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诺如病毒GGⅠ、GGⅡ型混合感染致胃肠炎饮水型暴发调查
诺如病毒是引起人类急性胃肠炎的重要病原体,基因型包括GG Ⅰ、GG Ⅱ、GGⅣ~([1]).混合基因型引起感染较少.2009年2月浙江省安吉县某学校发生一起诺如病毒GG Ⅰ、GGⅡ型混合感染暴发疫情.使用统一调查表对该校疫情流行期间的腹泻学生进行流行病学调查核实,出现腹泻(≥3次/d)或呕吐伴腹泻、恶心、腹胀、头晕等症状之一者作为胃肠炎病例;采集部分病例粪便标本,用Real Time RT-RCR方法检测病毒基因型.通过描述性研究进行流行特征分析;通过病例对照研究进行病因探索,按1:3频数匹配随机选择病例24例、对照72人;通过计算OR值、χ~2值判断可能的暴露因素.
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2004—2010年宁夏麻疹病原学监测
为识别病毒来源,了解宁夏州族自治区流行的麻疹病毒基因型,笔者现就宁夏回族自治区2004-2010年麻疹病原学监测分析结果报告如下.一、材料与方法1.标本采集:按照WHO《麻疹病毒感染的实验室诊断基本操作手册》要求,采集宁夏回族自治区各市、县2004-2010年198例疑似麻疹患者的咽拭子163份和尿液标本120份,进行病毒分离.咽拭子采集后置于2 ml标本运输液中,-70℃保存备用;尿液标本采集后1860 ×g离心15 min,弃上清,用2ml病毒标本运输液悬浮沉淀,-70℃保存备用.
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乙型和丙型肝炎病毒核酸检测技术及进展
近年来,病毒性肝炎的实验室诊断领域取得了飞速的进展,新方法、新技术的出现提高了对病毒检测的灵敏度和准确度,使病毒性肝炎的诊断和治疗水平上了一个新的台阶.病毒性肝炎NAT分为两大类,即病毒核酸载量的检测和病毒基因型/基因突变检测.鉴于甲型、丁型和戊型肝炎病毒的检测主要以血清学检测为主,本文主要介绍乙型肝炎与丙型肝炎NAT的主要技术及进展.
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核苷(酸)类似物抗病毒治疗慢性乙型肝炎的优化策略
目前我国有4种核苷(酸)类似物可用于慢性乙型肝炎的抗病毒治疗,即拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦和替比夫定.但由于患者的性别、年龄、遗传传背景、感染乙型肝炎病毒(hepatits B virus,HB BV)的途径、病毒基因型、病程长短、肝脏病变程程度和对治疗药物敏感性等不同,即使有同样治疗疗适应证的患者按同样的规范方案治疗后,仍有相相当一部分患者早期应答欠佳,从而影响了抗病毒毒治疗的长期疗效.如何进一步优化现有的治疗方方法以提高远期疗效已成为国内外专家关注的热点点问题.
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丙型肝炎病毒基因型与丙型肝炎患者自身抗体的相关性
目的 探讨湖州地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染患者HCV基因型与自身抗体变化的关系,同时分析HCV含量与抗核抗体(anti-nuclear antibody,ANA)检出率的关系.方法 收集湖州市中心医院2008年1月至2010年1月传染科门诊和住院HCV RNA阳性患者血清,采用DNA测序法检测HCV基因型,间接免疫荧光法检测ANA和抗平滑肌抗体,斑点免疫印迹法检测抗线粒体抗体M2、Sm、SSA、R052、SSB及抗着丝点抗体,散射比浊法检测类风湿因子.血清样本按照HCV RNA病毒载量分为高、中、低载量3组.结果 共纳入94例HCV患者,其中1a型5例(5.3%),1b型77例(81.9%),2a型9例(9.6%),3a型1例(1.1%),6a型2例(2.1%).94例HCV患者自身抗体阳性检出率39.4%,其中1b型检出率46.8%,2a型检出率11.1%,1b型与2a型检出率比较差异有统计学意义(P<0.05),其他基因型未检出自身抗体阳性.1b型77例患者可检出ANA、类风湿因子、抗平滑肌抗体、M2、SSA、R052、SSB、抗着丝点抗体8种自身抗体,2a型9例患者检出ANA、类风湿因子和M23种自身抗体.HCV患者ANA以低滴度颗粒型为主,ANA 1∶100滴度占59.5%(22/37),颗粒型占ANA的35.1%(13/37),其次是着丝点型.3个载量组分别与对照组比较,差异均有统计学意义(x2分别为6.4、19.9、53.1,均P<0.05).高载量组和低、中载量组比较,差异均有统计学意义(x2分别为19.5、9.8,均P<0.05).结论 湖州地区HCV基因型以1b型为主,HCV不同基因型与自身抗体之间存在密切的关系,其载量高低与自身抗体检出率成正比.
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核苷(酸)类似物抗病毒治疗慢性乙型肝炎的优化策略
目前我国有4种核苷(酸)类似物可用于慢性乙型肝炎的抗病毒治疗,即拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦和替比夫定.但由于患者的性别、年龄、遗传背景、感染乙型肝炎病毒(hepatits B virus, HBV)的途径、病毒基因型、病程长短、肝脏病变程度和对治疗药物敏感性等不同,即使有同样治疗适应证的患者按同样的规范方案治疗后,仍有相当一部分患者早期应答欠佳,从而影响了抗病毒治疗的长期疗效.如何进一步优化现有的治疗方法以提高远期疗效已成为国内外专家关注的热点问题.
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基因芯片技术检测宫颈癌组织的人乳头瘤病毒基因型
目的:了解宫颈癌患者人乳头瘤病毒的感染率及基因型分布情况,探讨人乳头瘤病毒基因型与癌肿类型的相关性.方法:采用可检测23种HPV基因型的基因芯片方法检测200例宫颈癌组织的HPV基因型,计算HPV及各基因型的感染率,比较HPV及其主要基因型分布与癌肿类型的关系.结果:200例宫颈癌组织中HPV的阳性率为94.00%,其中宫颈鳞癌为95.86%,显著高于宫颈腺癌的80.00%,x2=9.73,P<0.01;而HPV16、HPV18型和HPV双重感染在鳞、腺癌中的阳性率无显著性差异;200例宫颈癌组织中共检测到9种HPV基因型,分别为HPV16、18、45、33、58、59、73、31、56,HPV16检出率高,达74.00%、其次是HPV18(16.00%);HPV双重感染24例,检出率达12.00%.结论:HPV在宫颈鳞癌的感染率显著高于宫颈腺癌;HPV基因型分布与癌肿类型无关;宫颈癌的HPV基因型别多样,且均为高危型感染,以16、18型常见,并存在双重感染.
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乙型肝炎病毒基因型与中医辨证相关性研究的回顾与展望
1988年Okamoto首先提出了乙型肝炎病毒(HBV)基因分型法.近年来,国内外学者从流行病学、分子生物学、临床医学等方面对乙型肝炎病毒基因型进行了大量的研究.研究表明,HBV基因型与乙型肝炎的临床表现、治疗、预后等都有密切的关系.
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湖州市2008-2009年手足口病病原检测结果分析
手足口病(HFMD)是夏秋季婴幼儿和儿童的主要急性传染病之一,该病以口腔黏膜疹、皮肤溃疡和手、足部的疱疹为主要特征,具有播散快、流行性强的特点,并可在短时间内造成规模流行.自1958年Robinson报道首例HFMD以来,柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)和肠道病毒71型(EV71)先后成为HFMD流行的主要病原,两种病毒基因型相似并且表现类似的临床症状.其中EV71可引起严重中枢神经系统并发症,如脑膜炎、脑炎、急性迟缓性瘫痪等,甚至危及生命,因而具有更大的危害性.2008年3月安徽省阜阳市发生多名儿童EV71感染致死事件,相继全国多个城市出现HFMD爆发,引起了各级卫生部门的高度重视.
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慢性乙型肝炎干扰素治疗与外周血CD4 T细胞增殖反应
α-干扰素(IFN-α)抗HBV,除了直接降解病毒外,还具有免疫调节作用.因此,通过改善慢性乙型肝炎(CHB)患者免疫应答能力的IFN-α来清除HBV是治疗CHB有效方法.然而,IFN-α诱导的CD4 T细胞增殖反应与其应答之间的关系不恒定[1-4],而且哪些因素影响CHB患者在IFN-α治疗后的免疫细胞的激活目前尚不清楚.本研究探讨外周血CD4 T细胞增殖反应的性质与IFN-α应答之间的关系,以及该反应是否与病毒载量、病毒基因型及热点变异有关.
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核苷(酸)类似物抗病毒治疗慢性乙型肝炎的优化策略
目前我国有4种核苷(酸)类似物可用于慢性乙型肝炎的抗病毒治疗,即拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦和替比夫定.但由于患者的性别、年龄、遗传背景、感染乙型肝炎病毒(HBV)的途径、病毒基因型、病程长短、肝脏病变程度和对治疗药物敏感性等不同,即使有同样治疗适应证的患者按同样的规范方案治疗后,仍有相当一部分患者早期应答欠佳,从而影响了抗病毒治疗的长期疗效.
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四川省德阳地区慢性乙型肝炎病毒感染者病毒基因型的分布与临床意义
根据HBV全基因组序列差异≥8%或S基因序列差异≥4%,将HBV分为A~I 9个基因型[1-2].HBV基因型呈明显的地域分布,甚至在同一个国家的不同地区基因型分布也有差异;不同HBV基因型在病毒生物学特性方面有各自的特点,与HBV感染相关疾病的进展及预后显著相关,并且与IFNα抗病毒疗效之间也存在一定关系.为此,四川省德阳市人民医院感染科应用型特异性引物PCR法,分析了德阳地区608例慢性HBV感染者的HBV基因型分布并探讨其临床意义.
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病毒基因型对阿德福韦酯治疗乙型肝炎病毒e抗原阳性患者效果的影响
全球每年约有100万人死于HBV感染所致的肝功能衰竭、肝硬化和肝细胞癌(HCC).我国属HBV感染高流行区,一般人群的HBsAg阳性率为9.09%.有效的抗HBV治疗是延缓或阻止慢性乙型肝炎进展至肝硬化、HCC或死亡的重要措施.阿德福韦酯(ADV)已获我国食品药品监督管理局批准用于治疗慢性乙型肝炎,尤其适用于需长期用药或已发生拉米夫定耐药的患者.
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HCV RNA阳性标本PCR-荧光探针法病毒亚型未检出原因分析
目的 探讨血清HCV RNA阳性,但PCR-荧光探针法病毒亚型检测未检出的原因.方法 收集2015年7月至2016年3月北京佑安医院临检中心分子室病毒载量>1 000 IU/mL但未测出病毒亚型的标本55例,采用基因测序方法对病毒扩增产物进行分型分析.结果 55例HCV病毒载量>1 000 IU/mL,但HCV病毒亚型未检出的标本中,其中3例为病毒载量接近病毒亚型检测下限,经测序分析为1b型2例,2a型1例;5例为检测试剂盒未覆盖亚型并且其探针位置无突变,HCV 1a型4例,6n型1例,占9.1% (5/55);47例因探针序列位置基因突变导致病毒亚型未检出,占85.5% (47/55),经测序发现其中1a型6例(6/47,12.8%),1b型32例(32/47,68.1%),2a型3例(3/47,6.4%),2b型1例(1/47,2.1%),3b型1例(1/47,2.1%),6a型2例(2/47,4.3%),1b、6q、6c混合型1例(1/47,2.1%),6n型1例(1/47,2.1%).探针序列位置基因突变组中以HCV病毒5'非翻译区(5'UTR) 204 C/T突变为主(31/47,66.0%),其次为5'UTR 168 C/A突变(5/47,10.6%).结论 病毒载量低、试剂盒覆盖的病毒亚型有限、探针对应的序列存在变异均会影响PCR-荧光探针法检测HCV基因型,其中探针序列变异是病毒亚型未测出的主要原因.
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102例慢性HBV感染者病毒基因变异情况分析
目的 探讨乙型肝炎病毒感染者病毒基因分型和变异情况及其临床意义.方法 我院住院和门诊诊治的慢性HBV携带者53例和慢性乙型肝炎患者49例,取血清,送往北京地坛医院肝病研究所进行HBV DNA基因测序.结果 在102例慢性HBV感染者中,HBV B型36例(35.29%),C型59例(57.84%),B/C混合型4例,未定型3例.慢性乙型肝炎组B型17例,C型28例,B/C混合型3例,未定型1例,携带者组B型19例、C型31例、B/C混合型1例、未定型2例(x2=0.32 P=0.57);在53例携带者中,检出耐药位点5例(9.4%),其中3例为rtA181T,1例为rtL180M+rtM204V,l例为rtM/V207l突变,在49例慢性乙型肝炎患者中,共检出耐药位点13例(26.5%),其中5例为rtA181T,1例为rtL180M+rtM204V,2例为rtM/V207I,2例为rtN236T,1例为rtA181T+rtM204I+rts202N,1例为rtl169V+rtV173D,1例为rtM204I+rtM204L.结论 在HBV携带者和慢性乙型肝炎患者均检出耐药位点变异,其意义有待于进一步探讨.
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江西宜春地区慢性乙型肝炎患者病毒基因型与临床分型的关系
目的 探讨宜春地区慢性乙型肝炎患者病毒基因型与临床分型的关系.方法 采用PCR-微板核酸分子杂交-ELISA法检测93例慢性乙型肝炎患者的乙型肝炎病毒基因型,并进行肝组织病理检查.结果 93例乙型肝炎患者中B基因型63例(67.7%),C基因型30例(32.3%).B基因型组中慢性乙型肝炎轻度52例,中度11例,无重度、重症肝炎及肝硬化患者;C基因型组中慢性乙型肝炎轻度11例,中度8例,重度4例,重症肝炎3例,肝炎后肝硬化4例.2组比较差异有统计学意义(P<0.01).结论 江西宜春地区HBV以B基因型和C基因型流行为主;C基因型患者较B基因型患者临床分型严重,预后较差.
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连云港地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型的研究
[目的]了解连云港地区慢性乙型肝炎患者HBV 基因型特点及其临床意义.[方法]用PCR结合微流芯片技术对2003 年7 月至2005 年7 月门诊及病房收治的慢性乙型肝炎患者感染的HBV 进行基因分型,并与其临床生化结果、病毒定量进行相关性分析.[结果]乙肝病毒基因分型为B 型12例(19.05%),C型45 例(71.43%),B+C混合型4例(6.35%),未定型2例(3.17%);其中年龄大于35岁的7例B基因型和21例C基因型的谷丙转氨酶(ALT)水平分别为(174.0±124.7)IU/L 和(247.8±212.6)IU/L(P<0.05);HBV-DNA病毒载量分别为(5.0±2.1)lg.copies/ml和(6.4±2.71) lg.copies/ml,两项指标经t检验差异有统计学意义(P<0.05);年龄在18~34岁的B型和C型患者ALT水平、HBV-DNA病毒载量和HBeAg阳性率无统计学差异(P>0.05).[结论]连云港地区慢性乙型肝炎患者基因型有B 型、C型、B+C混合型和未定型,但以C 型为主,B型次之.发现在年龄大于35岁的慢性乙型肝炎患者中,感染C基因型的ALT水平、HBV 病毒载量显著高于B基因型患者(P<0.05),提示C基因型HBV感染致肝脏损害较重.
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海府地区慢性HBV感染者病毒基因型与BCP/PC区变异的研究
目的:探讨海府地区慢性HBV感染者病毒基因型与BCP/PC区变异的特点.方法:选取2013年1月至2015年12月期间海口市人民医院住院治疗的200例慢性HBV感染者作为研究对象,依照HBV感染自然史分为慢性HBV携带组、HBeAg(+)慢性乙型肝炎组、非活动性HBsAg携带组和HBeAg(-)慢性乙型肝炎组,各50例.PCR-RELP法检测HBV基因型和PC/BCP变异.比较4组患者HBV基因型的分布情况及HBV变异类型的比率.结果:①4组患者HBV基因型的分布情况均以B型为主,差异无统计学意义(P>0.05).②PC变异发生于基因型B,BCP变异发生于基因型C,随着HBV感染自然史的进展,PC变异的比率并未出现太大变化(37.50% vs 48.65% vs 39.40% vs35.48%),差异无统计学意义(P>0.05);但BCP变异的比率却逐渐增高(30.00%vs 61、65% vs 76.47%vs 89.47%),差异具有统计学意义(P<0.05).结论:海府地区慢性HBV感染进程的4个阶段(免疫耐受期、免疫清除期、免疫不全期和再活动期)均以B型基因为主,但是随着HBV感染自然史的进展,BCP变异比率均逐渐增高,表明BCP变异可能是肝细胞癌进程中的重要事件.
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基于循证医学的慢性丙型肝炎患者病毒基因分型与中医证候之间的关系探讨
目的:探讨慢性丙型肝炎( CHC)中医证候与病毒基因型的关系。方法:采用问卷调查与实验室检测相结合的形式,统计患者的中医症候体征规律,丙型肝炎病毒( HCV)基因分型采用基因测序法检测,采用Logistic回归进行相关性分析。结果:我国CHC患者病毒基因型以1型为主,中医证型以正虚邪恋型为主,病毒基因型和中医证型间不存在相关性,临床症状胁肋隐痛与HCV基因型存在相关性,且症状越重,病毒基因1、6型出现的机率越大。结论: HCV患者临床宏观症状与微观指标之间可能存在某些联系,该结果将为进一步研究CHC的宏观与微观之间的联系提供流行病学依据。
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丙型病毒性肝炎病毒基因型与病毒载量及疾病进展的相关性
目的 探讨丙型病毒性肝炎(HCV)病毒基因型与病毒载量及疾病进展的相关性.方法 选取2013年1月至2015年1月于湖北省孝感市中心医院就诊的100例慢性HCV感染者为研究对象,采用基因芯片法对HCV基因型进行检测,采用反转录-聚合酶连反应法(RT-PCR)对HCV DNA基因型进行检测.结果 共100份标本,其中HCV基因型中1a型4份,1b型49份,2a型14份,3a型9份,3b型8份,6型15份,混合型1份(1b+2a).男性与女性患者的HCV基因型整体分布差异无统计学意义(P>0.05),但是各类HCV基因型差异有统计学意义(P<0.05).1型、2型、3型、6型、混合型患者的平均年龄分别为(39.20±3.50)、(45.20±3.10)、(38.84±3.20)、(36.06±3.30)、(39.20±3.60)岁.各类HCV基因型患者年龄差异无统计学意义(P>0.05).6型的HCV RNA平均水平高,不同基因型的HCV RNA平均水平差异有统计学意义(F=10.863,P=0.027).100例患者中11例患者伴存免疫缺陷病,8例患者为1型患者,89例患者无伴存缺陷免疫病,45例患者为1型患者,差异有统计学意义(P<0.05).慢性丙型肝炎(CHC)患者的HCV RNA水平低,终末期肝病、CHC、伴存免疫缺陷病三组患者HCV RNA水平两两比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 HCV基因型主要为1b型,6型患者感染率高,临床上应当加强对这部分患者的检控.