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爪蟾卵母细胞表达体系在功能基因组学研究中的应用
非洲爪蟾卵母细胞表达体系是一种功能强大、适用范围广的表达体系,同时,也是应用早的表达体系之一.随着分子生物学的发展,以及检测技术的进步,其应用有了进一步的扩展,不同种类、不同功能的蛋白质均可以在其中表达,同时进行功能研究.本文着重介绍爪蟾卵母细胞的生物学特性,对于不同功能的蛋白质的表达及功能的研究,以及在功能基因组研究中的应用.
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蛋白质组学及其在儿童实体瘤研究中的应用
随着人类基因组"22作框架图"的完成,生命科学进入了后基因组时代,基因研究的重点从结构基因组学转向功能基因组学.蛋白质组学(proteomics)作为功能基因组研究的重要支柱,在20世纪90年代中期应运而生[1],并广泛应用于生物医学研究.肿瘤的发生和发展是由多种因子控制的复杂过程,应用蛋白质组学研究技术能够动态、整体、定量地观察肿瘤发生过程中蛋白质种类和数量的变化,鉴定出肿瘤特异性生物标记,以及潜在的药物治疗靶点,因此蛋白组学被广泛应用于肿瘤学研究.本文就蛋白质组学的概念、内容、基本技术及其在儿童实体瘤研究中的应用作简要综述.
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利用功能基因组学蛋白质组学等筛选抗结核新药
对利用功能基因组学、蛋白质组学、组合库技术发现和鉴定结核分枝杆菌的药物作用靶点,筛选组合化合物库发现药物先导物研究新化合物的作用机制进行了综述.表明综合利用功能基因组学、蛋白质组学、组合库技术有助于加速新机制、新来源抗结核新药的开发.
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基因表达谱的数据分析
基因表达谱分析是基因芯片技术的一个重要应用.对基因表达谱分析的一般流程,数据的早期处理包括矩阵转换和标准化过程,后期的矩阵数据分析包括无监督分析方法如层次聚类、K-均值聚类和自组织映射,和有监督分析方法如线性判别、决策树和支持向量机等的研究,将为更好的开发运用这种方法提供方向性的指导.
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鼻咽癌易感/抑瘤基因的功能基因组学研究
鼻咽癌组织在染色体3p,9p,6q,11q,13 q和14q等区域存在较高的等位基因不平衡,表明这些区域存在与鼻咽癌相关的抑瘤基因.采用cDNA代表性差异分析等方法成功获得了候选的鼻咽癌易感/仰瘤基因,并进行了基因功能研究.发现:(1)Cx基因的表达增强是由于肿瘤细胞为突破细胞通讯功能的障碍,试图重建细胞间隙连接的一种表达变异;(2)BRD7基因是一个与细胞周期调控密切相关的核转录调控因子;(3)NAG7基因具有双重生物学功能--在抑制低侵袭能力的HNE1细胞增殖的同时,能够增加HNE1和6-10B细胞的侵袭潜能;(4)NGX6可以与Ezrin发生交互作用,参与鼻咽癌转移;(5)SPLUNC1基因的表达下调是鼻咽癌早期预警的分子诊断标志物.这些易感/抑瘤基因的功能基因组学研究为阐明鼻咽癌的发病机制打下了坚实的理论基础.
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RNA干扰在生物基因治疗中的应用及意义
RNA干扰( RNAi)是指一种分子生物学上由双链RNA诱导的基因沉默现象,其机制是通过阻碍特定基因的翻译或转录来抑制基因表达。 RNAi以其高特异性、高效性等显著优势将成为研究基因功能的全新手段,在生物医学领域有着广阔的应用前景。本文拟就RNAi作用机制,及其在功能基因组学、基因治疗(如肿瘤、病毒、自身免疫性疾病等)领域的研究现状简要作一综述。
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生命科学时代的生物信息学
随着生命科学的迅猛发展,特别是作为生命科学前沿--分子生物学的发展,推动了科学的进步.有识之士公认21世纪为"生命科学世纪".而生物信息学的出现,刚好把生命科学与信息科学有机地结合在一起,成为21世纪生命科学时代倍受关注的新兴学科.
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代谢组学的进展及肝脏代谢组学
化的数据库;③种类少;④代谢产物具有通用性.
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抗体蛋白芯片技术在肾脏病研究中的应用
随着人类基因组计划的完成,生命科学进入了后基因组时代.众所周知,基因仅仅是遗传信息的携带者,而生命活动的真正执行者是基因的表达产物--蛋白质.为揭示众多蛋白质真实的功能以及相互作用,从而真正破解基因功能,以蛋白组学(Proteomics)为核心的功能基因组学成为后基因组时代研究的热门课题[1].
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功能基因组学的研究内容和方法及在肾脏疾病研究中的应用
众所周知,人类基因组计划(human genome project,HGP)的结果已经向人们公布了97%的人类基因序列,这意味着人类已掌握了自身基因的结构序列,而在人类基因组所蕴含的近30 000~40 000个基因中,迄今为止只有40%被克隆和鉴定,仍然有近60%的人类基因功能还是个谜[1,2].
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数字人--医学研究有关的新技术
什么是"数字人"?"数字人"(Digital Human)是通过计算机技术,将人体结构数字化,在电脑屏幕上出现看得见的、能够调控的虚拟人体形像.早期的研究报道称之为"可视人"(Visible Human)或"虚拟人"(Virtual Human).据科技部基础司和香山科学会议主编的2003年科学前沿报告<数字化虚拟人体以及我国的研究进展>中的表述,在世纪之交,生命科学研究中有两个值得重视的发展方向:一个是功能基因组学的研究,另一个是数字化虚拟人体的建设.可见,处在科学前沿的信息科学与生命科学交汇点上的"数字化人体研究",作为一种新的研究技术平台,已经令科技界人士瞩目.
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功能基因组学在微生物药物筛选中的应用进展
为了加快药物研发进展,解决日益严重的微生物耐药问题,新的微生物药物研究成为了近来研究的重点,其中药物的筛选已成为了新药开发的重要环节.随着分子生物学技术的深入发展,功能基因组学在微生物药物的筛选中得到了广泛的应用和发展.本文主要综述了近年来利用功能基因组学对微生物药物进行筛选的技术发展情况.
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药用植物代谢组学的研究进展
从技术步骤、分析方法 以及实际应用三个方面对当前药用植物代谢组学研究领域的一些理论问题和实践中面临的挑战进行综述.
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共振能量转移技术研究进展
随着2000年人类基因组计划的初步完成,生命科学开始迈进功能基因组时代.功能基因组学和蛋白质组学的研究成为生命科学的重点,尤其是生物功能团或生物大分子之间的相互作用成为研究的热点.
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染色质免疫沉淀技术及其在结直肠癌研究中的应用
基因表达调控是当前功能基因组学的一个重要领域,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核基因表达机制的基本途径.染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)技术近年被广泛用于研究体内染色质结构、组蛋白修饰在基因表达中的作用、灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,并已成为研究染色质水平基因表达调控的有效的方法[1],活跃表达基因的启动子和增强子等调节区域呈现组蛋白的高乙酰化,而沉默基因的相应区域则呈现组蛋白的低乙酰化[2,3].
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RNA干扰及其技术在临床医学中的应用前景
生物遗传信息从脱氧核糖核酸(DNA)转录为信使核糖核酸(mRNA),然后翻译为蛋白质.特定基因控制细胞制造特定的蛋白质.目前随着后基因组时代的到来,基因功能的研究已变得日益重要.RNA干扰是由与靶基因序列同源的双链RNA所诱导的一种特异性的转录后基因沉默现象,能高效特异阻断相关基因的表达,使目的基因表达沉默.RNA干扰是分子生物学领域近年研究的热点,并在功能基因组学、肿瘤基因治疗、抑制病毒复制、药物靶筛选和细胞信号传导通路分析等方面显示出广泛的应用前景.
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生物芯片在功能基因组学研究中的应用进展
目前,结构基因组学研究方兴未艾,功能基因组学研究又成为生命科学新的研究热点.作为世纪之交发展起来的一项集分子生物学、电子学、信息学为一身的生物高技术-生物芯片技术已日益成熟和完善,且其应用领域不断拓展,已成为后基因组时代功能基因组学研究中重要的技术之一.本文就生物芯片在突变及多态性检测、基因表态及调控研究、比较基因组学以及蛋白质组学等各功能基因组学研究方面的进展作一介绍.
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药物基因组学在药学中的应用
目的:促进药物基因组学研究,为新药开发和个体化给药提供参考.方法:阐述药物基因组学的产生、研究内容及其应用.结果与结论:药物基因组学作为功能基因组学在医药学中的应用,主要通过对基因多态性的研究,从根本上促进了新药开发和个体化用药的发展.
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蛋白质组学实验技术研究进展
人类基因组计划已取得了巨大的成就,几个物种(包括人类)的基因组序列已经或即将完成,生命科学已实质性地跨入了后基因组时代,研究重心已开始从揭示生命的所有遗传信息转移到在分子水平对功能的研究上.这种转向的第一个标志是产生了功能基因组学(functional genomics)这一新学科,即从基因组整体水平上对基因的活动规律进行阐述.而第二个标志则是蛋白质组学的兴起[1].
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RNA干涉技术在功能基因组学和医学研究中的应用
RNA干涉(RNAi)能特异性降解mRNA,在转录后水平抑制基因活动,作为新的技术平台将对功能基因组学研究和疾病的防治产生重要影响.RNAi能特异地"剔出"靶基因的表达及功能,可广泛地运用于基因功能的分析.RNAi是动植物在抗御病毒、转座子等外来基因侵袭或内源性基因变异的进化过程中发展起来的,利用这种内在的防御机制可望发展成为征服感染、肿瘤等疾病的有效的手段.