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  • 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在幽门螺杆菌鉴定中的应用

    作者:陈飞;杨峰;张景皓;方毅;王诗雯;张艳梅;赵虎

    目的:优化幽门螺杆菌( H.pylori)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱( MALDI-TOF MS)检测前处理方法,建立MALDI-TOF MS的H.pylori 超级图谱并验证其鉴定能力。方法收集2015年1月至2016年7月期间复旦大学附属华东医院临床胃活检组织样本469例,进行H.pylori分离培养和鉴定,并利用16 S rRNA测序验证,共获得91株H.pylori菌株用于后续MALDI-TOF MS检测。在进行MALDI-TOF MS检测前,比较50%异丙醇、甲酸乙腈(1∶1)以及70%甲酸用于H.pylori前处理的效果。从91株临床分离的H.pylori菌株中随机选取40株进行MALDI-TOF MS检测,再进一步分别随机抽取原始图谱分为5株组、10株组、20株组和30株组,每组重复3次,采用SARAMIS Premium软件分析,建立超级图谱。剩余的51株H.pylori菌株用于验证新建超级图谱的鉴定能力。结果70%甲酸进行前处理效果好。30株组建立的超级图谱的鉴定率高,可达90.2%。用于验证的306张质谱图中46.1%的图谱取得了高可信度(≥90%)的鉴定结果、22.2%的图谱取得了中低度可信的鉴定结果,31.7%的图谱无鉴定结果。结论本研究优化了MALDI-TOF MS鉴定H.pylori的前处理方法,并建立了H.pylori超级图谱,提高了MALDI-TOF MS对于H.pylori的鉴定能力,为临床上快速准确地鉴定H.pylori提供了新的检测平台。(中华检验医学杂志,2017,40:31-35)

  • MALDI-TOF MS在临床曲霉菌鉴定中的应用

    作者:叶丽艳;王强;沈跃云;叶坤;马薇;陈刚;杨继勇;罗燕萍

    目的 探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)在临床曲霉菌属鉴定中的应用,并评价其鉴定性能.方法 以ITS测序结果为金标准,对解放军总医院2017年5月至2018年4月临床分离的曲霉菌属采用VITEK MS V3.0进行鉴定,并对结果进行分析.结果 通过V3.0数据库(含12种曲霉菌图谱)鉴定了9种曲霉菌,占总体分离菌株的86.24%.VITEK MSV3.0的鉴定符合率为91.49%,未获得结果的占16.51%;菌属符合率为93.62%,其中仅有两株杂色曲霉鉴定到属水平.根据鉴定置信度进行统计,88.30%的菌株获得了99%以上的鉴定率.首次未获得鉴定结果的占13.83%,鉴定错误率3.19%,二次提取后再次进行质谱鉴定未鉴定菌株降低到6.38%,鉴定错误率降到2.13%;结合传统鉴定和VITEK MS鉴定手段,属正确率为98.94%,种正确率为93.62%;其他真菌对曲霉菌鉴定的影响度为0%.结论 MALDI-TOF MS作为传统鉴定方法的有力补充,应用于曲霉菌鉴定给工作带了很多便捷,提高了种水平鉴定准确率,使得真菌实验室鉴定水平得到了提高.

  • MALDI-TOF MS技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌

    作者:孙巧玲;舒玲斌;胡洁;胡燕燕;张嵘

    目的 评价基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌的能力.方法 对浙江大学医学院附属第二医院和河南省人民医院的57株肺炎克雷伯菌,PCR扩增rmpA2毒力基因和荚膜血清型基因,多位点序列分型方法(MLST)进行分型,拉丝试验进行高黏液表型测定.MALDI-TOF MS对肺炎克雷伯菌进行鉴定并对峰图进行二维分析和算法统计,包括采用支持向量机算法(SVM),遗传算法(GA),监督使神经网络算法(SNN)和快速分类算法(QC)进行数据分析并建立相应模型,得到分型区分的特征峰.结果 57株肺炎克雷伯菌中有28株携带rmpA2毒力基因,MLST均为ST11型,其中拉丝试验阳性有5株;29株不携带rmpA2毒力基因,主要ST型为ST11(n=23),还包括ST15(n=3),ST1、ST76和ST473各一株.质谱将肺炎克雷伯菌较清晰地划分成两个区域,ClinProTools软件可准确区分84.2%(48/57)的菌株.ClinProTools软件四种算法结果基本相似,SVM特异性和灵敏度高,分别为93.23%和100%.采用ClinProTools对质谱峰进行统计显示,得到区分rmpA2基因阳性组和阴性组的2个特征峰分别为7168.9和7280.76,在峰强度上存在一定的差异.结论 MALDI-TOF MS快速区分携带rmpA2毒力基因的高毒力肺炎克雷伯菌方法灵敏度和特异性都在90%以上,得到两个特征峰在峰强度上存在一定差异,需进一步验证.

  • MALDI-TOF MS检测肠杆菌科细菌产碳青霉烯酶的效果评估

    作者:谢小芳;周惠琴;郑毅;王敏;朱雪明;杜鸿

    目的 评估基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术直接检测肠杆菌科细菌产碳青霉烯酶效果.方法 收集2018年1月至5月苏州大学附属第二医院分离的21株对亚胺培南和(或)美罗培南敏感性下降的肠杆菌科菌株,包括11株肺炎克雷伯菌、3株产酸克雷伯菌、3株阴沟肠杆菌、4株大肠埃希菌.PCR检测21株菌株分别产A、B和D类碳青霉烯酶基因情况,同时将菌株与0.5 g/L美罗培南溶液孵育2 h后离心取上清进行MALDI-TOF MS检测,通过菌株水解药物所出现的特征性谱峰来快速判断菌株是否产碳青霉烯酶,并与PCR基因检测结果进行Kappa检验统计学比较.结果 PCR检测结果提示21株肠杆菌科细菌碳青霉烯酶基因检测均阳性,其中KPC阳性15株、GES阳性6株、NDM阳性2株、VIM阳性1株、GIM阳性4株、SIM阳性1株,同一菌株可产生一种或多种碳青霉烯酶基因.MALDI-TOF MS直接检测结果显示21株菌株与美罗培南孵育后,在质荷比199 m/z左右处均出现了一个特征性谱峰,为菌株产生碳青霉烯酶水解美罗培南药物所致,与PCR检测碳青霉烯酶基因结果高度一致.结论 本研究运用MALDI-TOF MS技术,可通过捕捉菌株水解碳青霉烯类药物所出现的特征性谱峰来直接检测碳青霉烯酶的产生.

  • 基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱法检测高危型人乳头瘤病毒基因型及临床应用

    作者:喻爽;张艾芃;李亚里;王威;李晶晶;高扬;杨玲;梁羽;李彩云;汪建

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  • 应用SELDI-TOF-MS筛检肝癌血清特异相关候选蛋白的研究

    作者:崔杰峰;杨蓉;刘银坤;康晓楠;黄成;孙瑞霞;李杨

    目的 筛查潜在的小分子量低丰度的HCC血清相关候选蛋白,为肝癌复杂病理机制的全面阐明、理想早期诊断标志物的发现提供新思路.方法 分别收集81例伴有HBV感染和肝硬化背景的HCC患者血清,43例慢性乙型肝炎和36例肝硬化患者血清,采用弱阳离子交换蛋白芯片(WCX2)介质结合SELDI-TOF-MS对患者血清蛋白谱进行检测,并通过Biomarker Wizard软件对生成的蛋白指纹峰分别进行差异归类比较,然后采用消减差异分析确定HCC特异相关候选蛋白.标本检测前,对芯片检测系统的重复性进行分析.结果 同一标本同一芯片内强度CV为17.46%,m/z平均CV为0.024%,不同芯片间强度CV为17.74%,m/z平均CV为0.024%.将信噪比大于5,且超过20%标本具有的蛋白峰认定为有意义峰,在2 000~30 000 m/z范围内,共有128个蛋白指纹峰被确认.HCC与肝硬化患者血清蛋白指纹峰的差异比较分析显示,87个差异蛋白指纹峰有统计学意义(P<0.05),其中强度差异在2倍以上的蛋白指纹峰有45个,在HCC患者血清中2倍上调的15个,2倍下调的30个.从HCC与慢性乙型肝炎血清蛋白指纹峰的差异分析发现,差异有统计学意义的蛋白指纹峰52个(P<0.05),其中强度相差2倍以上的蛋白指纹峰有9个,HCC患者血清中2倍上调的2个,2倍下调的7个.从肝硬化与慢性乙型肝炎患者血清蛋白指纹峰的差异比较分析发现,差异有统计学意义的蛋白指纹峰79个(P<0.05),其中强度相差2倍以上的蛋白指纹峰有28个,在肝硬化患者血清中2倍上调的17个,慢性乙型肝炎患者血清中2倍上调的11个.经消减差异分析筛查,确定在HCC患者血清下调表达的5个公共差异蛋白(2 870、3 941、2 688、3 165、5 483 m/z)及在肝硬化和HCC血清均上调表达的2个公共差异蛋白(3 588、2 017 m/z),但蛋白2 017 m/z在HCC与健康人比较的本所前期工作中的差异无统计学意义(P>0.05).结论 由慢性乙型肝炎和肝硬化背景产生的非特异分泌蛋白的干扰,经消减分析被部分消除,获得的6个血清公共差异蛋白(2 870、3 941、2 688、3 165、5 483、3 588 m/z)在反映HCC病理特征方面具有明显的特异性,且有望成为HCC诊断中新的候选标志物.

  • 蛋白芯片技术筛选肝癌血清标志蛋白的初步研究

    作者:郑燕华;邹德威;冯凯;崔彦;张铭;许洋;李宁;张建中

    目的应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)从肝癌患者血清中筛选标志蛋白,找出佳的标志蛋白组合模式作为临床诊断指标.方法采用WCX2芯片及SELDI-TOF-MS技术对34例肝癌患者及34例健康对照组血清进行蛋白质指纹图谱检测分析,所得到的结果采用Biomarker Wizard和Biomarker Patterns System软件分析.结果发现肝癌患者和健康对照组血清蛋白质指纹图谱之间有17个稳定的标志蛋白,其中有6个标志蛋白在肝癌患者血清中高表达,11个标志蛋白在肝癌患者血清中低表达.分析系统筛选出13 752Da及11 472Da标志蛋白建立起一个肝癌的诊断模型,对肝癌的诊断特异性为97.06%,敏感度为91.18%,及阳性预测率为96.88%.结论 SELDI-TOF-MS技术的特异性及敏感度远远高于目前所采用的某一单独的标志物的血清学诊断,其结果对进一步研究肝癌的蛋白质组学改变及其临床应用可能具有重要意义.

  • 人肝癌组织中APRIL及其受体mRNA水平的定量测定

    作者:张冬雷;鞠少卿;施健;王惠民;倪红兵;苏建友

    目的采用实时荧光定量聚合酶链反应(RFQ-PCR) 技术分析肝癌组织中增殖诱导配体(APRIL)及其受体mRNA的表达水平.方法在APRIL及其受体基因的高保守区设计相应引物和荧光探针,实时检测PCR产物的荧光强度,根据标准品建立的标准曲线,由软件自动计算出待测样本中靶基因mRNA准确含量,并以靶基因和内参β2M mRNA含量的比值作为评价靶基因表达水平的指标.结果 RFQ-PCR检测靶基因mRNA含量的线性范围为10~109 pg/ml,批内和批间重复性测定的变异系数v分别为3.87%~10.12%和6.86%~12.29%.20例肝癌组织样本的检测结果显示肝癌及癌旁组织中APRIL和BCMA的水平均显著高于远端正常组织(P<0.01),而TACI的表达水平在三组间差异无统计学意义(P>0.05).结论成功建立RFQ-PCR检测APRIL及其受体mRNA含量的方法,具有较好的检测灵敏度和重复性;而且发现APRIL在肝癌发生、发展过程中可能起了重要作用,有可能还参与了肿瘤细胞的转移,并主要是通过受体BCMA而不是TACI发挥作用.

  • MALDI-TOF MS技术在临床微生物诊断应用中的挑战

    作者:田月如;关明;李敏

    基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术是临床微生物诊断中一项革命性创新技术,由于其快速、特异、操作简便等优势,现已迅速被临床实验室接受和认可.然而,MALDI-TOF MS技术在临床应用中仍然存在诸多的挑战,如样品制备还未做到优化;鉴定技术存在局限性;数据库质量的提高以及微生物种类的添加还在讨论中;抗菌药物敏感试验领域的应用还存在争议;非常见鉴定结果如何转化到临床治疗仍在探索中等.但是MALDI-TOF MS在临床微生物诊断应用中还有一些需改进之处.

  • MALDI-TOF MS 指纹图谱技术在病原微生物分型中的应用前景

    作者:秦娟秀;李敏

    对同一种属病原微生物进行准确、快速、灵敏地分型对追踪分子溯源、明确传播途径、了解菌株和临床表现之间的关系、探索致病机制和指导临床用药等具有非常重要的意义。近年来基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱( MALDI-TOF MS)以其快速、准确、重复性好、高通量等特点在微生物的鉴定、耐药性和毒力的监测中发挥越来越重要的作用。新的微生物分型方法MALDI-TOF MS指纹图谱分型法也随之诞生。该分型方法具有高通量、快速、易于标准化、费用低廉等特点,在病原微生物流行病学分析、医院感染控制、生物标志物研发等方面有广阔的应用前景。(中华检验医学杂志,2015,38:367-369)

  • 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在细菌分型中的应用进展

    作者:李茹鑫;杨靖;赵建宏

    基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)作为一种快速、准确、高通量的细菌鉴定技术,已经开始逐步应用于临床微生物实验室.然而,MALDI-TOF MS的应用远不止细菌鉴定,其在细菌分型方面同样具有广阔的前景.基于MALDI-TOF MS的分型方法具有简单、快速、成本低廉、高通量等特点,可以在医院感染控制和暴发流行时发挥快速筛选的作用.

  • MALDI-TOF MS技术在快速鉴别肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌中的应用

    作者:高晶晶;王亚南;杨艺;陶云珍;陆文香;钟桥;吴元健;徐卫东

    目的 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴别肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌.方法 收集2013年4月至2016年12月南京医科大学附属苏州医院和苏州大学附属儿童医院临床分离的110株肺炎链球菌和108株口腔/缓症链球菌,并选择肺炎链球菌ATCC49619作为质控菌株,以菌落形态、奥普托欣敏感性试验、胆汁溶菌试验及PCR法检测lytA、spn9802和recA等基因作为判定菌株鉴定结果的参考方法.应用MALDI-TOF MS对所有菌株进行鉴定.选取其中的143株细菌(73株肺炎链球菌和70株口腔/缓症链球菌)作为模型建立菌株,选取剩余的76株细菌(38株肺炎链球菌和38株口腔/缓症链球菌)作为模型验证菌株.采用ClinProTools软件对所有细菌的质谱图谱进行分组统计分析.结果 通过GA、SNN和QC算法得出的敏感度均大于95%,而特异度均为100%.3种算法显示,质荷比为3443、4990、6956和9949 m/z的质谱峰是用于区分肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌为主要的特征性峰,其对应的曲线下面积(AUC)分别为0.884、1、0.999和0.972.峰统计图显示,肺炎链球菌组的3443、4990和9949 m/z峰的强度高于口腔/缓症链球菌组,而6956 m/z峰的强度低于口腔/缓症链球菌组.外部验证显示,除GA模型对肺炎链球菌组和口腔/缓症链球菌组的鉴定正确率分别为97.37%和100.0%,其余2种模型(SNN和QC)对两组细菌的鉴定正确率均为100.0%.结论 MALDI-TOF MS联合ClinProTools可快速准确地鉴别肺炎链球菌与口腔/缓症链球菌,具有高敏感度、高特异度等特点,可为临床诊断肺炎链球菌感染节约时间.

  • 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术在临床微生物鉴定中的应用

    作者:Marc van Nuenen;Kirk Doing;顾兵;Alex van Belkum

    近年来,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)已从物理实验室走进临床微生物实验室,用于微生物的鉴定,正逐步取代由Pasteur和Koch建立的基于细菌表型的传统鉴定方法.许多欧洲微生物实验室目前正在使用MALDI-TOF-MS,大大提高了工作效率.鉴于美国食品药品管理局已经批准其用于体外诊断,MALDI-TOF-MS将很快在美国普及应用.这也将进一步推动了质谱技术在微生物药敏和流行学分型中的发展和应用.本文综述了MALDI-TOF-MS在临床微生物实验室的应用现状,并通过多中心临床试验结果,比较不同MALDI-TOF-MS仪器获得的诊断数据,重点阐述其在临床微生物领域的相关研究和应用.

  • MALDI-TOF MS在临床常见菌快速鉴定中的应用研究

    作者:蒋颜;周宏伟;蔡加昌;张嵘;陈功祥

    目的 评价MALDI-TOF MS在临床常见细菌快速鉴定中的应用.方法 选择浙江大学医学院附属第二医院2008年12月至2009年8月分离自血液、痰液、分泌物和尿液的临床常见细菌和浙江省疾病预防与控制中心收集的沙门菌共426株.包括革兰阳性球菌76株和革兰阴性杆菌350株.采用Vitek系统将细菌鉴定到种,血清凝集试验对沙门菌和志贺菌进行血清分型.PCR扩增91株细菌的16S rDNA基因并测序,所得核苷酸序列与GenBank中的数据库进行比对,确定细菌种类.用MALDI-TOF MS对所有细菌进行快速鉴定,比较不同鉴定方法 之间的符合情况.结果 除沙门菌和志贺菌外的所有革兰阳性球菌和革兰阴性杆菌的Vitek和MALDI-TOF MS两者的鉴定结果 完全符合.23株沙门菌中只有2株肠炎沙门菌鼠伤寒血清型的3种鉴定方法 结果 相符,另有1株伤寒沙门菌、3株甲型副伤寒沙门菌、1株乙型副伤寒沙门菌、1株肠炎沙门菌和1株肠炎沙门菌病牛血清型的血清凝集结果 与16s rDNA基因测序结果 相符.Vitek及血清凝集试验鉴定为福氏志贺菌的4株菌16s rDNA基因测序和MALDI-TOF MS的鉴定结果 均为大肠埃希菌.结论 MALDI-TOF MS可快速、准确地对细菌进行鉴定,具有良好的重复性,但对沙门菌和志贺菌效果不佳.

  • 应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定常见细菌和酵母菌

    作者:张明新;朱敏;王玫;曹银光;鲁辛辛

    目的 应用MALDI-TOF MS鉴定临床常见病原菌.方法 复苏560株临床分离株,其中革兰阳性细菌(G+ )260株、革兰阴性细菌(G-)180株、酵母菌60株、肠道致病菌60株.MALDI-TOF MS鉴定结果与Vitek2 Compact全自动微生物鉴定系统比对,结果差异菌株采用16S rDNA测序验证.结果 MALDI-TOF MS与Vitek2 Compact鉴定结果比较,G+细菌鉴定符合率为94.6%( 246/260),G-细菌鉴定符合率为96.7% (174/180),酵母菌鉴定符合率为95.0% (57/60),肠道致病菌鉴定符合率为93.3%( 56/60).15株鉴定结果不符的菌株经16S rDNA测序确认,结果与Vitek2Compact和MALDI-TOF MS鉴定符合率分别为26.7% (4/15)和66.7%( 10/15).结论 MALDI-TOF MS可用于常见病原微生物鉴定,其快速、低成本的特点具有推广价值.

  • 用2-DE和MALDI-TOF-MS筛选多发性骨髓瘤患者骨髓上清液中标志物

    作者:李佳;赵冠飞;房亚哲;翟玉华;陈文明;吴琳;孙卫红;刘金英;王清涛

    目的 运用2-DE和MALDI-TOF-MS研究MM患者骨髓上清液中差异表达蛋白,以寻找对MM发病机制研究和诊断或鉴别诊断的特异性蛋白质标志物.方法 收集14例MM患者、5例其他血液系统恶性肿瘤患者及5名健康对照者骨髓上清液标本.除去标本中白蛋白和免疫球蛋白G(IgG)后,用2-DE分离3组骨髓上清液标本.用ImageMaster 2D platinum 5.0图像分析软件分析比较3组2-DE凝胶图像,以差异倍数在3倍以上的蛋白点作为候选差异表达蛋白.然后,用MALDI-TOF-MS对重复性较好的候选差异表达蛋白做PMF和二级质谱鉴定.将得到的肽片段质量进行NCBInr 数据库检索,以鉴定出相应的差异表达蛋白.结果 用图像分析软件对3组骨髓上清液2-DE凝胶进行分析比较,从MM组与健康对照组中筛选出47个差异蛋白点,从MM组与疾病对照组中筛选出58个差异蛋白点.从MM组选取41个差异点进行质谱分析并鉴定,发现MM组与其他2组相比,5种高表达蛋白为免疫球蛋白J链、κ轻链、λ轻链、前病毒遗传的Gag多聚蛋白和与半抗原结合的含成熟氧(末)端的催化抗体;3种低表达蛋白为血红蛋白、结合珠蛋白(Hp2)、锌-α2-糖蛋白.这些差异蛋白部分与MM的临床表现相关,部分与MM的发生发展及临床治疗相关.结论 应用2-DE和MALDI-TOF-MS技术从MM患者骨髓上清液标本中筛出与MM疾病相关的8种差异表达蛋白,为进一步研究MM发生发展机制,完善MM诊断、鉴别诊断指标提供了参考依据.

  • 尿蛋白标志物模型早期诊断糖尿病肾病的临床应用

    作者:姜伟;杨永长;肖代雯;黄波;胡琦;黄文芳

    目的 寻找基于蛋白质组学技术早期、快速诊断糖尿病肾病的尿蛋白标志物模型,并探讨其临床应用价值.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser dosorption-ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术及Au芯片(proteinehip gold array)检测292例患者尿蛋白质谱,包括129例糖尿病肾病和163例对照者(61例糖尿病及102名健康体检者).获得的蛋白质谱数据用Biomaker Wizard 3.1软件筛选差异蛋白,通过生物标志模型软件(biomarker patterns software,BPS)建立决策树辨别分析模型,评价其临床诊断价值.对部分筛选的差异蛋白通过比对标准蛋白质谱数据,根据分子量大小进行初步鉴定.结果糖尿病肾病患者与对照者尿液中差异表达的蛋白质峰有40个,其丰度值两组间比较差异均有统计学意义(t值为-9.81~24.52,P均<0.05),通过BPS自动筛选66 916质荷比(m/z)蛋白建立的模型诊断糖尿病肾病敏感度为98.7%(78/79),特异度98.2%(111/113).对糖尿病和糖尿病肾病患者尿蛋白质谱图分析后得到24个差异蛋白质峰,其丰度值两组间比较差异均有统计学意义(t值为-6.95~14.45,P均<0.05),BPS筛选4 008、11 619、66 916 m/z蛋白建立模型区分糖尿病与糖尿病肾病的敏感度(129/129)和特异度(61/61)均为100%.通过比对标准蛋白质谱数据,糖尿病肾病患者尿差异蛋白中m/z11 619、23 529、66 916和79 378,可能为β_2-微球蛋白、α1-微球蛋白、白蛋白和转铁蛋白.结论 基于SELDI-TOF-MS及Au芯片技术检测尿蛋白质谱在鉴别蛋白尿来源、糖尿病肾病的早期快速诊断及肾脏损害评估具有重要应用价值.

  • 用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱进行血清蛋白质组学分析中样品稳定性研究

    作者:邱枫;田亚平

    目的 探索利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF Ms)技术,进行血清样品中蛋白质组学研究的稳定性和重复性.方法 采用德国布鲁克公司Microflex型号质谱仪,应用线性模式,采集范围800~10 000 m/z,以样品前处理(MB-wcx)试剂盒预处理样品,CLNPROT(TM)系统的FlexAnalysis和ClinproTools软件进行数据分析.结果 本研究是在方法学已经建立的基础上,对样品稳定性进行研究.分别对随机选取的2例肿瘤患者和1名健康人群血清样本进行的平行实验结果分析表明,在本实验条件下,所测样品的质荷比(即m/z比值)漂移在实验误差允许范围内,其变异系数(CV值)分别为12.7%、13.1%和18.8%,能够明确区分疾病与健康样本;同时扩大样本量对30名健康人进行验证,其整体峰型和特征性峰保持一致,平均CV值为25.5%,说明其稳定性和重复性完伞满足临床医学实验窒分析要求.结论 在已优化的实验条件下,利用生物质谱技术可获得稳定的血清多肽谱,具有潜在辅助诊断疾病价值.

  • 质谱仪在真菌鉴定中的应用与评价

    作者:王欢;贾天野;鲍春梅;张成龙;张鞠玲;崔恩博;陈素明;徐东平;曲芬

    目的:探讨质谱仪在真菌感染中的应用,评价其鉴定真菌的能力。方法选取分离自我院住院患者的真菌菌株327株,用质谱仪进行快速鉴定,并与VITEK-2(酵母样真菌)和显微镜检查(丝状真菌)的鉴定结果进行比对,差异结果用分子生物学方法确认鉴定。结果依照质谱仪评分标准,227株酵母样真菌在种水平(>2.0)的鉴定率为90.31%,在属水平(>1.7)为98.68%;丝状真菌在种水平的鉴定率为74.00%,在属水平为94.00%。对临床常见的曲霉菌鉴定正确率可达96.74%。结论质谱仪在鉴定真菌的种属水平上都达到了令人满意的结果,尤其鉴定酵母菌和曲霉菌的能力更为突出,可作为临床实验室的常规检测方法。

  • Bruker Biotyper和Vitek MS系统质谱分析鉴定革兰阴性菌临床分离株的比较研究

    作者:王璐;杨柳;任微;褚美玲;孟冬娅;薛文成

    目的:比较并评价两种基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)系统---Bruker MALDI Biotyper系统(以下简称Bruker Biotyper系统)和MALDI-TOF Vitek MS系统(以下简称Vitek MS系统)在革兰阴性菌临床分离株鉴定中的应用。方法收集沈阳军区总医院2012年3月-2013年1月分离自血液、尿液、脑脊液、分泌物、伤口拭子和痰液临床标本的革兰阴性菌共120株。应用Vitek 2 Compact生化鉴定系统将每株细菌鉴定到种,而后采用Bruker Biotyper和Vitek MS系统对其进行鉴定,三者鉴定结果存在差异的菌株经16S rDNA测序终确认菌种。结果对于120株革兰阴性菌临床分离株,Bruker Biotyper和Vitek MS系统在属的水平上正确鉴定率分别为95.0%和92.5%,在种的水平上正确鉴定率分别为89.2%和86.7%,差异均无统计学意义。结论 Bruker Biotyper和Vitek MS系统对革兰阴性菌临床分离株的正确鉴定率不存在差异,两种系统的鉴定结果与各自的图谱数据库有密切关系。

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