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用全基因组测序追踪临床重要耐药菌院内感染的暴发流行
新一代高通量测序技术的成熟和普及使微生物基因组学获得长足发展,采用全基因组序列分析追踪和溯源临床重要耐药菌院内感染的暴发,已成为近年临床微生物研究领域的热点,并形成了一个新的学科方向——基因组流行病学.在将全基因组序列分析用于临床耐药菌流行溯源时,可利用基因组数据的强大分辨率和丰富信息,在进行菌株充分分型的基础上,更精确地判断耐药菌同源性的远近,分辨出不同的进化路线,推断耐药菌在医院环境中的演化过程,这对临床耐药菌院内感染控制工作意义重大.
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耐药细菌产生与传播的原因
抗生素是由真菌、细菌或其他生物在繁殖过程中所产生的一类具有杀灭或抑制微生物生长作用的物质,也可用人工修饰和合成的方法制造,该类物质是保障人类健康的主要医药资源之一。据统计,自20世纪青霉素问世后的20年间(1935-1955年),人类平均寿命延长了近8岁。在过去的70多年间,人类已经发现和研制了200多种临床用抗生素,几乎将真菌和其他生物为抵御细菌经过千万年进化而产生的生物资源挖掘殆尽。20世纪50-70年代抗生素研制的黄金时期过后,批准上市的新抗生素在逐渐减少。虽然人类还在努力开发新的抗生素,但无论是天然抗生素,还是合成抗生素,其研发均日益耗时、费力,现阶段一个新抗生素从研发到上市至少需要10年,投资达数十亿美元之多。鉴于这些原因,制药工业巨头纷纷撤离抗生素研发领域。
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牡蛎污染耐药性细菌调查及整合子检测
目的 对水产品牡蛎污染耐药性细菌进行调查,并检测其携带整合子类型,为细菌耐药机制研究提供依据.方法 利用抗性培养基平板筛选牡蛎标本中的耐药性细菌,用K-B法进行药敏试验,PCR法扩增Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型整合酶基因. 结果 34份牡蛎标本分离出76株耐药株,其中超过90%的分离菌对四环素、氨苄西林耐药,诺氟沙星、左氧氟沙星、复方新诺明、环丙沙星、头孢唑啉和氯霉素耐药>50%,有2株对耐亚胺培南细菌.整合酶基因检测结果显示80.26%耐药细菌携带Ⅰ型整合子,其中6株同时携带Ⅱ型整合子,未检测到Ⅲ型整合子.所有携带整合子的耐药细菌是多重耐药,不携带整合子耐药细菌中多重耐药占60%. 结论 牡蛎污染细菌的耐药性严重,且多重耐药与携带整合子有关,携带整合子细菌更易产生多重耐药,提示整合子可作为食品分离菌的耐药性检测靶标.
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分子流行病学在细菌耐药性研究中的应用
流行病学方法在细菌耐药现象研究传统意义上的应用是通过监测、观察以及分析和实验研究等方法来明确耐药细菌分布的规律及其影响因素,借以探讨耐药细菌的流行与传播规律,并为制订预防和控制措施提供科学依据。尽管存在一些不足,此类研究结果在帮助人们认识耐药细菌的传播与流行规律中仍发挥了重要作用[1-2]。与此同时,还有许多研究探讨了不同分子型别耐药细菌以及与细菌耐药性相关的各种因子(如耐药质粒、耐药基因、相关基因组件等)的分布、作用方式与程度、传播规律及其影响因素等问题,即有关细菌耐药性的各种问题。此类研究能够揭示细菌耐药性在耐药细菌中(或间)的存在现状、发生发展和相互传播的规律。将此类研究与耐药细菌流行病学研究(细菌耐药监测和耐药细菌传播相关因素分析等)相结合可构成有关细菌耐药现象的多层次流行病学( multilevel epidemiol-ogy),涵盖相关的人群特征、细菌群个体或克隆特征、耐药质粒、耐药基因以及相关的移动组件特征等[3-4]。有关细菌耐药性的流行病学研究按照研究内容可分为两大类:一类是通过各种分子分型方法对耐药细菌的分布、传播规律等问题进行流行病学分析,通常被称为耐药细菌的分子流行病学研究[5]。另一类是研究与细菌耐药性相关的各种分子(如质粒、耐药基因以及与其相关的调控基因等)的分布及其与细菌耐药性发生发展过程的关系和影响因素,也就是对与细菌耐药性相关的各种分子进行分布与传播规律等方面的流行病学研究[6]。本研究尝试就以上两类研究进行简单综述,借以与相关领域内的同行们进行探讨。
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医院获得性感染的预防及细菌耐药的控制
约有25%~35%的住院患者应用抗生素,用于治疗活动性感染或预防潜在的感染,同时对耐药细菌的产生和传播产生了巨大的选择性压力.美国每年即有200万人罹患医院获得性感染,多数由耐药细菌引起,治疗花费甚巨,估计医疗费用7~12亿美元,其他相关花费(如继发感染、误工费、护理费,其他)总计在300亿美元左右.简单的感染控制措施(如洗手和戴手套)能够减少医院中感染的播散,降低抗生素消耗,减轻导致耐药细菌播散的选择性压力.
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综合重症监护病房下呼吸道感染患者痰标本病原菌及耐药性分析
重症监护病房(intensive care unit,ICU)患者由于基础疾病重、并发症多、机体免疫功能低下、侵入性医疗操作等原因,导致ICU感染发生率是普通病房的4~5倍[1].随着抗生素的广泛使用,病原菌的耐药率不断升高,出现多重性耐药和泛耐药细菌[2].定期了解ICU下呼吸道感染患者病原菌分布及耐药情况,对提高临床抗菌药物经验治疗的水平,合理使用抗菌药物具有重要指导意义.本研究通过对2011年1月至2012年12月煤炭总医院综合ICU下呼吸道感染患者痰培养分离病原菌构成及药敏性进行回顾性分析和总结.
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药物联用对耐甲氧西林表皮葡萄球菌的体外抗菌活性探讨
随着抗菌药物的广泛使用,耐药细菌不断出现.耐甲氧西林表皮葡萄球菌(MRSE)的耐药性主要表现为耐受多种抗菌药物. 由于万古霉素对许多细菌,包括对MRSE的敏感性远高于其他药物,因此,人们一直认为万古霉素是抗菌药物中有效者之一.但是,由于近年MRSE对万古霉素的敏感性降低,有些细菌已出现万古霉素耐药株,万古霉素这一优势受到挑战[1].人们除了努力寻求更有效的新的治疗药物外,探讨合理的抗菌药物联用方案是必要的.为此,我们参考了日本等国研究情况[2-4],测定了去甲万古霉素与其他抗菌药物联用对MRSE的体外抗菌活性,以便为临床提供联合用药治疗MRSE感染的试验依据.同时,试验相同的抗菌药物联用方案对同种不同株细菌的联用效果,探讨实验室开展联合药敏试验的必要性.
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新型甘氨酰环素类抗菌药物替加环素的体外药敏试验操作规程
[编者按]替加环素(tigecyclin)是一种甘氨酰环素(glycylcycline)类抗生素,是半合成四环素米诺环素的衍生物.替加环素在细菌核糖体水平上抑制蛋白质合成,是针对MRSA及泛耐药鲍曼不动杆菌等耐药细菌有效的广谱抗菌药物.替加环素于2005年在美国上市,目前全球共有50多个国家和地区批准和上市了替加环素,预定2009年底将在中国上市.
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甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌感染与对策
耐药细菌引起的感染越来越受到临床医生的关注,特别是甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)已经成为医院感染的重要病原菌,而发生在社区的MRSA(community-associated MRSA,CA-MRSA)感染更是病情凶险,有效的治疗药物少.
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重症医学感染的管理
目前重症医学面临的大挑战是感染,它是导致重症患者死亡的主要原因之一,临床上针对感染及其并发症的治疗支出占总支出的40%以上.抗生素的诞生开启了感染治疗的新篇章,使许多患者重获了新生,但大量抗生素的滥用,也导致耐药细菌产生的不断增快,毒力不断增强.如果只考虑应用抗菌素去治疗感染的观念是非常狭隘的.在重症医学领域中,感染的预防与治疗已经不是单一的临床问题,它更是一种综合的感染管理.现将感染管理的主要内容简单介绍如下.
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幽门螺杆菌临床治疗中抗菌药物耐药现状及其耐药机制
细菌对抗菌药物耐药是21世纪全球公共健康面临的重要挑战,耐药细菌的出现令临床根除治疗十分棘手。幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染世界上超过一半以上的人口,我国的感染率约为40%~90%[1],是引起慢性胃炎、消化性溃疡的主要致病因子,如不进行根除治疗感染将持续存在[2],然而不断上升的抗菌药物耐药率降低标准三联方案的疗效,在大多数国家根除率<70%[3],低于Maastricht Ⅲ共识意见提出根除率应至少>80%的目标[4]。
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医院感染有效监控与合理治疗的实践与认识
目的探讨医院感染监控与治疗.方法对1993~2003年传染病院肝脏疾病患者,医院感染状况进行回顾性分析.结果医院感染疾病,原发性细菌性腹膜炎居首,败血症其次,深部真菌感染发生率17%,肝衰竭患者中发生率占32%,病死率高达82.1%;真菌性肺炎感染率是真菌感染的51.2%,病死率占94.7%;医院感染优势病原菌,革兰阴性菌占60%~70%,大肠埃希菌居首占45.6%;真菌感染中白色念珠菌为主要菌占79%,曲霉菌占13.1%;产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)细菌、凝固酶阴性葡萄球菌占85%,肠球菌属占40%,大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌分别为23.2%和23.8%.结论医院感染危及生命、病死率高是真菌性肺炎和真菌性败血症;多种耐药细菌警示,产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)细菌增多,耐药菌与抗生素管理监控和合理治疗是关键.
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孝感地区新生儿科消毒质量监测
目的 了解孝感地区13所医院新生儿科消毒状况,找出存在的问题,提出改进措施,预防与控制医院感染的发生.方法 按照2002年版《消毒技术规范》对孝感地区13所医院新生儿科的空气、各种物体表面、医护人员手、使用中消毒液、暖箱湿化水、婴儿奶具进行现场抽样检测.结果 共采样251份,合格180份,总合格率为71.7%;合格率低的是病房空气及暖箱湿化水,为23.1%、25.0%;其次是输液泵推动按键,合格率为41.7%;门把手、浴巾、奶具监测的合格率相对较高,分别为92.3%、96.2%、92.3%;医务人员手合格率77.5%;共检出6种细菌81株,主要为枯草芽胞杆菌黑色变种芽胞28株、凝固酶阴性葡萄球菌17株及金黄色葡萄球菌13株、大肠埃希菌12株等,均为多药耐药菌株.结论 应进一步加强新生儿病房空气、暖箱湿化水及各种物体表面的消毒管理,增强医护人员手卫生的依从性,全面提高消毒卫生质量.
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恶性血液病患者化疗后并发败血症的临床分析
目的 研究恶性血液病患者化疗后并发败血症的易感因素、病原菌分布、感染部位、预后及治疗,为临床合理使用抗菌药物提供参考依据.方法 回顾性分析2008年1月-2011年12月80例恶性血液病患者化疗后并发败血症的临床资料及药敏试验结果.结果 80例恶性血液病并发败血症患者中有68例处于化疗后粒细胞缺乏期占85.0%,;大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌是前3位病原菌,分别占32.5%、20.0%、8.8%;革兰阴性菌和革兰阳性菌敏感药物分别为美罗培南和利奈唑胺;以碳青霉烯类为主的经验用药可以覆盖81.6%的败血症病原菌.结论 革兰阴性菌是恶性血液病化疗后合并败血症的主要致病菌,以碳青霉烯类为主的经验性降阶梯治疗可提高败血症的治愈率;粒细胞缺乏、并发肺部感染、合并感染性休克、血液病疾病状态及经验用药与药敏相符度是影响转归的因素.
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美国HICPAC医疗保健机构多药耐药菌管理指南(2006)
2006年,美国HICPAC发布了Jane D. Siegel博士等编写的医疗保健机构多药耐药菌管理指南,全文74页,内容十分丰富,引用参考文献412篇.鉴于我国医疗机构中耐药细菌,特别是多药耐药菌的感染与传播已成为人们普遍关心但处理十分棘手的问题,特将该文中关于如何预防与控制多药耐药菌传播部分的指南编译,供感染控制和临床医务人员参考.
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医院感染常见耐药菌的药物治疗
目的对医院感染常见耐药菌的耐药特点及抗菌药物应用对策进行综述,为临床合理使用抗菌药物提供参考.方法查阅文献资料,分类总结.结果治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌感染,用糖肽类抗生素;治疗耐万古霉素肠球菌感染,需根据药敏结果联合用药;治疗铜绿假单胞菌感染可选用头孢他啶、哌拉西林/他唑巴坦,亚胺培南/西司他丁、阿米卡星等药物;治疗产超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌感染,可选用头霉素类、碳青霉烯类、四代头孢菌素类药物或大剂量β-内酰胺类药物+酶抑制剂;治疗产AmpC β-内酰胺酶的阴沟肠杆菌感染,可选用碳青霉烯类或四代头孢菌素类药物;治疗不动杆菌感染,需根据药敏结果选用氨基糖苷类、氟喹诺酮类或碳青霉烯类药物.结论合理使用抗菌药物,提高医院感染治愈率,减少耐药菌产生.
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临床主要耐药菌流行趋势
根据不同多中心耐药监测结果,分析临床常见耐药菌如耐青霉素肺炎链球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐万古霉素肠球菌、产超广谱酶的肠杆菌科细菌、多重耐药铜绿假单胞菌和不动杆菌等对常见药物的敏感性及流行趋势,为临床合理应用抗菌药物提供参考.
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医院感染的管理
医院感染作为全球性问题,给患者和公共卫生带来了沉重负担.医院感染尤其是外源性交叉感染是可以预防的,即使是内源性医院感染,也可以通过预防减少.预防与控制医院感染的管理措施包括:建立医院感染管理组织,明确医院感染管理岗位责任制;切实执行医院感染预防与控制措施;落实人员培训,提高感染预防意识.良好的医院感染管理可预防感染,阻止感染的传播,在预防耐药细菌感染中具有重要作用.
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我院2009年耐药菌目标性监测及防控对策
多重耐药细菌的检出率在全球均呈逐年升高的趋势,易引起交叉感染,甚至引起医院感染的爆发.
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抗生素在妇产科围手术期的预防应用
手术后感染一直是困扰外科医生的一大难题.抗生素的使用作为预防术后感染的重要治疗手段,不仅能有效地减少感染,还能降低治疗费用.妇产科手术多属二类切口手术,存在细菌感染的可能性,有使用预防性抗生素的指征.因此,应用抗生素预防感染是必要的,但抗生素的不规范使用正在造成耐药细菌的增加,导致新的感染不断出现,同时也增加了患者的经济负担.如何在为手术期正确地预防性应用抗生素是妇产科医生的研究热点.也是临床药师关注的重点.本文对妇产科手术常见感染菌及3类常见手术预防性应用抗生素作了综述,指出对妇产科手术切口感染的预防需同时考虑需氧和厌氧菌,抗生素的选择应包含这两类菌.常规可选头孢类和甲硝唑.有认为甲硝唑可换为替硝唑,因后者胃肠道反应比甲硝唑小得多,价格也适中.围术期预防用药时间为术前30min至术后24-48h内,因为细菌在有效抗菌血药浓度很少能生存超过48h,故一般认为术后48 h未感染的切口,再继续使用抗生素已无必要.