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串联重复序列及其在鼠疫菌基因分型中的应用
串联重复序列广泛的存在于真核生物和原核生物基因组中,早在1960年后期人们就在真核生物基因组中得到了大量的串联重复DNA序列[1] ,但直到近20年才得到越来越广泛的应用[2].在真核生物基因组中串联重复分为以下三种:卫星DNA(核心序列长度在几百个bp之间)、小卫星DNA(核心序列长度在10~100 bp之间)、微卫星DNA(核心序列长度<10 bp).很多地方又把小卫星DNA称作可变数目串联重复序列(VNTR),将微卫星DNA称作短串联重复序列(STR)[3].在真核基因组中,串联重复DNA大多并不同编码区域相接近,主要位于基因外区域[4].重复DNA可以由单个的核苷酸组成,也可以由大量或少量的多核苷酸重复而成.大多数甚至全部的高等真核生物中分布着几个或数千个的短串联重复序列拷贝[5],这些序列元件在不同的个体中呈现出高度的多样性,这些串联重复序列初由Nakamura等定义为STR或微卫星和小卫星DNA这一术语,但其中的一些重复,特别是代表一个单独的基因座并且在个体之间存在长度多样性的重复也被称做VNTR基因座.VNTR和STR作为重要的遗传标记系统,现在已经广泛应用于肿瘤生化研究、法医学个体识别、亲权鉴定和群体遗传学分析等领域.
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免疫组化技术(一)
1 引言新引进的有关预测预后方面的免疫组化标记物在患者的治疗和处理上产生了巨大的影响.过去的60年中,关于免疫组化方法的理论在逐步发展,方法学上实现了在甲醛固定和石蜡处理的组织上使用抗体和适当的标记系统来鉴别特异性或高选择性的细胞表位.当前诊断实验室的趋势是尝试着尽量在甲醛固定石蜡包埋的组织上进行免疫组化研究,避免使用冷冻切片.
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高效绿色荧光蛋白基因标记系统的建立及其初步应用
逆转录病毒载体编码的众多报告分子被广泛用于分析基因转导率、分选或示踪基因修饰靶细胞,特别在改进基因转导条件、阐明造血干细胞(HSC)生物学特性和判定白血病复发的细胞来源等方面发挥了重要作用[1,2].作为新一代的报告分子,增强型绿色荧光蛋白(EGFP)近已被用于造血细胞的基因转移和示踪肿瘤转移与血管形成等研究[3].我们曾建立双启动子逆转录病毒载体介导的EGFP基因转移系统,但发现转导靶细胞后荧光强度较低[4].为提高靶细胞EGFP的表达,我们构建了仅携带EGFP单基因的逆转录病毒载体GIFP,并在不同类型靶细胞获得高效表达,为在体内进行基因标记研究提供了一种有效的工具.
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微卫星DNA在寄生虫学研究中的应用
微卫星DNA(Microsatellite DNA),又称为短小串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单重复序列(simple repeat sequence,SRS或SSR),是近年来飞速发展起来的一种新型的DNA高度多态性遗传标记系统,具有种类多分布广泛、高度多态性、杂合性高、重组率低的特点,在群体中变异范围大,构成了丰富的长度多态性,有高度的个体特异性,并遵循孟德尔共显性遗传规律,提供了众多有高度遗传信息的新的多态性标记[1].
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DNA多态性的研究进展
1 DNA多态性研究的三大阶段 1.1 第一代基因组遗传标记一限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)RFLP是70年代中后期建立起来的遗传标记系统。RFLP在发生上可以分为单碱基突变型和顺序重排型两种类型。所谓单碱基突变型是由于在某一限制性内切酶识别位点上,因发生单碱基替换而……
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D2S1338和D19S433基因座的多态性及其法医学应用
为了寻找在法医学上更有应用价值,且适用于国内外实验室交流的STR标记系统,本文作者应用PCR复合扩增和四色荧光技术对D2S1338和D19S433基因座进行了研究,并初步将其运用于法医学检验.
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哈尔滨地区汉族人群3个基因座的基因频率调查
短串联重复序列(STR)由2~5bp的核心序列串联重复构成.STR广泛分布于整个基因组中,是人类重要的遗传标记系统,现已被广泛用于法医个体识别和亲权鉴定中.
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华东地区汉族人群D15S659和D9S925基因座的遗传多态性研究
短串联重复序列(Short tandem repeat,STR)因其在人类基因组中分布极为广泛并大多具有高度多态而成为目前常用的第二代遗传标记系统,已普遍用于法医学个体识别和亲子鉴定,以及肿瘤生化研究等领域.法医学应用某一基因座时,首先要进行该基因座的群体遗传学调查,家系调查要符合孟德尔遗传规律,以确定其应用价值.本研究分别选取国内外尚未见报道的D15S659和D9S925基因座,建立了这两个基因座的分型方法,获得了中国华东地区汉族人群在这两个基因座的等位基因频率,现报道如下.