院. 序列比对和进化分析显示,宁波地区流行的GⅡ.17型诺如病毒与近期周边国家和地区分离到的病毒序列(JP/2014/Kawasaki323和13-BH-1/2013)同源性高,核苷酸差异均仅为2.6%. 结论 GⅡ.17型诺如病毒是2014年宁波地区诺如病毒型胃肠炎暴发的主要基因型. 与既往流行性特征相比,流行强度显著改变.
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2015年湖北地区诺如病毒流行特点及基因型别特征
目的 了解湖北地区腹泻患者诺如病毒(norovirus,NV)的流行病学特征及基因型别特征.方法 收集2015年1～12月儿童和成人腹泻患者的粪便标本687份,采用Real-time逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reavtions,RT-PCR)方法进行NV的核酸检测;应用RT-PCR方法对NV检测阳性的GⅡ型标本再行扩增ORF 2基因N/S区基因片段后,将该PCR产物直接测序并进行基因型别和系统发育分析.结果 687份腹泻患者粪便标本中男性感染者93例,女性感染者56例,性别差异无统计学意义(x2=1.193,P=0.275).患者主要为5岁及以下儿童.2015年湖北地区NV感染全年均有发生,但流行高峰出现在9月份;NV主要为GⅡ基因型,仅检出2例GⅠ基因型.系统发育分析显示,NV GⅡ流行株可分为5种基因亚型,分别为GⅡ.17、GⅡ.4 Sydney 2012、GⅡ.3、GⅡ.6和GⅡ.13,不同基因亚型的流行呈现月份更替现象.结论 2015年湖北地区存在多种基因型NV的感染,加强NV的分子流行病学监测有利于NV的科学防控.
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一起诺如病毒Ⅰ型胃肠炎暴发疫情危险因素分析
目的 了解诺如病毒Ⅰ型胃肠炎暴发疫情危险因素,为有效防控诺如病毒Ⅰ型胃肠炎暴发流行提供依据.方法 采用病例对照研究法,选取杭州市某校115例诺如病毒型胃肠炎患者作为病例组,同期该校非胃肠炎患者作为对照组;重点调查患者饮水与接触史.采用x2检验和分层分析诺如病毒Ⅰ型胃肠炎发病的关联因素.结果 病例组与对照组的桶装水饮用量经检验,差异有统计学意义(x2=14.72,P<0.01).饭前便后洗手(OR=0.37,x2=5.05,P=0.02)与同伴存在病例(OR=6.56,x2=40.82,P=0.00)是患病的相关危险因素,辣条为混杂因素(OR=1.86,x2=3.30,P=0.07).结论 桶装水在水质净化与消毒处理环节存在漏洞,可能导致污染,引发疫情暴发;随着饮水量的增加,患病的危险性增加.
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江门株诺如病毒重组鉴定及分析
目的:对诺如病毒(norovirus,NoV)NoV/Jiangmen056/2006/china和NoV/Jiangmen380/2006/china株进行重组鉴定分析.方法:用JV12Y/JV13I、COG2F/GⅡ SKR、JV12Y/GⅡ SKR三对引物对NoV基因组不同区域分别进行RT-PCR,PCR产物纯化回收、测序,利用Clustal X、MEGA4.1、SimPlot3.5.1软件分析其基因序列.结果:NoV/Jiangmen056/2006/china株由Lordsdal株的RdRp区和Mexico株的capsid区重组而成,而NoV/Jiangmen380/2006/china株由NLV/VannesL169/2000株的RdRp区和SaKaeo-53株的capsid区重组而成.结论:Nov/Jiangmen056/2006/china和NoV/Jiangmen380/2006/china是两种不同型别NoV重组株,而后者是国内首次检出的新型G Ⅱ.b NoV重组株,上述结果丰富了我国重组NoV的研究资料.
关键词： 诺罗病毒 重组 RNA依赖RNA聚合酶 衣壳 开放阅读框架
