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hURAT1基因3′非编码区SNP筛查及与原发性高尿酸血症的关系
目的 在人尿酸盐转运蛋白1(hURAT1)基因3′非编码区(3′UTR区)筛查与原发性高尿酸血症关联的单核苷酸多态性(SNP).方法 对原发性高尿酸血症病人273例、健康体检者29例(正常对照组),采用酚-氯仿法提取外周血白细胞基因组DNA,特异性引物扩增3′UTR区,并进行基因测序,对基因型及频率进行分析.结果 共检测到3种SNP,分别为1925 >A、del 1951及 217 A,上述SNP位点所组成的基因型频率在高尿酸血症病人组和正常对照组差异无显著性.2例原发性高尿酸血症病人hURAT1基因3′UTR区第1827-1828位2个碱基缺失(del TC 1827-1828),这2例病人的血尿酸水平明显高于其他病人,正常对照组未检测到该缺失.结论 3′UTR区存在3个SNP位点,其中del TC 1827-1828位点可能是原发性高尿酸血症致病位点.
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噪声性听力损失人群易感基因的研究进展
噪声性听力损失(noise-induced hearing loss,NIHL)是一种由于遗传和环境因素相互作用的复杂疾病.目前,关于其遗传方面的研究,主要集中于单基因遗传性耳聋、抗氧化、内耳钾离子循环途径及其他基因.目前,有研究前景的NIHL基因包括KCNQ4、KCNE1、CAT、PCDH15、MYH14及HSP70,因为它们可分别在两个(波兰和瑞典)或三个(波兰、瑞典和中国)大样本量的群体中被复制成功.随着高通量基因测序分型方法的发展,在单个序列中检测数百和数千个单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,SNP),发现年龄相关性听力损失(age-related hearing loss,ARHL)基因、肿瘤标志基因[如人类8-羟基鸟嘌呤糖苷酶基因(hOOG1)]等与NIHL易感性相关,这无疑将引领NIHL易感性基因的鉴定新方向.本研究就目前对NIHL易感基因的研究状况进行综述.
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机体自发清除丙型肝炎病毒和主要组织相容性复合体区域单核苷酸多态性关联的初步研究
目的 了解中国丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染人群机体自发清除HCV和主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)区域单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的关联性.方法 选择96名抗-HCV阳性并成功随访1年的献血者为研究对象,分为自发清除组(HCVRNA阴性)和慢性感染组(HCV RNA阳性),采用Illumina MHC Mapping Panel试剂盒对两组人群进行MHC区域的SNPs检测,利用SPSS16.0分析软件、Matlab软件编程,采用t检验、x2检验及分层分析等方法对各SNP位点及性别、年龄因素与HCV清除与否进行关联性分析.结果 获得HCV自发清除组和慢性感染组样本分别为19份和77份.两组间年龄差异无统计学意义(t=0.610,P=0.543),HCV自发清除组中女性感染者的比例明显高于男性(x2=17.668,P=2.63×10-5).检测的1 293个SNPs中,rs2246626 (x2=10.777,P=0.001)、rs12386522 (x2=7.725,P=0.005)、rs2534679(x2 =7.522,P=0.006)和rs1264457 (x2=6.821,P=0.009)与HCV的自发清除显著相关.结论 MHC区域共发现4个与HCV自发清除存在显著性关联的SNPs,女性发生HCV自发清除比例高于男性.该结果将为进一步研究机体自发清除HCV和MHC基因的关联奠定基础.
关键词： 丙型肝炎病毒 自发清除 主要组织相容性复合体 单核苷酸多态性 -
腰椎间盘退变分子遗传学研究进展与转化医学应用
探讨腰椎间盘退变分子遗传学研究进展与转化医学在康复医学中的应用.对腰椎间盘退变相关基因和蛋白表达及转化医学在康复诊断、治疗、预后中的应用进行研究.腰椎间盘退变具有一定的遗传易感性,可能与人群中存在基因单核苷酸多态性有关,主要包括腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎滑脱、腰椎节段不稳、腰椎退变性侧凸等.腰椎间盘退变相关基因单核苷酸多态性将有助于揭示腰椎间盘退变的分子遗传学机制,并为未来的转化医学研究和康复医学临床实践提供基础.
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非小细胞肺癌铂类化疗药物基因组学研究
基于铂类的联合化疗是当前非小细胞肺癌（non-small-cell lung cancer，NSCLC）治疗的主要途径之一，而不同患者的临床疗效差异较大。遗传因素是影响 NSCLC 铂类化疗疗效的重要因素之一，大量 DNA损伤与修复、药物代谢与解毒、细胞周期和凋亡、药物转运体与膜受体相关基因的变异都可以影响 NSCLC 铂类化疗药物化疗敏感性。本文将对上述内容进行系统全面的总结，并探讨建立准确预测 NSCLC 铂类化疗疗效的药物基因组学模型的可能性。
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SIRT1基因的rs2273773和rs7895833突变与汉族人群冠状动脉疾病风险相关性分析
目的 旨在调查汉族人群冠状动脉疾病患者SIRT1基因rs2273773和rs7895833的单核苷酸多态性.方法 共纳入77例冠状动脉疾病患者和80例对照者.所有冠状动脉疾病患者通过血管造影术确诊.通过巢式聚合酶链反应测定SIRT1基因rs2273773和rs7895833多态性的基因分型.结果 发现在中国汉族人群中,冠状动脉疾病患者和对照组SIRT1基因rs2273773和rs7895833的基因型频率差异无统计学意义(P>0.05).本研究人群具有相比于发表的荷兰人群rs7895833的显著不同的等位基因频率.结论 SIRT1基因遗传变异体rs2273773和rs7895833与中国汉族人群冠状动脉疾病无关.
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4个乳腺癌相关 SNP 在河南女性乳腺癌中的关联性研究
目的：选择已在欧洲和亚洲人群中证实的与乳腺癌相关的基因多态性位点，进一步验证其在河南地区女性乳腺癌人群中的风险并分析其与乳腺癌内在分型的相关性。方法在253例乳腺癌病例组和343例乳腺良性病变对照组人群中，采用imLDR技术对rs2046210（6q25.1）、rs2981582（EGFR2）、rs889312（MAP3K1）、rs3803662（TOX3／TNRC9）进行基因分型。据雌激素受体（estrogen receptor，ER）、孕激素受体（progesterone receptor，PR）、人类表皮生长因子受体2（human epidermal growth factor receptor 2， HER2）、增殖指数Ki67的表达将乳腺癌分为5型：Luminal A、Luminal B、HER2-enrich、Luminal HER2、三阴性乳腺癌（triple negative breast cancer，TNBC）。结果 rs2046210（6q25.1）、rs2981582（EGFR2）、rs889312（MAP3K1）3个位点不同的基因型在病例组与对照组中的分布差异无统计学意义（ P值分别为：0.421，0.459，0.468），而rs3803662（TOX3／TNRC9））不同的基因型在病例组与对照组中的分布差异有统计学意义（P＝0.037）。在共显性遗传模型（OR＝2.19，95％CI：1.19～4.02）及隐性遗传模型（OR＝2.06，95％CI：1.15～3.70）中，与AA、GA相比，GG增加了乳腺癌的患病风险（ P值分别为：0.012，0.015）。 rs2046210（6q25.1）、rs2981582（EGFR2）、rs889312（MAP3K1）、rs3803662（TOX3／TNRC9）的不同等位基因型在不同的乳腺癌分型中没有区别。结论来自于GWAS的4个位点并没有完全被证实与河南地区的女性乳腺癌发病风险相关，仅有rs3803662（TOX3／TNRC9）与河南地区女性乳腺癌的发病风险相关。4个位点的不同基因型在乳腺癌的各种分型中分布没有差别。
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Galectin-3基因多态性与乳腺癌相关性的研究
目的：探讨Galectin-3（ lectin， galactoside-binding soluble ， LGALS3）基因-191位基因多态性（ rs4644）与中国女性乳腺癌发生的关系。方法应用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（ reaction-re-striction fragment length polymorphism ， PCR-RFLP）方法检测172例乳腺癌患者肿瘤组织和17例良性乳腺组织rs4644基因型，随机选取（随机数字由计算机生成）10例PCR样本测序，验证PCR-RFLP的实验结果。结果乳腺癌患者中CC、CA及AA基因型的频率分别是72.7％、25.0％及2.3％，良性对照组中则分别为52.9％、41.2％及5.9％；乳腺癌患者中C、A等位基因的频率分别为85.2％、14.8％，良性对照组中则分别为73.5％、26.5％；二者基因型及等位基因的频率差异无统计学意义（ P＞0.05）；rs4644 A等位基因更容易出现在肿物 T ＞2 cm（χ2＝8.295，P ＝0.004）及 Ki67＜14％的乳腺癌人群（χ2＝3.917，P ＝0.048）。结论 Galectin-3基因191位基因多态性rs4644与乳腺癌的发生无明显相关性，其与肿瘤大小及Ki67密切相关。
关键词： 乳腺癌 Galectin-3 单核苷酸多态性 -
山东省济源市汉族女性MTHFR与MTRR基因多态性分布研究
目的 探讨山东省济源市汉族女性MTHFR、MTRR基因多态性的频率特征,为孕妇增补叶酸和神经管畸形一级预防提供依据.方法 以济源市564例孕前及孕早期的汉族女性为研究对象,检测MTHFRC677T、A1298C和MTRR A66G的基因分型.统计分析基因多态性的频率特征,并与已报道的其他地区汉族女性的数据进行比较.结果 济源市汉族女性的MTHFR C677T基因型和等位基因频率,与烟台、镇江、松滋、德阳、昆明、广州、琼海等地比较差异有统计学意义(P＜0.05).MTHFR A1298C基因型和等位基因频率,与镇江、松滋、德阳、昆明、广州、琼海等地比较差异有统计学意义.MTRR A66G等位基因频率,与德阳、广州、琼海等地比较差异有统计学意义.结论 济源市汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性频率不同于其他地区,具有地域特异性.
关键词： 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性 -
辽源市满族和汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶和甲硫氨酸合成酶还原酶基因单核苷酸多态性调查
目的 调查辽源市满族、汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR) C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR) A66G单核苷酸多态性的特征并进行比较.方法 收集辽源市273例汉族女性和100例满族女性的口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,通过荧光定量PCR方法进行MTHFR和MTRR基因多态性检测.统计分析本地区满族和汉族女性基因多态性的分布特征的差异.结果 MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G 3个位点多态性在满族和汉族女性间的差异均无统计学意义(P＞0.05),而MTHFR A1298C位点等位基因分布情况在两民族女性间的差异具有统计学意义(P＜0.05).结论 辽源市满族和汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性分布差异无统计学意义,可能与民族亲缘关系相近或满族汉化有关.
关键词： 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性 -
MTHFR基因多态性检测在生殖健康领域的临床价值
5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(5,10-methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)是催化人体内叶酸代谢的关键酶,该酶具有多种基因多态性.众多研究表明其基因多态性会影响体内叶酸及同型半胱氨酸(homocysteine,HCY)水平,与神经管畸形、复发性流产、妊娠期高血压等疾病的发生密切相关,严重影响母婴健康.本文就该基因多态性的检测在生殖健康领域的临床应用价值作一综述.
关键词： 5 10-亚甲基四氢叶酸还原酶 单核苷酸多态性 临床价值 -
广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性关系分析
目的 探讨广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性的关系.方法 随机抽取广州番禺区汉族人群中120例2型糖尿病患者为研究组,120例健康正常人为对照组.采集两组研究对象的DNA,通过PCR-RFLP,对两组研究对象的Preproghrelin基因rs96217位点的基因型及组间基因型等进行对比分析.结果 研究组120例样本中,90例CC,基因型频率为0.750;26例AC,基因型频率为0.217;4例从,基因型频率为0.033.对照组120例样本中,99例CC,基因型频率为0.825;21例AC,基因型频率为0.175;0例从,基因型频率为0.00％.组间基因型与等位基因频率对比,结果无统计学差异(P＞0.05).结论 广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性之间无统计学差异,但2型糖尿病患者存在AA基因型,健康正常人未显示,应在今后进行更为深入的研究.
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血液肿瘤个体化用药及相关遗传药物基因组学研究进展
血液肿瘤治疗药物的使用存在显著的个体差异。一些药物代谢酶、转运体和作用受体相关基因的遗传多态性显著影响药物的药代动力学（PK）和药效动力学（PD），是药物基因组学研究的重要内容。根据患者的遗传基因多态性预测药物不良反应、佳初始剂量，并结合治疗药物浓度监测（TDM）来调整用药剂量，可以帮助实现更精准的用药、提高疗效并减少不良反应。文章就近年来的相关研究进展进行介绍，并提出“个体化用药指纹图”的概念。
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H19基因上游差异性甲基化区SNPs多态性研究
目的 获得H19基因上游差异性甲基化区中SNPs的群体遗传学信息.方法 采用PCR和测序技术,对105例中国北方汉族健康无关个体H19上游启动子区检测；使用Haploview 4.1和PowerStats V12软件进行统计学分析.选用甲基化敏感的限制内切酶(msRE) HpaⅡ,检测5个家系样本H19等位基因的亲代来源.结果 测序结果显示,H19启动子区含有13个SNPs,组成5种单倍型,13种单倍型组合,其个体识别能力为0.856、多态性信息含量为0.67、非父排除率为0.498.经msRE HpaⅡ消化母源等位基因后,进行PCR及测序分析,检测出父源等位基因,排除1例和肯定4例家系的亲缘关系.结论 DNA甲基化标记和SNPs多态性检测,可同时进行多态性分型并确定等位基因的亲代来源,具有较高的法医学应用价值.
关键词： 法医物证学 DNA测序 单核苷酸多态性 甲基化敏感的限制内切酶 -
印记基因5个SNP分型及亲代来源的检测
目的 采用复合PCR-Snapshot联合甲基化敏感酶切技术,检测印记基因中5个SNP的甲基化状态、印记亲代来源及分型.方法 选择15例亲子鉴定已证实为亲生关系的家系样本,采用单碱基延伸复合检测技术,检测家系样本IGF2AS rs1003483、SNURF rs220028、SNURF rs4906939、DLGAP2 rs6558478、SIM2 rs737380等5个SNP分型,同时选用核酸内切酶(McrBC)和甲基化敏感的限制酶(msRE) HhaⅠ、HpaⅡ消化子代DNA,验证印记基因的亲代来源.结果 经用本文方法检测,证实rs1003483为父源印记；rs220028、rs4906939为母源印记；rs6558478及rs737380未在差异甲基化区,不能确定其印记亲代来源.结论 复合PCR-Snapshot联合甲基化敏感酶切技术简单、高效,在检测多个SNP分型的同时可确定亲代来源,可在相关研究和实践中选用.
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48个X-SNP位点的筛选及法医学应用价值分析
目的 对筛选出的48个X-SNP位点进行遗传学分析,评价其法医学应用价值.方法 根据NCBI和HapMap网站提供的位点信息筛选出48个高信息量X-SNP位点,利用SNPlex~(TM) System技术平台进行分型检测,通过中国华东地区汉族人群200个无关个体的调查建立遗传学资料,对48个X-SNP位点的遗传多态性进行研究分析,并进行连锁不平衡检验.结果 除rs6527549外,筛选出的48个X-SNP位点在中国华东汉族人群中具有高信息量,多态信息含量均在0.32以上,个体识别率在女性群体和男性群体分别为0.56和0.40以上,非父排除率在二联体和三联体中分别为0.20和0.32以上.检验发现,部分位点存在连锁不平衡现象.结论 本实验选取的48个X-SNP位点分型结果稳定,重复性好,在法医生物学研究中具有较高的应用价值,适于开展大规模的高通量检测.
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荧光定量PCR技术研究线粒体DNA nt16519单核苷酸多态性
目的 应用荧光定量PCR技术,建立mtDNA nt16519位点的PCR分型方法.方法 应用Primer Express3.0软件,设计1对Taqman MGB探针和1对扩增引物,在探针的5'端分别标记FAM和VIC报告荧光,应用7500荧光定量PCR和直接测序两种方法,分别检测62份血样和18份毛发样本的mtDNA nt16519单核苷酸多态性,比较二种方法结果的一致性.结果 62份血样和18份毛发样本均得到了可靠的mtDNA nt16519分型结果.结论 建立的荧光定量PCR的分型方法操作简单、结果准确,适用于法医DNA枪案.
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用dHPLC技术检测线粒体DNA编码区单核苷酸多态性
目的研究线粒体DNA(mtDNA)编码区单核苷酸多态性,建立检测mtDNA编码区单核苷酸多态性(SNP)的变性高效液相色谱(dHPLC)方法.方法设计针对线粒体DNA编码区nt10287-10679及nt8507-8805引物,应用dHPLC技术检测其序列多态性.结果100例中国汉族无关个体中,mtDNA nt10287-10679检出13个SNP位点,13种单倍型,基因多样性(H)为70.79%,偶合概率(P)为29.92%;mtDNA nt8507-8805检出10个SNP位点,12种单倍型,H为70.42%,P为30.28%;两段序列联合起来共检出23个SNP位点,23种单倍型,H为84.14%,P为16.70%.结论所建立的dHPLC方法可用于快速、准确地检测mtDNA编码区序列多态性;mtDNA编码区多态性位点作为mtDNA控制区多态性位点的补充,联合应用可以提高mtDNA的个体识别能力.
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HTR1B基因多态性与精神疾病的相关性及法医学意义
5-羟色胺受体1B基因的遗传变异可导致受体结构或表达量的改变,从而影响其在中枢神经系统中发挥正常功能.研究表明5-羟色胺神经递质功能紊乱在多种精神疾病的发病机制中起着重要的作用.本文综述了5-羟色胺受体1B的分布及功能、遗传多态性、基因变异与精神疾病的关系及其法医学意义.
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HTR1A基因与相应精神疾病的关联及法医学意义
五羟色胺受体1A基因的遗传变异通过影响受体的表达量或与配体结合的活性变化而增强或减弱5-HT的功能,在抑郁症及部分精神系统疾病的发病机制中起着重要的作用.文章通过对HTR1A基因遗传学多态性与部分精神系统疾病的关系进行综述.研究HTR1A基因与抑郁、恐慌、冲动易怒等情绪变化在法医司法精神病鉴定中的意义,并从基因-心理-社会模型的角度探讨犯罪行为的成因.
