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艾滋病病毒感染者体内基因多态性的初步分析
我们近的研究发现,和美国白人及欧洲人群相比,中国普通人群(如汉族、维吾尔族、藏族等)的CCR5Δ32和CCR5m303等位基因突变频率极低,这提示,我国人群对性接触传播的HIV-1病毒株(R5)有较大的遗传易感性.
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TTV部分基因的克隆及序列测定
为了弄清萍乡地区TT病毒(TTV)感染情况,分析本地区TTV株基因结构特点,我们对江西省萍乡地区8例TT病毒株进行了部分基因的克隆及序列测定.
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无血清免疫学标志的乙肝病毒株分子生物学特性
随着聚合酶链反应法(PCR)技术广泛用于扩增血清和肝脏组织中的乙型肝炎病毒(HBV)DNA,现已发现一些乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阴性的HBV变异株[1],人感染这些HBV变异株后,无血清HBV标记,从而给诊断、治疗和预防带来困难,目前对这些变异株在HBV携带者中所占比例及其致病性尚未充分了解。因此,研究其分子生物学特性具有重要意义。本文报道一例无血清免疫学标志的原发性肝癌患者HBv变异株的分子生物学特性。
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柯萨奇病毒B5引起济南儿童病毒性脑炎流行的血清流行病学调查
2003年夏秋季山东济南地区发生不明原因的病毒性脑炎(VE)流行,仅济南市儿童医院就收入院病人150例.从本次脑炎流行患儿脑脊液标本中分离得到5株病毒,以分子生物学方法鉴定其为肠道病毒--柯萨奇病毒B5(CVB5).为进一步验证CVB5与本次脑炎流行的因果关系,我们用分离所得病毒株制备抗原,通过间接ELISA对本次脑炎流行进行血清流行病学调查.
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2009年甲型H1N1流感病毒HA区参照序列的建立及变异分析
2009年3月开始全球暴发了新型H1N1流感,这是继1918年、1977-1978年之后国际上第3次H1N1流感暴发,甲型H1N1流感病毒属于RNA病毒,极易发生基因变异,当变异较大时出现抗原漂移或抗原转变,不同患者来源的病毒株基因序列也具有差异性.
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深圳5例肠道病毒71型手足口病病毒株全基因组测序分析
通过RD细胞(横纹肌肉瘤细胞)和Vero细胞进行病毒培养的方法,分离到5株手足口病患者的EV71型病毒株,病毒命名为SZ/08-1/08/CHN、SZ/08-4/08/CHN、SZ/08-28/08/CHN、SZ/08-121/08/CHN和SZ/08-605/08/CHN.
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甲型H1N1流感14例临床特点分析
2009年3月,墨西哥暴发"人感染猪流感"疫情,并迅速在全球范围内蔓延.世界卫生组织(WHO)初始将次型流感称为"人感染猪流感",后将其更名为"甲型H1N1流感".6月11日全球进入流感大流行阶段.此次流感为一种新型呼吸道传染病,其病原为新甲型H1N1流感病毒株,病毒基因中包含有人流感、禽流感和猪流感三种流感病毒的基因片段.
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甲型H1N1流感诊疗方案(2009年第三版)
2009年3月,墨西哥暴发"人感染猪流感"疫情,并迅速在全球范围内蔓延.世界卫生组织(WHO)初始将此型流感称为"人感染猪流感",后将其更名为"甲型H1N1流感".6月11日,WHO宣布将甲型H1N1流感大流行警告级别提升为6级,全球进入流感大流行阶段.此次流感为一种新型呼吸道传染病,其病原为新甲型H1N1流感病毒株,病毒基因中包含有猪流感、禽流感和人流感三种流感病毒的基因片段.
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疫苗衍生脊髓灰质炎病毒感染及其预防策略
自1988年世界卫生组织(WHO)提出于2000年全球消灭脊髓灰质炎(脊灰)以来,全球消灭脊灰工作取得了重大进展,脊灰病例下降99%,由1988年的35万例,降至2000年的3 500例以下.2000年10月29日,西太平洋地区宣布:继美洲之后成为无本土脊灰野病毒株传播的地区.
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影响拉米夫定相关乙肝病毒YMDD变异的因素
拉米夫定是抗乙肝病毒的主要药物之一,因其抗病毒作用确切而被广泛用于治疗慢性乙型肝炎.随着拉米夫定的广泛应用,由拉米夫定导致的耐药问题逐渐成为人们关注的焦点诱发乙肝病毒YMDD变异是引起拉米夫定耐药的主要机制.当YMDD变异病毒株成为优势株时就会影响拉米夫定的抗病毒疗效,出现耐药,导致病毒重新活跃,甚至病情的加重或死亡.目前研究认为影响拉米夫定相关YMDD变异的因素有:(1)拉米夫定用药时间.用药时间越长,发生YMDD变异的几率越大;(2)用药前病毒荷量、ALT水平及HBeAg状态.基线HBV DNA滴度高、ALT水平低或HBeAg阳性者较易发生YMDD变异;(3)前C区变异;(4)乙肝病毒基因型;(5)联合用药.
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丙型肝炎病毒NS5A蛋白的反式激活作用研究
0引言丙型肝炎病毒(HCV)是一种单股正链RNA病毒,编码一种多蛋白分子,在病毒和宿主细胞蛋白酶的共同裂解作用下,至少裂解为3种结构蛋白(C、E1和E2)和6种非结构蛋白(NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B)[1,2].NS5 A是非结构蛋白的一种,哺乳动物细胞表达的NS5A蛋白以两种形式存在,分子量分别为56 kD和58 kD.HCV NS5A是HCV基因组编码的一种为重要的具有多种生物学活性的非结构蛋白质[3-5],是HCV基因组编码的一种具有反式激活作用等多种生物学活性的非结构蛋白质.其基因序列的变异,决定部分HCV病毒株对于IFN-α治疗的疗效应答.HCV NS5A蛋白还具有结合双链RNA激酶(PKR)的生物学活性,对于HCV感染的靶细胞的细胞周期与细胞凋亡的分子生物学调节机制密切相关[6].
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乙型肝炎病毒准种研究的临床意义
0引言乙型肝炎病毒(HBV)感染,不仅引起急性、慢性病毒性肝炎,而且与肝纤维化、肝细胞癌(HCC)的发生和发展密切相关[1].不同的HBV感染患者体内的HBV基因序列是不同的,也得到了人们的广泛的重视,这就是HBV不同的基因型(genotype)和血清型(serotype)[2].但是,针对HBV感染特定的患者来说,虽然个体病毒基因突变的研究得到了重视,但体内不同的HBV拷贝之间基因序列的关系究竟如何,多少年来相对受到忽视.研究表明,HBV感染个体的体内HBV不同病毒基因序列在统计学上高度一致,基因序列的同源性高达95%以上,但每株病毒的基因序列都不相同,这种差别较小不能构成不同的基因型和血清型,但的确又不相同.准种(quasispecies)概念的提出就是描述HBV感染个体体内不同病毒株基因序列高度一致,但又有差别的一种存在状态[3].
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乙型肝炎病毒蛋白表型定义初探
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分型方式,并根据病毒蛋白结构提出新的病毒蛋白分型方式.方法:自GenBank中按基因型搜索符合要求的HBV基因组序列,并应用Vector NTI suite 8.0版软件进行基因组核苷酸及各基因编码蛋白质序列比较,并利用软件分析前前-S基因、前-X基因和前-C基因的存在状态.结果:在GenBank中根据HBV基因型分型搜索出119个病毒株全基因组,比较后发现选择病毒株基因组核苷酸序列总阳性率和总一致率分别为95.7%和147.7%;选择病毒株编码的全C蛋白、全S蛋白、全X蛋白和多聚酶的总阳性率分别为98.6%、87.3%、57.2%和95.2%,总一致率分别为37.4%、24.1%、27.7%和43.5%.在病毒群中,33.61%的病毒株编码前前-S多肽,14.3%的病毒株编码前-X多肽,26.1%的病毒株不编码前-C多肽,94.1%编码前-X多肽的病毒株同时编码前前-S多肽.基因组1-700 nt一致率30.6%,1 103-1 653 nt一致率20.8%,为高变区;基因组1 654-1 950 nt的一致率为74.2%,为高保守区.4种病毒蛋白各有其相应的高变区和高保守区根据病毒蛋白前导性序列的变异情况提出新的分型方法,命名为蛋白表型.蛋白表型分7型,Ⅳ型为主要流行表型,占39.5%,V型和VⅦ型各占19.3%.亚洲HBV蛋白分型分布分散,Ⅰ、Ⅳ、Ⅴ和Ⅶ型所占比例均大于20%;欧洲Ⅳ型占58.3%,Ⅶ型占25.0%,Ⅴ型占13.9%.结论:在综合分析HBV基因组的基础上,初步划分出HBV基因组和病毒蛋白内部存在的高变区和高保守区提出蛋白表型的新概念,并综合展示基因核苷酸突变所导致的病毒蛋白的结构差异.
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鼠肝炎病毒3型N蛋白Ⅰ区激活mfg12凝血酶原酶基因
目的:研究鉴定激活mfgl2凝血酶原酶基因之冠状病毒3型或A59型鼠肝炎病毒(MHV-3,MHV-A59)核心(N)蛋白的功能区域.方法:应用定点突变技术、与mfgl2启动子共转染实验明确mfgl2凝血酶原酶基因之MHV-3或MHV-A59 N蛋白的功能区域.N蛋白内含Ⅰ基因突变病毒株Alb 110和其野生株Alb 111体外感染Balb/cJ小鼠巨噬细胞、Ⅰ基因表达载体与mfgl2启动子共转染实验阐明Ⅰ蛋白在mfgl2基因激活中的作用.结果:N蛋白包含由两个可变间隔区(A,B)隔开的三个结构区(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ),MHV-A59N蛋白Ⅰ区可增强mfgl2转录活性,当其基因序列突变为非嗜肝性MHV-JHM或MHV-21区序列时,则丧失激活mfgl2启动子转录活性的功能.Ⅰ基因突变病毒株Alb 110和其野生株Alb 111体外感染Balb/cJ小鼠巨噬细胞后对mfgl2的激活无显著差异,共转染实验阐明Ⅰ蛋白并非mfgl2基因激活中的必备因素,该组mfgl2启动子转录活性与对照组无显著差异,而N蛋白可激活mfgl2启动子,使其转录活性提高62倍.结论:鼠肝炎病毒N蛋白Ⅰ区为激活mfgl2凝血酶原酶基因的病毒蛋白功能区域.
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乙型肝炎病毒基因组高变区界定的初步研究
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组是否存在高保守区或高变区,并探讨前-前-S基因和前-X基因的存在方式.方法:自GenBank中按血清型搜索符合要求的HBV全基因组序列,并应用Vector 6.0版软件进行核苷酸序列同源性的分析和比较.结果:GenBank中搜索出28个adr血清型和22个adw血清型HBV病毒株全基因组,比较后发现2种血清型的核苷酸序列总一致率分别为76.6%和73.9%;adr血清型病毒株存有高度变异区和高度变异区,一致率分别为54.5%和92.1%;adw血清型基因组内部含有高度保守区,一致率为85.0%,不含有高度变异区.前-前-S区的存在是较为普遍的现象,而前-X区的编码具有adr血清型特异性特点,在某些病毒基因组中,因为存在A2608→C/T和C/A2733→T替换突变,导致其前-X基因编码区起始密码子突变,因此部分HBV基因组无前-X基因结构区.结论:HBV基因组内部可能存在高度保守区,前-前-S区的存在是一个重要的现象,而前-X编码区具有adr血清型特异性的特点.
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关键词之三流感痘苗是预防流感有效手段
流感是一种非常特殊的疾病,流行时的快速传播及极高的发病率,很少有其他传染病可以与之相比.流感大流行的病毒株一旦形成,可以在数月甚至更短的时间内传遍全球,在很短时间会导致20%~30%甚至更多的人被感染,给正常的社会秩序及人民生活带来极大混乱,如果事先缺乏必要的准备,其后果将是灾难性的.
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流行性感冒的流行及其对策
近年来禽流感病毒连续在亚洲多个国家造成人类感染,形成了对公共卫生的严重威胁,同时也一再提醒人们,一次新的流感大流行随时可能发生.由于大流行不但使发病率和病死率增高,给医疗卫生机构造成巨大的压力,而且还会对社会的安定和国民经济产生很大的负面影响,因此各个国家和地区都积极做好相应的计划安排以及采取适当的措施,以应付突发事件的发生.由世界卫生组织(WHO)牵头的全球流感网络(global influenza network)正密切注视及加强监测各地的流感疫情,并不断努力研究对各种病毒流行株的检测与鉴定.这些努力将有助于尽早发现可能引起大流行的病毒株,为研发新流感疫苗提供依据.
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流行性感冒临床诊断和治疗指南(2004年修订稿)
一、前言流行性感冒(influenza,简称流感)是由流行性感冒病毒引起的急性呼吸道传染病,是人类面临的主要公共健康问题之一.1918年,20世纪第一次流感世界大流行死亡人数达2 000万,比第一次世界大战死亡人数还多,病毒株是H1N1,以后陆续在1957年(H2N2)、1968年(H3N2)、1977年(H1N1)均有大流行.据统计,流感每年的发病率为10%~30%,其流行病学的特点是:突然暴发,迅速蔓延,播及面广.流感流行具有一定的季节性.我国北方常发生于冬季,而南方多发生在冬夏两季.流感发病率高,人群普遍易感[1].
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抗流行性感冒病毒药物在防治中的经济学研究
我国是流行性感冒(流感)的高发地区,20世纪4次世界性大流行有3次起源于我国.近年来发现新的流感病毒株多源自中国.人群通过感染或接种会产生免疫力,但对新的变异病毒株无保护作用.由于流感病毒的变异非常迅速,而人们对流感病毒变异所产生的新种系又往往缺乏免疫力,所以流感的爆发和大流行可能会是灾难性的.
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甲型H1N1流感诊疗方案(2009年第三版)
2009年3月,墨西哥暴发"人感染猪流感"疫情,并迅速在全球范围内蔓延.WHO初始将此型流感称为"人感染猪流感",后将其更名为"甲型H1N1流感".6月11日,WHO宣布将甲型H1N1流感大流行警告级别提升为6级,全球进入流感大流行阶段.此次流感为一种新型呼吸道传染病,其病原为新甲型H1N1流感病毒株,病毒基因中包含有猪流感、禽流感和人流感三种流感病毒的基因片段.本诊疗方案是在7月10日第二版诊疗方案基础上,依据近期国内外研究成果及我国甲型H1N1流感诊疗经验修订而成.由于这种甲型H1N1流感是一种新发疾病,其疾病规律仍待进一步观察和研究.