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原发性肝细胞癌与HCV分型的关系
了解原发性肝细胞癌(HCC)患者HCV基因型分布现状及其关系.选择山西省肿瘤医院1996年间住院的HCVRNA阳性、临床上确诊的HCC患者血清标本13份,非肝癌癌症患者血清标本15份,1996-1997年HCVRNA阳性的公共场所从业人员血清标本15份,用特异性引物进行RT-PCR基因分型.结果表明,13例HCVRNA阳性的HCC患者,除1例未能分型外,其余12例均为HCV 1b型(100%).15例非肝癌癌症患者,除13例(86.67%)为1b型感染者外,其余均为2a型(13.33%).15例从业人员中,不仅检出了1b型感染(86.67%),还检出2a型、1/2混合型各1例.所有标本中1b型、2a型、1b/2a混合型的构成分别为38/42(90.48%)、3/42(7.14%)、1/42(2.38%),以1b型的比例高,未检出1a、2b和3a型.证明HCVRNA 1b型与HCC的关系较为密切,同时也是山西地区HCV感染的优势株.
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采用基因芯片检出一例丙型肝炎病毒3b基因亚型的报告
研究表明,感染HCV的严重性与所感染的HCV基因型有一定的关系,并且不同的HCV基因型对干扰素治疗有不同的影响.HCV的基因分型目前缺乏统一的分类和命名方法.Chan等对5′NCR进行基因树分析,将HCV分为1、2、3三个主要的基因型[1],随后通过对C、NS3、NS5区段的分析指出,每种基因型均由两到三种基因亚型组成,并将其命名为1a、1b、2a等[2,3].Simmonds等[4]分离出HCV的基因型4,并发展了Chan的命名方法[5].同时Houghton等[6]将1a和1b分别命名为基因型Ⅰ和Ⅱ;Enomoto等[7]将2a和2b命名为基因型Ⅲ; Cha等[8]将3命名为基因型Ⅳ,并将以前在南非发现的一组HCV命名为基因型V.Okamoto等[9]和Mori等[10]将基因型2分为基因型Ⅲ和Ⅳ,基因型3分为基因型Ⅴ和Ⅵ.为了避免混淆,本文中采用Chan和Simmonds的命名方法.HCV的基因分型方法主要包括基因组或基因组的部分序列测序分析,型特异性引物PCR扩增(type-specific primers PCR)[9],限制性内切酶长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP)[4],线性探针法(line probe assay,LiPA)[7,11],以及Livache等[12]和Bidan等[13]采用的吡咯阵列传感器芯片的HCV基因分型方法.
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沈阳市肾综合征出血热病原学分型
Hjelle B等和Kim EC等应用反转录套式PCR方法,分别对汉坦病毒肺综合症(HPS)及HFRS病人的血标本进行检测,急性期临床样本具有很高的阳性率,产物经测序或酶切分析表明有较好的特异性.国内学者设计了一套HAN(汉坦型病毒)和SEO(汉城型病毒)型特异性引物,使用套式PCR方法,可对急性期病人血中的汉坦病毒直接检测并分型,方法简便、快速、准确.笔者应用该方法对沈阳市汉坦病毒RNA进行了分型研究.
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山西省不同人群丙型肝炎病毒的基因分型研究
目的探索丙型肝炎病毒(HCV)基因型在山西省不同人群中的分布规律及流行的优势型。方法用RT-PCR和型特异性引物逆转录巢式PCR法，对山西省271例抗HCV阳性的丙型肝炎病人、原发性肝细胞癌患者、非肝癌癌症患者、性关系混乱者和性病患者、职业献血员、吸毒者及公共场所从业人员进行了HCV RNA的检测和基因分型。结果 271份抗HCV阳性标本中，HCV RNA检出率为45.45%～89.66%，平均67.52%。以丙型肝炎病人、献血员和吸毒者的HCV RNA检出率较高(76.9%～89.7%),χ2=30.44，P<0.01。在133份 HCV RNA阳性血清中,仅检出了108例1b型、2a型和此两种基因型的混合感染者。未检出1a型、2b型和3a型。其中1b型占80.00%(88例), 2a型占11.81%(13例), 混合型占6.36%(7例)。在肝癌患者和献血员中，仅检出1b型的感染；非肝癌的其他癌症患者中，未发现混合感染。各基因型在各人群中的分布比例也有差别，丙型肝炎患者、非肝癌的其他癌症患者、吸毒者和从业人员的各基因型构成比较接近，均以1b型为主。而性病患者和性关系混乱者中1b型和2a型感染者比例相等。结论山西省HCV的基因以1b型占优势。
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聚合酶链反应检测SEN病毒D型和H型方法的建立及初步应用
目的:建立检测SEN病毒(SENV)D和H基因型的聚合酶链反应(PCR)方法,并将其应用到流行调查.方法:从GeneBank下载SENV序列,在SENV开放读码框Ⅰ的高度保守序列内自行设计外引物,参考文献报道合成SENV D型和H型的型特异性引物作为内引物,建立检测SENV D型和H型的巢式PCR方法,并对深圳地区192名健康体检人群、48例急性甲肝患者、1 76例慢性乙肝患者、98例慢性丙肝患者和38例非甲-戊型肝炎患者的血清进行检测.部分阳性PCR产物进行克隆和DNA序列分析.结果:巢式PCR方法的敏感性及特异性均好.SENV D和/或H型在健康成人、急性甲肝、慢性乙肝、慢性丙肝和非甲-戊型肝炎患者中的总感染率分别为30.7%、37.5%、64.8%、57.1%和44.7%.SENV D和/或H型在健康人群中的感染率低于慢性乙肝患者和慢性丙肝患者(P＜0.001).非甲-戊型肝炎及急性甲肝患者中的感染率略高于健康人群,但无显著性差异(P＞0.05).结论:巢式PCR方法可用于检测SENV感染.深圳地区健康人群和急、慢性肝炎患者中存在SENV感染.SENV可能与HBV和HCV有相似的传播途径,其致病性有待进一步研究阐明.
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原发性肝细胞癌与HCV分型的关系
目的:了解原发性肝细胞癌(HCC)患者HCV基因型分布现状及其关系.方法:选择山西省肿瘤医院1996年间住院的HCVRNA阳性、临床上确诊的HCC患者血清标本13份,非肝癌癌症患者血清标本15份,1996年～1997年HCVRNA阳性的公共场所从业人员血清标本15份,用型特异性引物进行RT-PCR基因分型.结果:13例HCVRNA阳性的HCC患者,除1例未能分型外,其余12例均为HCV 1b型(100%).15例非肝癌癌症患者,除13例(86.67%)为1b型感染者外,其余均为2a型(13.33%).15例从业人员中,不仅检出了1b型感染(86.67%),还检出2a型、1/2混合型各1例.所有标本中1b型、2a型、1b/2a混合型的构成分别为38/42(90.48%)、3/42(7.14%)、1/42(2.38%),以1b型的比例高,未检出1a、2b和3a型.结论:HCVRNA1b型与HCC的关系较为密切,同时也是山西地区HCV的感染优势株.
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兰州地区丙型肝炎病毒基因分型研究
根据丙型肝炎病毒(HCV)的异质性,其基因链可分为各种不同的基因型.有资料表明HCV基因型分布具有一定的地区差异.作者对83例丙肝患者血清进行型特异性引物分型,以了解本地区HCV基因的优势型别.现报告如下.
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鞍山中心医院丙型肝炎病毒亚型的分布状态
目的：了解鞍山地区丙型肝炎病毒（ HCV）基因分型的情况。方法采用型特异性引物逆转录巢式PCR法对鞍山地区抗HCV和HCV RNA均阳性的患者共189例进行基因分型。结果在189份抗HCV和HCV RNA均阳性血清中基因型分别检测出了1b和2a型，未发现混合型感染，其中11份为阴性。结论鞍山地区基因型有1b型和2a型两种型，未发现其他亚型，1b型（53％）和2a型（47％）基本相等。
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四川省德阳地区慢性乙型肝炎病毒感染者病毒基因型的分布与临床意义
根据HBV全基因组序列差异≥8％或S基因序列差异≥4％,将HBV分为A～I 9个基因型[1-2].HBV基因型呈明显的地域分布,甚至在同一个国家的不同地区基因型分布也有差异;不同HBV基因型在病毒生物学特性方面有各自的特点,与HBV感染相关疾病的进展及预后显著相关,并且与IFNα抗病毒疗效之间也存在一定关系.为此,四川省德阳市人民医院感染科应用型特异性引物PCR法,分析了德阳地区608例慢性HBV感染者的HBV基因型分布并探讨其临床意义.
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新疆汉族人群HBV基因型与临床病情的关系
目的了解新疆汉族人群乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布及与临床病情的关系.方法新疆HBV感染者的血清226份,包括慢性乙型肝炎轻度、中度、重度、重型肝炎、肝硬化、肝癌患者.采用型特异性引物巢式PCR方法对血清中的HBV进行基因分型.结果新疆汉族人群HBV基因型以B、C混合型为主,占43.8%(99/226),B型31.46%(71/226),C型24.34%(55/226),未分型1例(0.44%),未见有A、D、E、F型分布.随机选取的4株HBV株经S基因序列的测定证实与本检测结果一致.C型HBV感染者的平均ALT、AST、γ-GT、AKP水平及HBV DNA浓度均高于B型、B+C型者(P＞0.05),C、B+C型TBIL平均水平高于B型,差异有统计学意义(P＜0.05).C型HBV感染者TP平均水平低于B、B+C型患者(P＞0.05).随着病情的加重,C型所占百分比逐渐高于B、B+C型,在LC、HCC中分别为36.4%,27.3%,C型感染者抗HBe阳性率逐渐增高,在HCC中B、C、B+C混合型者中抗HBe阳性率分别为26.7%、42.9%和32.6%(P＞0.05).结论新疆汉族人群HBV患者存在B、C与B+C基因型,以B、C混合型为主,基因型的分布与国内其它地方汉族人群相比有自身特点,且与临床病情有关,除TBIL外,各型在临床生化指标方面差异虽无统计学意义,但认为C型可能与较严重肝病有关,B+C型与HBV感染后病情的关系有待进一步明确.
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应用型特异性引物巢式PCR分析温州地区乙型肝炎病毒基因型及其临床意义
目的 了解温州地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布及其与临床的相关性.方法 选取温州地区HBV DNA阳性的慢性HBV感染者202例,其中慢性无症状乙型肝炎表面抗原携带者52例,慢性乙型肝炎103例,肝硬化27例,肝细胞癌20例,应用型特异性引物巢式PCR检测HBV的基因型.结果 202例HBV DNA阳性血清标本中,B型37例(18.3%),C型123例(60.9%),B/C混合型41例(20.3%),D型1例(0.5%),未发现A、E、F和G型;与B基因型、B/C混合型相比,C基因型在慢性乙型肝炎和肝细胞癌中明显升高,分别为56.1%和14.6%(P﹤0.05);C基因型感染者血清丙氨酸氨基转移酶水平(226±268) U/L高于B基因型的(114±183)U/L和B/C混合型的(130±222) U/L,差异有统计学意义(P﹤0.05);C基因型感染者HBeAg阳性率和HBV DNA含量明显高于B基因型和BC混合型感染者相比,差异有统计学意义(P﹤0.05).结论温州地区存在HBV的B、C、D和B/C混合基因型,C型为本地区的优势基因型,并且C型HBV感染易引起较重肝脏损伤.
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365例乙型肝炎基因型分布与临床相关性研究
目的:探讨湖北地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布情况以及其与临床的相关性.方法:选取湖北地区HBV DNA阳性的慢性乙型肝炎患者365名,应用多对型特异性引物聚合酶链反应检测HBV的基因型.结果:在365份HBV DNA阳性血清中,除3份标本不能分型外,B型占78.45%,C型和BC混合型占17.68%和3.87%,未发现其他HBV基因型.B型患者血清ALT水平显著高于C型和BC混合型患者(P=0.01,P＜0.001),血清TBil、HBeAg阳性率在各基因型患者间差异无显著性意义.慢性肝炎患者中B基因型显著多于C基因型(P=0.012),肝硬化及肝癌患者中,B、C基因型分布的差异有显著性意义(P=0.007,P=0.001),重症肝炎患者的基因型分布无显著性意义.结论:湖北地区存在B、C、BC混合3种HBV基因型,且以B型为优势基因型.在慢性肝炎患者中B型比例较高,肝硬化及肝细胞癌患者中C型比例较高.
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型特异性引物PCR技术在HBV基因分型中的应用
目的应用乙型肝炎病毒(HBV)型特异性引物PCR的基因分型方法,了解武汉地区HBV基因型的分布及其临床意义.方法选择298例HBV感染者,分成表面抗原携带者(ASC)、急性肝炎(AH)、慢性肝炎(CH)、重型肝炎(SH)、肝硬化(LC)和原发性肝癌(HCC)6组,用多对型特异性引物PCR方法检测HBV的基因型;并对4份血清HBVDNA进行序列分析.结果多对型特异性引物PCR法可简便、快速、准确地鉴定HBV基因型;298份HBV DNA阳性的血清标本中,B基因型197例(66.1%),BC混合型68例(22.8%),C基因型33例(11.1%);B基因型在ASC、AH、CH、SH和HCC组患者中均占绝对优势,分别为63.6%、71.9%、68.7%、89.5%和65.9%,C基因型在各组患者中的分布差异无显著性意义,BC混合基因型在各组患者中的分布存在差异,更多见于肝硬化患者;各基因型在ALT水平、HBeAg阳性率及HBV DNA水平上差异无显著性意义(均P＞0.05).结论多对型特异性引物PCR扩增法能快速准确地进行HBV基因分型检测,可用于大规模的流行病学调查;武汉地区HBV感染者中,优势基因型为B型,其次为BC混合型和C型,BC混合型更多见于肝硬化患者.
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邯郸地区乙肝病毒感染者血清学模式及基因型检测结果分析
目的 研究邯郸地区乙肝病毒感染者血清学表达模式的流行病学和基因型分布,为完善预防、诊断、治疗病毒感染的策略和方法提供科学依据.方法 应用酶联免疫吸附(ELISA)检测乙肝病毒感染者血清HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb和HBcAb.型特异性引物PCR检测其基因型.对结果进行统计分析.结果 306份标本中HBsAg/HBeAg/HBcAb(M1),男:65份,年龄(31.6±15.1)岁.女:40份,年龄(26.82±9 24)岁.HBsAg/HBeAb/HBcAb(M2),男:52份,年龄(35.6±14.8)岁.女:58份,年龄(37.8±13.39)岁.HBsAg/HBcAb(M3),男:44份,年龄(39.4±14.0)岁.女:24份,年龄(39.4±13.0)岁.MI和M3模式男女比率差异无统计学意义(P>0.05).M2模式男女相比差异有统计学意义(P<0.05).统计图表示三种血清学模式表达的高峰期都集中在20～30岁之间,对M1血清学模式105份样本进行基因分型,95份样品成功分型,全部为C基因型.结论 邯郸市区乙肝病毒感染者在3种常见血清学表达模式表达上M2男女比率差异有统计学意义,女性高于男性,20～30岁为携带和传播的高峰期,C型为优势基因型.
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大连地区丙型肝炎病毒亚型的分布状态
HCV是输血后肝炎的主要病因,具有较高的慢性化比例,并与肝硬化和原发性肝癌的发生关系密切,严重威胁人类健康.不同的基因型对流行病学,疫苗研制、临床抗病毒治疗及预后等方面有着明显影响.
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昆明、洛阳两地献血者人群HBV携带者的HBV基因型分布
32.2%),C型103例(48.1%),B、C混合型41例(19.2%);D型1例(0.5%);洛阳献血者的88份样本中成功分型72例,分型成功率81.8%,其中B型10例(13.9%),C型46例(63.9%),B、C混合型16例(22.2%).经s基因测序法验证,该分型方法准确可靠.结论 昆明、洛阳两地献血者人群中HBV携带者HBV基因型均以C型为主,并有一定比例的B型和B、C混合型,仅在昆明献血者中发现1例D型,未见A、E、F型.
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南京地区丙型肝炎病毒基因分型的研究
目的 了解南京地区丙型肝炎病毒(HCV) 基因型分布的特点.方法 采用针对HCV三种主要基因型1,2,3和1b亚型设计的型-特异性引物,通过RT-PCR和套式PCR扩增HCV基因组高度保守的5'端非编码区,检测55例HCV IgG阳性血清的HCV RNA,并对其中40例进行基因分型.结果 PCR检测的抗HCV IgG阳性血清标本55例中,50例为HCV RNA阳性,阳性率为90.91%;对40例HCV RNA阳性的血清进行分型,发现23例为1b型,15例为2,1 b混合型,HCV-1b亚型含有率为95%,其余两例分别为2型和1,2混合型.结论 该地区HCV流行优势株为1b亚型.
