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中药燃烧焓、信息熵及生物熵的稳定性揭示其成分间的“虹势性”
目的:根据生物物理学原理探讨生物间代谢的“虹势性”普遍规律,为建立完整的中药物质质量控制方法奠定理论基础.方法:根据生物热力学定律建立中药材的信息熵等状态函数关系式,并以大黄药材醇浸出物为对象,建立指纹图谱,计算生物熵和表观平衡常数,探讨诸状态函数的稳定性,验证“虹热性”规律.结果:全国9地方的大黄醇浸出物的相似度为0.079~0.677;色谱峰面积的相对标准差(RSD)为21.11%~92.51%;而燃烧焓、信息熵、信息量、生物熵、表观平衡常数的RSD分别为2.259%,4.228%,20.190%,-2.254%,13.340%.结论:全国各地大黄醇浸出物的燃烧焓、信息熵、生物熵是稳定的.由中药成分的燃烧焓等参数可构成中药成分的宏观物质质量体系.
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HLA-A新等位基因HLA-A*2468的核苷酸序列分析
人类白细胞抗原(HIA)系统是目前所知为复杂的人类遗传多态性系统,其复合体定位于6号染色体的短臂上,包括多个基因座位,每一个座位上有多个等位基因,目前发现的HLA等位基因已超过2799个[1].
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慢性乙型肝炎后肝硬化与HLAⅡ类抗原等位基因相关性研究
人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)是目前所知复杂的遗传多态性系统,作为个体组织细胞的遗传标志,特别是免疫活性细胞上的HLA具有向抗原特异性T细胞受体传递抗原多肽的生物学特性,HLA分子在抗原识别、免疫应答和免疫调控,破坏外来抗原靶细胞方面起着重要作用.
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个体化用药的基因诊断—检验医师培养新方向
人类基因组计划(human genome project,HGP)确定、阐明和记录了组成人类基因组的全部DNA序列信息,基因组序列的公布,为传统医学向个体化医疗的转化开启了大门.继人类基因组计划后,国际人类基因组单体型图计划建立了人类全基因组遗传多态图谱,描述了人类基因组中常见遗传多态位点的目录、形式及位置,展现了遗传差异在同一群体内部和不同人群间的分布状况,为疾病的易感性研究及个体化诊疗提供分子基础.个体化用药是个体化治疗的重要组成部分,基因水平研究的不断深入使得以基因为导向的个体化用药从理论走向了现实.
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基因测序确认二例造血干细胞捐献者新等位基因HLA-DRB1*0114
人类白细胞抗原(HLA)是迄今所知的人类复杂的免疫遗传多态性系统,由于分子生物学技术尤其是DNA测序技术在HLA分型上的应用,新的等位基因不断被发现[1-3].随着中国造血干细胞库捐献者数量的增加,不断地在中国人中发现新等位基因的报道.我们报告2例在对中华骨髓库陕西分库注册的捐献者进行HLA低分辨的过程中发现的一个新等位基因,该等位基因2006年3月被世界卫生组织(WHO)HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1*0114.
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DNA测序鉴定新等位基因人白细胞抗原-Cw*1521
人白细胞抗原(HLA)系统是人类复杂的遗传多态性系统,迄今已发现3095个等位基因.HLA-Cw属于经典的HLA-Ⅰ类基因,位于HLA-A和HLA-B位点之间,于1970年被发现,目前HLA-Cw位点已经被发现了190多个等位基因[1].我们在常规白血病患者高分辨率分型的样本中发现了1个新的HLA-Cw等位基因,2007年4月被世界卫生组织人白细胞抗原命名委员会正式命名为HLA-Cw*1521.
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DNA损伤修复基因hOGG1的遗传多态与乙肝相关性HCC的风险
目的:探讨DNA损伤修复基因hOGG1的遗传多态Ser326Cys与肝细胞癌(HCC)易感性的关系.方法:应用基因测序分型方法,分析96例HCC患者和96例健康对照hOGG1的遗传多态及与HBV感染的交互作用.结果:HCC病例组的Cys/Cys,Cys/Ser和Ser/Ser基因型分别为20.9%,44.2%和34.9%.Ser/Cys杂合子个体的OR值为1.5,Cys/Cys纯合子个体的OR值为1.9,明显高于Ser/Ser个体,表现出剂量效应.HBV感染者发生HCC的相对风险度是非HBV感染者的9倍(OR=9.2;95%CI0.99-5.9).对于HCC,hOGG1-Ser326Cys变异或HBV感染单一因素的OR值分别为5.5(95%CI 0.7-240.1)和10.9(95%CI1.6-453.3),但携带变异基因者如果感染HBV,OR值则高达27.8(95%CI4.7-970.2).结论:DNA修复基因hOGG1的Cys等位基因可能增加HCC的遗传易感性,他与HBV协同在乙肝相关性HCC的发生中起着重要作用.
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急性冠脉综合征的药物基因组学研究进展
不同患者对许多心血管病药物的治疗效果和不良反应存在较大差异.患者的生理状态(如年龄、性别、种族、肥胖、高血压、糖尿病等)、环境危险因素(如吸烟、饮酒)、以及遗传多态性是产生个体差异的重要原因.药物基因组学(pharmacogenomics)的目标是发现这些影响药物反应的遗传因素,阐明不同个体的药物反应(有效性和不良反应)差异,终针对个体基因型指导个体化用药.本文对急性冠脉综合征治疗药物(包括抗血小板药物、纤溶剂、抗凝剂、β阻滞剂)的药物基因组学研究进展进行综述,并总结了目前研究的局限性及发展方向.
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MBD4基因的单核苷酸多态与肝细胞肝癌遗传易感性研究
目的:探索DNA损伤修复基因hMBD4的遗传多态Glu346Lys与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)易感性的关系.方法: 对96例原发性HCC患者和96例对照外周血DNA进行测序分型.结果: 我们发现正常人群Glu/Glu、Glu/Lys、 Lys/Lys基因型频率分别为40.4%、46.8%和12.8%,HCC组为41.7%、48.8%和9.5%.等位基因Lys频率在病例和对照分别为33.9%和36.2%,两组比较差异无统计学意义,P>0.05.结论: DNA修复基因hMBD4的Lys等位基因可能与HCC的遗传易感性无关.
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晚期非小细胞肺癌对铂类药物的化疗敏感性与p53和p73基因多态的关系
目的探讨细胞凋亡相关基因p53和p73的遗传多态,与晚期非小细胞肺癌(NSCLC)对铂类药物化疗敏感性的关系.方法以聚合酶链反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)和突变扩增阻抑系统(ARMS)分析方法,对165例以顺铂(DDP)或卡铂(CBP)为主进行化疗的晚期NSCLC患者,进行p53第72密码子Arg→Pro多态,和p73第2外显子G4C14→A4T14多态的检测,2~3个疗程后进行效果评价.以非条件Logistic回归模型比较不同基因型与化疗疗效的关系.结果携带p53 72Pro等位基因患者的化疗敏感性,是携带p53 72Arg/Arg基因型患者的2.46倍(95%CI,1.11~5.45,P=0.026);而携带至少1个p73突变等位基因(A4T14)的患者,其化疗敏感性是携带p73 G4C14/G4C14基因型患者的2.22倍(95% CI,1.14~4.30,P=0.019).2个多态位点合并分析结果显示,同时携带p53和p73野生基因型的患者,化疗有效率为7.7%;而携带1个、2个和≥3个p53和p73变异等位基因的患者,化疗有效率分别为34.8%、42.2%和40.7%.结论p53和p73基因遗传多态与晚期NSCLC患者对以铂类药物为主的化疗敏感性有关.
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鼠双微体同源基因2遗传多态与结直肠癌患病风险的相关性
目的 探讨p53 72 Arg→Pro和鼠双微体同源基因2(MDM2) 309 T→G多态与结直肠癌(CRC)发生发展的关系.方法 采用病例-对照关联研究方法,分析1000例CRC和1300例正常对照中p53 72 Arg→Pro和MDM2 309 T→G的基因型.以多因素Logistic回归模型计算各基因型的比值比(OR)及其95%可信区间(CI).结果 携带MDM2 309 GG或TG基因型者患CRC的风险比TT基因型者显著增高,OR分别为2.06(95%CI为1.62~2.62)和1.31(95%CI为1.06~1.62).p53 72 Arg→Pro多态与CRC风险不相关.两个基因多态联合分析表明,既携带MDM2 309 GG,又携带p53 72 Pro/Pro基因型者,患CRC的OR显著高于携带MDM2 309 TT和p53 72 Pro/Pro基因型者[2.75(95%CI为1.60~4.70)比1.09(95%CI为0.63~1.88);χ2=9.83,P=0.002].结论 MDM2基因的遗传多态可能是CRC的遗传易感性因素.
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人白细胞抗原多态性与HIV/AIDS的关联及其在疫苗设计中的意义
人白细胞抗原(HLA)系统是目前所知为复杂的遗传多态性系统,它们负责免疫细胞与其它细胞间的相互识别,参与诱导和调控免疫应答反应.HLA与疾病相关性的研究至今已有30多年的历史,HLA的Ⅰ类和Ⅱ类抗原在某些传染病和自身免疫病的作用,已被人们广泛认识.艾滋病(AIDS)是由艾滋病病毒(HIV)感染引起的严重传染性疾病,目前尚无有效的预防性疫苗和治愈措施.近几年来的研究表明,HLA与HIV感染及发病进程存在关联,有些HLA型别的个体表现出对该疾病的天然抗性,虽多次暴露而不被感染.相反,有些型别的个体则对HIV易感.寻找AIDS的易感和抗性基因是一项非常重要的研究工作,对AIDS与HLA相关性的探讨或许可以另辟蹊径,来阐明疾病的发生机制,为AIDS的基因治疗和免疫预防提供有效的切入途径.
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遗传多态和吸烟与肺癌风险--人类疾病中基因-环境相互作用的范例
近10多年来,我国城乡人群的肺癌发生率呈显著而稳定上升的趋势,已成为危害严重的恶性病之一.吸烟是肺癌确认的主要病因.在我国,50%的肺癌是吸烟引起的,与不吸烟者比较吸烟者发生肺癌的风险增加3~10倍.
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凝血因子基因突变及MTHFR/C677T基因多态性与深静脉血栓形成的关系
我们应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCRRFLP)方法对103例深静脉血栓形成(DVT)患者及106名正常对照进行了凝血因子Ⅴ(FⅤ)Leiden、FⅡ/G20210A、FⅩⅢ/V34L以及MTHFR/C677T基因多态性的检测分析,旨在探讨这些遗传多态因子与DVT之间可能的相关性.
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DNA损伤修复基因hOGG1的遗传多态与肝癌易感性研究
目的:探索DNA损伤修复基因hOGG1的遗传多态Ser326Cys与肝细胞肝癌易感性的关系.方法:对96例原发性肝细胞肝癌患者和96例对照外周血DNA进行测序分型.结果:Ser/Cys杂合子个体的0R值为1.5,Cys/Cys纯合子个体的0R值为1.9,表现出剂量效应.结论:DNA修复基因hOGG1的Cys等位基因可能增加肝细胞肝癌的遗传易感性.
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GSTM1和CYP2E1遗传多态及饮酒因素对苯酚和丙酮作业工人DNA损伤的影响
目的研究GSTM1和CYP2E1 基因型与苯酚、丙酮生产工人外周血淋巴细胞DNA损伤的关系.方法应用PCR-RFLP方法对苯酚、丙酮作业工人和非接触对照人员的GSTM1和CYP2E1基因型进行检测,采用"彗星"电泳技术检测外周血淋巴细胞DNA的损伤.结果苯酚、丙酮作业工人中GSTM1基因缺陷型个体的人均彗星细胞数为(1.34±1.38), 彗星细胞尾长与总长的比值为(0.17±0.15), 与基因正常型个体比较,差异有显著性(P<0.05), CYP2E1突变型酒精消耗个体人均彗星细胞数为(1.88±0.83), 彗星细胞尾长与总长的比值为(0.22±0.11), 均明显高于野生型非酒精消耗个体,差异有显著性(P<0.05,P<0.01).结论苯酚、丙酮作业工人的DNA损伤因GSTM1和CYP2E1基因型的不同存在差异,饮酒可加重损害作用.
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红花宏观质量参数稳定性与“虹势性”规律的研究
目的 在本课题组“网通虹势”数学模型基础上,根据生物物理学原理探讨红花成分间代谢的虹势性规律,为建立完整红花质量控制方法提供参考数据,扩大“网通虹势”理论在不同中药材的应用.方法 根据生物热力学定律建立红花药材的信息熵等状态函数关系式,结合指纹图谱,计算生物熵和表观平衡常数,探讨诸状态函数的稳定性,验证“虹势性”规律.结果 全国13地方的红花水提物的相似度为0.037 ~0.962;燃烧焓、信息熵、信息量、生物熵、表观平衡常数的RSD分别为-2.23%,8.35%,38.02%,-14.36%,32.65%.结论 13地方红花水提物的燃烧焓、信息熵、生物熵是稳定的.由中药成分的燃烧焓等参数可构成中药成分宏观质量体系.
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多药耐药基因多态性与乳腺癌化疗关系的研究进展
肿瘤的多药耐药(multidrug resistant,MDR)是指肿瘤细胞在接触了一种抗肿瘤药物并出现抗药性的同时,对其他结构不同、作用部位不同的药物也产生交叉耐药的现象,是导致肿瘤化疗失败的主要原因.MDR可有2种不同的表型,一种是对第1次治疗即产生耐药,称天然耐药(natural resistance);另一种是在治疗过程中产生耐药,称获得性耐药(acquired resistance).
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MAOA-uVNTR多态性与秦巴山区NSMR及个体认知能力的研究
目的:单胺氧化酶A(monoamine oxidase A,MAOA)基因的5'启动区可变数重复多态(MAOA-uVNTR)可引起其活性变化,与多种人类神经精神类疾病相关.在我国汉族人群中,MAOA-uVNTR多态性与非特异性精神发育迟滞(non-specific mental retardation,NSMR)及个体认知能力的影响尚不清楚.方法:利用分子遗传学方法对547例秦巴山区NSMR病例-对照儿童进行MAOA-uVNTR多态性检测,获得该位点等位基因的频率分布.结果:女性中MAOA-uVNTR位点的基因型频率分布具有明显差异,高活性基因型在女性患者中富集,明显高于对照组(x2=3.34,P=0.06),其发病风险是低活性组的1.8倍(95% CI:0.93~3.38).与之相应,AVONA分析结果显示,低活性基因型女性患者的操作智商水平高于高活性基因型女性患者6.36分(P=0.06,95%CI:-1.14~13.86).结论:MAOA-uVNTR位点多态性与秦巴山区人群NSMR有关一定的相关性,其作用可能主要呈现在对个体操作智商水平的影响.另外,MAOA基因遗传多态性的性别差异也值得深入研究.但上述结论还需要用更大样本量、更高遗传标记密度的方法进行深入研究.
关键词: 非特异性精神发育迟滞 遗传多态 认知能力 -
CYP450氧化还原酶遗传多态性对CYP酶影响的研究进展
细胞色素P450氧化还原酶(Cytochrome P450 0xidoreductase,POR)是将电子从NADPH转运至所有肝微粒体的细胞色素P450氧化酶(Cytochrome P450 monooxygenases,CYP)中的唯一供体.药物、类固醇激素等物质的代谢和转化需要CYP参与.POR基因具有遗传多态性,遗传变异可以改变CYP活性,引起P450氧化还原酶缺陷(P450 0xidoreductase deficiency,PORD)、临床药物代谢和反应差异.本文将从POR的结构功能、基因突变引起的疾病及其对酶活性影响三个方面进行论述,总结近年来POR遗传多态性对CYP酶影响的新研究进展.