上海地区中国人黑素细胞皮质激素受体-4基因突变与肥胖相关性研究

黑素细胞皮质激素受体(MCR)-4(MC4R)是五种已被发现的MCR之一,由332个氨基酸残基组成,是七跨膜G蛋白偶联受体家族的成员之一,大量存在于中枢神经系统的各个区域中.近年来,中枢神经系统黑素细胞皮质激素能途径在介导人类与动物能量平衡及肥胖症发生发展中的作用,已受到人们广泛重视.初在1998年Giles等和Vaisse等就分别报道了单一家系中早期发病的严重肥胖症患者存在MC4R基因单一位点杂合子移码突变[1,2].到目前为止,在欧洲人群中已有十余个MC4R基因突变位点被相继报道.本研究对60例肥胖患者及20例体重正常无代谢综合征的志愿者进行了外周血DNA MC4R受体基因测序,以了解该基因在中国人群中的突变发生率及与肥胖症的关系.

新生儿炎症性肠病2例报告及文献复习

目的 分析新生儿炎症性肠病(IBD)的临床特点.方法 回顾分析2例确诊IBD新生儿的临床资料,并复习相关文献.结果 2例新生儿IBD均为男性,均表现为腹泻、口腔溃疡、发热;均有白细胞计数、C反应蛋白、降钙素原升高,血红蛋白、血小板、血浆白蛋白下降;抗感染、输血、补充白蛋白等治疗无效;经内镜检查和基因检测确诊新生儿克罗恩病(CD).结论 对于高度怀疑新生儿期起病的IBD,应积极行消化内镜及基因检测,尽早确诊并予规范治疗.

Wiskott-Aldrich综合征诊断治疗体会

目的 通过对Wiskott-Aldrich综合征(WAS)的临床经过、实验室检查和治疗的综合分析,来提高对该疾病的认识.方法 收集WAS患儿临床资料,先证者的外周血、血片及父母的外周血,应用聚合酶链反应(PCR)扩增后直接基因测序来诊断.结果 WAS是一种单拷贝基因缺陷病,连锁分析将WAS蛋白(WASP)基因定位位于X染色体短臂,基因序列中包括错义、无义、剪接位点突变及插入、缺失等,其母多为杂合子.结论 在儿科的血小板减少性疾病中,结合小年龄发病,伴有湿疹、反复感染史,均需要排除WAS.

基因变异检测技术在恶性肿瘤精准医疗中的应用

恶性肿瘤是严重威胁人类健康和社会发展的重大疾病,寻找科学的方法对其进行诊断、治疗和评估已成为近年来全球重要的公共卫生问题之一.随着医疗行业的不断发展,传统的肿瘤筛查、防治和预后评估手段在近几年发展迅速.但是考虑到肿瘤异质性和患者个体化的特征,精准化的疾病筛查、诊断、治疗等医疗模式将成为未来医疗发展的趋势.肿瘤领域的基因变异检测是精准医疗中重要的组成部分,其应用可涉及早期筛查、复发监测、靶向用药指导、疗效及预后评价等众多环节,但在临床运用中仍存在诸多局限,有待更深入的研究来推动肿瘤精准医疗的发展.本文就近年来基因变异检测技术在恶性肿瘤精准医疗中的发展历程以及应用进展作一介绍.

治疗白内障，眼药水有望代替手术刀

《自然》杂志报道用一种叫羊毛甾醇的物质可能逆转晶体蛋白的异常聚集，仅经滴眼液和玻璃体注射羊毛甾醇，就能有效改善白内障犬的症状。在一项基因调查中，研究人员们对3位患有严重先天白内障的儿童进行了基因测序和分析，并对其中2个的家庭成员进行了测序和系谱分析，发现患儿的羊毛甾醇合酶基因在关键位点上出现了突变，且来自父母的2份等位基因都有这样的突变。而患儿的父母晶体蛋白并未发生聚集，是因为患儿的父母各自仍带有1份正常的LSS基因。LSS指导着羊毛甾醇的合成，而后者常在眼球中富集。这种兼具亲水和疏水部分的分子，可能与规律排列的晶状体蛋白之间有着微妙的联系。有研究显示，羊毛甾醇不仅能在细胞培养皿中预防主要几类异常晶体蛋白的聚集，还能一定程度上让已经聚集的晶体蛋白重新分散开。有研究人员对7只不同品种的、患有白内障的狗进行了为期6周的治疗：每日3次滴羊毛甾醇眼药水，每3天向玻璃体腔内注射一定量载有羊毛甾醇的纳米颗粒。经过治疗后的狗，晶状体浑浊的情况都有了不同程度的改善。这暗示着有朝一日，白内障也许能够被眼药水治愈，而省去手术的繁杂和风险。

磺脲类降糖药物的基因组学研究进展

糖尿病是我国常见的慢性疾病之一,其并发症严重地影响着人类的健康并威胁着人类的生命.流行病学显示,糖尿病主要是受遗传和环境因素影响,是一种复杂的多基因疾病.目前对于糖尿病的治疗主要依据医师的临床经验,然而不同患者使用相同的降糖药物后常常表现出不同的疗效,药物不良反应也表现各异.自从1990年"人类基因组计划"启动以来,所有基因测序工作已基本完成,对于许多与遗传相关的疾病,人们期望能从基因水平深入认识药物反应的个体差异,为临床个体化给药开辟新的途径.药物基因组(pharmacogenomics)由此应运而生,并在近年来迅速成为研究热点.磺脲类降糖药是临床应用广泛的口服降糖药.现就磺脲类药物基因组学研究进展进行综述.

对“基因体检”说：“不”！

99.99%的基因准确率、一滴血知晓百病风险、可查1000多种遗传性疾病……近年来，在很多医疗机构、媒体宣传描述中，基因测序技术充满了神奇色彩。基因测序能否给健康人群下“判决书”？基因这个“潘多拉盒子”里究竟是什么？

福建地区稀有血型JK(a-b-)表型筛选及分子遗传学分析

目的 了解福建地区无偿献血者Kidd血型系统中JK(a-b-)表型的分布频率并分析其遗传学特征.方法 用尿素溶解试验筛查福建地区180626例无偿献血者JK(a-b-)表型;用经典血清学方法确证其表型;对JK基因的启动子、11个外显子及其侧翼区域(50 ～150 bp)扩增后测序并分析序列信息;用SNaPshot技术分析福建地区200例献血者JK基因的单核苷酸多态性(SNP).结果 180626例无偿献血者中检出15例JK(a-b-)表型个体.分析15例JK(a-b-)表型个体JK基因,检测出的4种隐性基因分别为JK* B(IVS5-1G＞ A)、JK* B(896G＞A)、JK* A(130G＞A,220A＞ G)和JK* B(130G＞A,956C＞T),这4种隐性基因分别占检出无效基因的66.67％、23.33％、6.67％和3.33％.分析上述200例献血者JK基因SNP发现,JK* B(IVS5-1G＞ A)为0.75％,JK基因的G130A是一种常见的多态性,未检测到A220G、C222T、C956T、G896A变异.结论 福建地区无偿献血人群中JK(a-b-)表型频率估计约为0.008％,JK* B(IVS5-1G＞ A)和JK* B(896G＞ A)是该地区JK(a-b-)表型的主要流行基因,发现1个新的引起JK(a-b-)表型的JK-null基因,即SLC14A1 130A,220G.

两部委叫停基因测序

2014年2月9日，食品药品监管总局、国家卫生计生委联合下发《关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知》（以下简称《通知》）叫停基因测序。根据规定，目前国内使用的基因检测仪器、诊断试剂和相关医用软件等产品，需经食品药品监管部门审批注册，并经卫生计生行政部门批准技术准入方可应用。已经开展的，要立即停止。
　　加强产品监管
　　《百科知识》杂志副主编张田勘表示：目前公众对基因测序认识存在误区，突出的表现在于认为基因测序可以“包测百病”。基因对人生老病死的作用只占约30%，而更多的因素在于外部环境和后天因素。即便只考虑内因，致病基因也需要在其他基因和分子的启动下才能表达和发挥作用。基因测序只是检测线性遗传信息，但是遗传信息的编码和表达不仅取决于脱氧核糖核酸（DNA）的线性序列，还取决于DNA 和染色质结构的表观遗传学修饰，包括DNA 甲基化、染色质构想变化、基因组印记等。即便一个人查出有癌症基因，也并非说这个人就会患癌症，而是需要异常的DNA甲基化以及后天的生活方式共同作用才有可能导致。

江苏省乙型肝炎病毒基因型分布与临床相关性

目的:了解江苏省乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布及其临床相关性.方法:选择江苏省HBV-DNA阳性慢性HBV感染者215例,其中HBsAg携带者3例,急性乙型肝炎3例,慢性乙型肝炎166例(轻度80例、中度50例、重度36例),肝硬化27例,原发型肝癌12例,重症肝炎4例,采用S区基因测序法检测HBV的基因型.结果:215例HBV-DNA阳性血清标本中,B基因型72例(33.5%),C基因型132例(61.4%),B+C基因型11例(5.1%);未发现A、D、E、F、G、H型;C基因型肝癌+肝硬化+重症肝炎+慢性乙肝(中度+重度)显著高于B型与B+C型(P＜0.05),C基因型的病程明显较B基因型和B+C基因型长(F=17.615),γ-干扰素B基因型感染者的血清含量比C基因型和B+C基因型感染者的血清含量显著高(F=13.652),S2+S3+S4方面C基因型比B基因型和B+C基因型显著增多(P＜0.05),结论:江苏省存在HBV的B、C和B+C三种基因型;以C基因型为江苏省优势毒株;并且C基因型病程长,肝纤维化程度明显,严重的肝病以及原发性肝癌的患者中所占比例显著高于其他基因型.

HBV拉米呋啶耐药相关基因及HBV基因分型的初步研究

目的: 利用基因测序技术,根据HBV S基因序列和HBV P基因区YMDD基因序列的特征,建立一种既可以诊断HBV基因型,又能检测拉米呋啶耐药突变的简便、可靠的方法.方法: 采用特异的引物对待检标本进行PCR扩增后作基因序列检测,利用Chromas2.23软件对测序结果进行分析有无突变产生,测序结果用软件DNASIS进行基因分型分析.结果: 61例经拉米呋啶治疗的慢性乙肝患者B型11例(18%),C型50例(82%).发生YMDD变异47例,变异检出率为77.0%.结论: 该方法能同时检测HBV基因型和YMDD变异,可以通过准确的P基因序列测定区分YMDD变异的类型,并可根据需要监测其他的伴随突变,进一步进行核苷酸多态性分析,对临床治疗和病情监控均有指导意义.

江苏汉族人群心脑血管病患者载脂蛋白E基因研究

目的:探讨用基因测序法检测载脂蛋白E(ApoE)基因多态性及其与心脑血管疾病之间的关系.方法:应用基因测序方法检测了193例心脑血管疾病患者和100例无血缘关系的健康汉族人群ApoE基因型.结果:ε3/3基因型高血压组频率为64.3%,高血压+冠心病组为57.7%,高血压+脑血管病组为62.2%均明显低于对照组的86%(P＜0.05);而ε3/4基因型频率,高血压组为21.4%,高血压+冠心病组为19.2%,高血压+脑血管病组为24.4%,均显著高于对照组的6%(P＜0.05);ε4/4基因型高血压+冠心病组频率为5.1%明显高于对照组0%(P＜0.05).分析等位基因频率,高血压组和高血压+冠心病组、高血压+脑血管病组ε3等位基因频率分别为80.7%,74.4%和78.9%,明显低于对照组92.5%(P＜0.05),ε4等位基因频率分别为12.1%,16.7%和14.5%,明显高于对照组的3.5%(P＜0.05),差异有明显统计学意义.两组间其它各基因型无统计学差异.结论:应用基因测序方法进行ApoE基因分型是全面、直接、可靠的方法;ε4等位基因是心脑血管疾病共同的遗传易患因子,而ε3等位基因具有保护作用.

两种HBV基因分型方法的比较及与临床的相关性

目的 S区基因测序、基因芯片两种乙型肝炎病毒基因分型方法 的比较,并分析基因型与临床表现的关系.方法 用S区基因测序、基因芯片两种方法 分别对50例标本[HBsAg携带者3例,急性乙型肝炎3例,慢性乙型肝炎40例(轻度21例、中度13例、重度6例),肝硬化4例]进行乙型肝炎病毒基因分型,比较分型结果 及其与临床表现的关系.结果 两种方法 均能成功对50例标本进行分型,并且两种方法 分型结果 完全一致,基因分型重复符合率100%,50例标本中B型17例(34.0%),C型31例(62.0%),B、C混合型2例(4.0%).结论 基因芯片技术与S区基因测序结果 完全一致,乙型肝炎病毒基因型与临床表现有相关性,C型多见于严重肝病.

疑难ABO血型标本的血清学与基因测序分析

目的：分析疑难ABO血型标本的表型与相应等位基因。方法采用试管法检测32例患者及献血者的血清学表型，Sanger双碱基DNA分子测序方法检测ABO等位基因。结果32例ABO血型亚型的表型中，A抗原性减弱、B抗原性减弱、AB抗原性减弱、CisAB和B（A）分别为7、4、8、6和7例；出现的等位基因有 A101、A102、A311、Ael、Ax02、Ax13、Bw03、Bw11、O01、O02、CisAB01、CisAB08、B（A）02和B（A）04等。结论血清学方法对疑难ABO血型，尤其是亚型的鉴定存在一定的局限性，血型基因测序分析的方法可以较好地厘清血清学模糊的定型结果。

精准医学理念在临床实践中的运用进展

随着基因组学、功能基因组学及计算机技术的飞速发展，精准医学在继循证医学之后应运而生。精准医学不但引领临床医师从分子生物学本质思考疾病并实现准诊断，同时也要求临床工作者运用患者的遗传信息去寻求佳的治疗靶点从而实现精准治疗。美国和中国自2015年相继启动精准医学计划，精准医学的时代即将来临。该综述将从基因测序、大数据整合、分子病理、精准无创产前诊断、精准肿瘤医学这几方面，就目前精准医学理念在临床实践中的运用加以阐述。

侵袭性曲霉病患者 Toll 样受体4基因变异的初步研究

目的： Toll样受体（ Toll-like receptors， TLRs）家族是重要的病原识别受体，动物实验发现TLR4－／－小鼠更容易感染曲霉。文中探讨我国汉族人群TLR4基因编码区变异情况以及该基因变异与侵袭性曲霉病（ invasive aspergillosis， IA）易感性的关系。方法回顾性收集2011年6月至2012年12月南京军区南京总医院确诊为IA的25例住院患者设为IA组，其中男性17例，平均年龄（52．4±12．3）岁，有基础疾病12例、无基础疾病的13例；健康体检者103例设为对照组，其中男性70例，平均年龄（56．0±17．2）岁。所有研究对象均来源于汉族人群。采集研究对象外周静脉血，提取外周血中DNA，采用聚合酶链式反应（ PCR）扩增TLR4基因编码区序列后测序，测序结果与NCBI GenBank中的TLR4编码序列进行比对，并分析基因突变引起的氨基酸改变以及对蛋白质功能的影响。比较IA组与对照组TLR4基因突变率的差异。结果研究共发现2个突变点，分别为219 C＞G和1420 C＞T，均为错义突变。蛋白结构预测结果显示219 C＞G突变导致TLR4识别病原体的功能区改变，TLR41420 C＞T未引起结构域改变。 IA组TLR4的突变频率为8％（2／25），2例TLR4基因突变的患者均无基础疾病；对照组未发现突变，2组间比较差异有统计学意义（ P＝0．037）。结论 IA患者存在TLR4基因编码区错义突变（219C＞G与1420C＞T），该基因的突变可能增加机体对IA的易感性。

基因测序在人类腺病毒分型中的应用

人类腺病毒可引起呼吸道、胃肠道和眼部的感染,不同类型的腺病毒引起的疾病类型及表现不尽相同.因此,腺病毒的分型具有重要的临床研究价值.在基因学上,编码六邻体蛋白,五邻体蛋白和纤维蛋白的区域是腺病毒基因组中变异大的区域,通过对其编码区的测序,尤其是六邻体蛋白编码区的测序,是快速可靠的确定腺病毒类型的重要方法之一.此文主要对基因测序在腺病毒分型中的优势、应用现状,在腺病毒突变重组、种系发生学中的鉴定检测等作一综述.

人类博卡病毒的检出及病原学初步研究

目的 了解粤东地区喘息性疾病患儿的感染病原中是否存在人类博卡病毒(HBoV),并探讨其感染的临床特征.方法 收集急性喘息性疾病患儿鼻咽抽吸物(NPA)246份和健康体检儿童的NPA 83份,应用针对HBoV的核衣壳蛋白基因(VP1/VP2基因)的PCR引物进行HBOV基因片段检测.随机选取HBoV基因检测阳性样本中的7份,对其PCR扩增产物直接进行核苷酸序列测定,将所测到的序列与GenBank中的基因序列进行比较分析.同时,对HBoV PCR阳性病例临床资料进行分析.结果 246份样本中HBoV基因检测阳性的有13份,阳性率为5.8%(13/246);HBoV检测阳性样本主要分布于＜1岁的患儿,占阳性病例的72.9%(10/13),尤其是＜5个月者占阳性病例的53.8%(7/13).基因序列分析表明,本研究中7份HBoV之间基因序列的同源性在99.7%～100%之间;与WLL-1株相应片段的核苷酸同源性为98.1%～100%,与HBoV st1株的同源性为97.6%～98.5%,与HBoV st2株的同源性为98.1%～99.8%.相应的患儿均表现咳嗽、呼吸困难及喘息等临床症状,除1例诊断为哮喘急性发作外,其余为喘息性肺炎(5例)和毛细支气管炎(7例).83份健康体检儿童的呼吸道样本中均未检测到HBoV特异性基因片段.结论 粤东地区儿童急性呼吸道感染引起的喘息性疾病中,有部分系HBoV感染引起;且HBoV感染在低年龄组儿童常见,其临床表现与普通的喘息性肺炎和毛细支气管炎类似.

088 基因测序探索A群链球菌的毒力

基因测序完成难治之症将有法对付从生命之书破译说基因的奥秘

人类生命的基础是细胞人体基本的功能单位是细胞.人体的生理活动虽然很复杂,但作为基本机能单位的细胞体积却很小.人体内一般细胞的直径只有20～30微米(1微米=1/1000毫米).