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结核分枝杆菌VNTRs位点的研究进展
结核病是当今世界严重威胁人类健康的传染病之一。2014年世界卫生组织全球结核病报告显示:在2013年全球结核病发病人数近900万人,死亡150万人[1]。而中国是22个结核病高负担国家之一,患病人数位居世界第二位,因此我国结核病的防治工作仍然刻不容缓。从基因分型方法入手研究结核病已经成为分子流行病学研究的一个热点,它能够初步判断结核病传播相关危险因素、预测可能的暴发流行、追踪传染源以及区分结核病患者内源性复发和外源性再感染等。
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MLVA技术在沙门菌分型和分子流行病学研究中的应用
沙门菌属是属于肠杆菌科的一类生化特性、抗原结构和DNA同源性等相关的革兰阴性菌,广泛存在于自然界,能引起多种动物感染.人源感染主要是通过污染食物从而引起的食物中毒.目前沙门菌感染是全球范围内常见的食源性疾病之一[1].全球每年估计发生13亿因沙门菌导致的急性胃肠炎病例,其中300万患者死亡[2].在美国,估计沙门菌所致感染占所有由食源性致病菌引起感染的26%[3],每年沙门菌感染的有140万病例,引起17 000人住院并且将近600人死亡[4],导致的经济损失每年约为24亿美元[5].
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基因分型技术在牛结核病的分子流行病学研究中的应用
牛结核病是由牛型分枝杆菌感染引起的一种人兽共患病,受污染的食物(尤其是牛奶)或者与动物直接接触是人类感染牛结核的主要原因.引起牛结核流行的原因是多因素的,但由于缺乏精确的流行病学数据,牛结核病一直得不到有效控制,其流行呈上升趋势, 严重危害经济贸易和畜牧业发展,威胁着人的健康[1].随着分子生物学理论和技术发展,出现了一些新的基因分型技术,应用于牛结核病分子流行病学的调查研究,可以从分子水平上分析不同地理区域流行的牛型分枝杆菌的特点,了解细菌的进化,证实可疑的传播环节,追踪传染源,区分复发病例中的外源性再感染等,对评估牛结核病暴发及其程度,指导公共卫生措施的实施和有效防治牛结核病具有重要的意义.
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狂犬病病毒的基因分型及其分子流行病学研究进展
狂犬病(Rabies)是由狂犬病病毒(rabies virus,RV)引起的人和所有哺乳动物的急性致死性中枢神经系统的自然疫源性疾病.人狂犬病的临床特征是恐水、怕风、咽肌痉挛和进行性麻痹等,尤以恐水症状为突出,一旦发病,死亡率几乎达100%[1].狂犬病是全球性的严重公共卫生问题,近些年来,随着宠物增多又缺乏相对有效的管理控制措施,狂犬病的发病又呈现上升趋势,在分子水平上进行狂犬病病毒流行病学研究对于阐明病毒的毒力变异和抗原飘移、了解病毒的宿主特异性和病毒系统发育的时空进程,以便更好地控制狂犬病都具有重要意义,本文就狂犬病病毒的基因分型及其分子流行病学研究进展作一综述.
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汉坦病毒基因分型及其分子流行病学研究进展
汉坦病毒属布尼亚病毒科(Bunyaviridae)汉坦病毒属(Hantavirus,HV),为分节段的单股负链RNA病毒,病毒基因组有大(L)、中(M)、小(S)3个片段组成,分别编码病毒RNA依赖的RNA多聚酶、病毒糖蛋白G1和G2以及病毒的糖衣壳蛋白(NP)[1].已知人类感染HV病毒主要引起肾综合征出血热(HFRS)和汉坦病毒肺综合征(HPS).该病毒自1978年韩国和1981年我国被发现并分离成功以来,已建立了许多的实验诊断技术和研究方法,并不断地改进和发展,极大的提高了相关实验技术的特异性和敏感性[2-3].近年来,随着分子生物学技术迅速发展,特别是PCR和序列分析技术的广泛应用,人们对HV病毒分子结构本质和特征的研究取得了突破性进展,新发现的HV病毒数目急剧增加,到目前为止至少有近30种HV病毒血清/基因型[4-5].现将近年基因分型及其分子流行病学研究综述如下.
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疟疾分子流行病学研究进展
疟疾是严重危害人类身体健康的急性寄生虫病,随着分子生物学技术的发展,许多学者以分子标志来诊断、鉴定疟疾病原,研究疟疾传播方式,指导调整疟疾防治对策[1~3].在形态相似、基因型完全不同的情况下,隐伏的种或一个种内的高水平群体能使疾病方式、流行形式变得复杂,影响有效防治对策的制定.通过检测疟疾现症感染的特定遗传分子,人和蚊虫的特定种株感染很容易被区分;通过开展常规的感染动力学监测,可解释许多流行病学现象,从而揭示流行区存在着一个巨大的传染源库.感染动力学和疟区多重感染数量表明年龄与恶性疟感染的关系.多重感染的临床保护作用已经被详细地描述,在新生儿和年长儿童感染动力学方面存在重要差异,理解寄生虫感染动力学有助于设计和开发有效疟疾疫苗,更好的筛选抗疟药,监测虫株变化,提供科学的预防证据,如蚊帐使用,制定防治规划,疫苗现场实验等[4~13].
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脉冲场凝胶电泳用于李斯特菌分型及分子流行病学研究
李斯特菌是一种重要的人畜共患病病原菌,该菌由于特殊的生物学特性,在自然界分布广泛,危害性大。文献报道,由该菌引起的李斯特菌病已在世界范围发生过4次大暴发,我国大连某饲养场也曾发生过一起猪李斯特菌病大暴发,小范围的流行也时有发生[1]。因此,对该病的病原学研究显得十分重要。国外已有数家实验室应用不同的方法对此进行了分子流行病学研究,结果显示,近年新发展起来的脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electropho-re-sis,PFGE)法为其优异的方法之一[2~4]。本文将该方法用于李斯特菌的研究综述如下。
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国内非胰岛素依赖型糖尿病分子流行病学研究进展
全球疾病防治重点逐渐从传染病转向慢性非传染病,其中以糖尿病为突出.非胰岛素依赖型糖尿病(NIDDM),是以胰岛素作用不足或胰岛素抵抗为主要特征,由遗传和环境因素相互作用而引起的临床综合征,其发病机制较为复杂,至今尚未完全明了.近年来,新兴的分子流行病学将先进的分子生物学技术与传统的流行病学人群调查方法相结合,从基因水平阐明NIDDM的发生发展过程,从而使NIDDM的病因研究深入一个新的阶段.现对目前国内NIDDM的分子流行病学研究进展进行综述.
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RCR Ribotying在细菌分子流行病学研究中的应用
细菌流行病学鉴定的分子标记技术迅速发展,常以染色体或染色体外DNA为材料,产生特异的或随机的多态性.如DNA限制性片段长度多态性分析(RFLP)、脉冲凝胶电泳技术是非常有效的,但二者都受到耗时及需要昂贵设备等因素的限制,不适于临床实验;rRNA基因的DNA探针技术也适于流行病学研究,但操作较烦琐;Srull[4]等率先把rRNA基因的限制性片段长度多态性(RFLP)分析应用于实践,并称为ribotyping.利用rRNA为基础的广谱探针,分析Southern杂交后呈现的染色体探针指纹谱,已被众多研究者用作描述细菌特征和菌株分型(ribotypes)的一种方法.
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065 亚洲南部和东南部大陆海洛因运输路线和HIV-1的传播
缅甸生产约占世界60%的海洛因,老挝是世界第三大海洛因生产国.近年来,在缅甸、老挝、印度、中国和越南,注射毒品的使用和HIV-1的传播已和这块大陆上的海洛因运输路线产生了密切的关系.通过对麻醉剂的使用调查、HIV-1的分子流行病学研究、注射毒品使用的流行病学会行为学研究的调查分析中发现:亚洲南部和东南部对药物的使用和HIV-1的传播与海洛因出口路线活动区域密切相关,因而对此进行了评估.方法回顾分析了有关HIV-1分子流行病学的医学和麻醉剂的文献,重点访问了印度、中国和缅甸的情报提供者、毒品使用者、毒品运输者、公共卫生人员和麻醉品控制人员.结果近期毒品使用和HIV-1感染者的4条传播路线和毒品交通运输路线密切相关.路线1:从缅甸东部边界进入中国云南省,初传播的是HIV-1亚型B,紧随其后的是亚型C.路线2:从缅甸东部到云南,进入中国北部和西部,到达新疆,传播HIV-1亚型B、C和B/C的混合型.路线3:从缅甸到老挝,穿过越南北部,到达中国的广西,传播HIV-1亚型E.路线4:从缅甸西部穿过缅甸和印度边界到达印度的曼尼普尔马,以HIV-1亚型C、B和E占大多数.结论亚洲东部和东南部海洛因出口路线已和注射毒品的使用以及HIV-1的传播在三个亚洲国家中的4条路线形成了双重流行的关系.HIV-1的分子流行病学被用于定位海洛因的运输路线.个别国家在麻醉剂和HIV的干预项目上获得不同程度的成功,得益于减少该地区以麻醉品为基础经济方案的实施.
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造福百姓风雨八年志不渝--记广东省食管肿瘤研究中心
有资料显示,全世界每年新发现食管癌病例达44万,约有60%发生在中国.潮汕地区(包括揭阳市)则是我国南方食管癌、贲门癌高发区之一,具有其代表性和特征性.早在上世纪60年代初期,揭阳市(前身为县)人民医院就开展了食管癌手术治疗.食管癌高发区的特性与当地治疗食管癌攻关精神、经验引起了有关部门重视.1998年经省科委批准"广东省食管肿瘤科研中心(下称中心)"设在揭阳市人民医院."中心"承担省科委立项课题《食管癌分子流行病学研究》和省卫生厅立项课题《食管癌综合治疗提高五年生存》两个课题的科研任务.
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广西分子流行病学研究进展
近50年来,分子生物学的发展突飞猛进,极大地加深了人们对生命现象本质的认识.我国与世界各国合作的人类基因组的测定,不到两年的时间就完成了人类基因1/10的检测任务.分子流行病学是利用分子生物学的新理论、新技术、新方法,从分子或基因水平上研究疾病和健康状况在人群中的分布和影响因素,以及预防和控制疾病,从而为流行病学研究提供了新的起点,大大地丰富和拓宽了流行病学研究的内容.近20年来,流行病学和分子生物学相互融合,逐渐衍生出分子流行病学这门新兴的分支科学.我国分子流行病学起步比国外晚,广西分子流行病学起步更晚,但是经过不断努力,广西分子流行病学研究也取得了一定的成绩.
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食管癌谷胱甘肽硫转移酶M1基因多态性研究
谷胱甘肽硫转移酶(glutathione S-transferase, GST)是细胞内重要解毒代谢酶,GSTM1基因是GST基因家族中的一个亚型,在人群中呈多态性分布.研究表明,GSTM1基因与肿瘤关系密切,GSTM1(-/-)基因型个体显著增加个体患癌的危险性[1].我国潮汕地区是南方沿海食管癌高发区,GSTM1基因的分子流行病学研究,将有助于揭示食管癌发生的遗传因素.
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代谢酶基因多态性与肺癌易感性关系的研究进展
恶性肿瘤是人类死亡的重要原因之一,其中肺癌在发达国家占全部恶性肿瘤死亡的第一位,在发展中国家肺癌死亡率也呈逐年上升趋势.研究表明80%以上的肺癌与烟草暴露有关,吸烟人群患肺癌的相对危险性比不吸烟人群高20倍之多[1].已有报道发现烟草中致癌物质在体外癌细胞株中诱发的p53突变与临床上肺癌组织中检测到的p53突变位点相同[2].但只有一小部分的吸烟者(<20%)可能患肺癌,显然机体对烟草烟雾中致癌物的敏感性有很大的个体差异.在烟草烟雾中致癌物多达55种,其中有两大类与肺癌密切相关,研究也较为深入.一类是多环芳香烃类(PAHs),代表物为苯并芘;另一类是烟草中特有的亚硝胺类,如NNK、NNA等.这些前致癌物在体内经代谢活化酶(Ⅰ相代谢酶)活化后,成为终致癌物,形成DNA加成物,造成细胞损伤;同时,它们也可由代谢解毒酶(Ⅱ相代谢酶)降解排出.这两类代谢酶活性的综合作用导致个体肿瘤易感性的差异.近10年来,关于代谢酶基因多态与肿瘤易感性的研究逐渐成为肿瘤分子流行病学研究的热点.本文就代谢活化酶及代谢解毒酶的基因多态性及其与烟草致癌物之间的关系作一简要综述.
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我国肺癌分子流行病学研究概况
癌的分子流行病学是分子生物学与传统流行病学相结合的一门新兴学科[1].癌的分子流行病学研究内容广泛,如个体对致癌物的有效接触剂量,致癌物引起的早期生物效应,个体对致癌物的敏感差异或遗传倾向性等.
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维吾尔医体液质分子流行病学研究进展
体液论是维吾尔医学(以下简称维医)重要的学说之一。维医体液论认为,人体是由4种不同的体液质组成,即胆液质(Sapra)、血液质(Kan)、黏液质(Belhem)和黑胆质(Sawda)[1]。不同的体液(Hilit)具有不同的气质(M izaj ),人体体液的失调是疾病产生的根本,任何一种体液质在结构和/或数量、质量上的失衡,均可能引起某种疾病的产生[1-3]。体液失调包括异常胆液质、异常血液质、异常黏液质和异常黑胆质4型。多项研究已表明,异常体液质与心血管、肿瘤等慢性疾病的发生有密切关系[3]。近年来,随着分子生物学技术的发展,维医体液质的分子流行病学研究取得了长足的进展,本文就近年来在这方面的研究作一综述。
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吸烟在西安市食管癌病因中的作用
目的探讨西安市食管癌的主要危险因素及遗传易感性的分子生物学基础.方法病例对照研究和分子流行病学研究,并与林州市对比.结果 (1)西安市食管癌的主要危险因素为吸烟(合并OR=1.79,95%CI=1.49~2.14,P<0.01)和食管癌家族史.林州市为食用酸菜(合并OR=2.06,95%CI=1.32~3.20,P<0.001)和食管癌家庭史.(2)p53突变率在两市病例组均明显高于对照组,西安市p53第五外显子突变模式与吸烟作用相符.(3)与食管癌相关的CYP基因多态性,西安市为CYP1A1,林州市为CYP2E1.GSTM缺失与两市食管癌未见明显联系,但参与协同作用.结论西安市食管癌的主要环境危险因素为吸烟,遗传易感性标志分析结果与之相符,而有别于林州市.主要危险因素不同地区食管癌的预防重点应不同.
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乙肝病毒新研究进展
乙型病毒性肝炎是一种在世界范围广泛流行、严重危害人类健康的传染病[1].全世界有3.5亿慢性携带者,高可达25%的人将死于乙肝或其相关并发症,大概每年约有一百万人死于HBv感染,是全球范围内第9位死因[2]].我国人口中,至少有一半以上的人感染过乙肝病毒.大约20%感染者成为慢性携带者或乙型肝炎病人,其中部分患者出现重症肝炎、肝硬变或肝癌.近年来随着HBV全基因组序列的积累,逐步发现A-H八种基因型,新基因型的发现以及分子流行病学研究的深入,对HBV分型研究的意义越来越为国内外研究者和临床医生所重视,基因型的研究已经成为热点.本文简单综述乙型病毒性肝炎的基因、分布以及乙肝的综合治疗方面的新研究进展.