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Fba蛋白对化脓性链球菌结合FH和FHL-1的促进作用
A族链球菌(group A Streptococcus,GAS)在临床上存在着反复感染及难以治愈等问题.Cleary的研究[1]证明,GAS可以侵入细胞而逃避攻击.Fba,是一种新型表面蛋白,由M1血清型GAS 90-226分离株表达.以往研究资料显示,M1血清型GAS能通过其表面的Fba蛋白结合宿主补体旁路激活途径中协助Ⅰ因子降解C3b的两种重要蛋白FH、FHL-1,并以此促进GAS进入上皮细胞,可能与逃避抗生素作用及免疫系统攻击有关[2].本研究拟通过对5个临床分离的Fba菌株(Ⅰ~Ⅴ)的实验,了解Fba与FH/FHL-1的相互作用关系,为进一步阐明GAS致病机理提供实验依据.
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2008-2009年肠道病毒71型贵州省分离株的基因特征分析
肠道病毒71型(EV71)感染主要引起手足口病,近年来,EV71病毒的流行在亚太地区呈上升趋势,其中令人关注的就是EV71的流行引起患儿的神经症状甚至死亡.贵州省自该病纳入法定传染病管理以来发现2009年感染EV71的患儿及重症病例比2008年多,同时在2009年初实验室诊断因EV71感染引起了患儿死亡,疫情也比2008年开始的早,我们对2008-2009年的手足口病临床标本进行了实验室诊断,并进行了基因测序及特征分析,以期发现是否发生了抗原漂移,分析引起重症的EV71毒株是否与核苷酸序列有相关性,现将结果报告如下.
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HCV山东株C区的基因序列分析
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)为RNA病毒,其基因组的变异性较大,不同地理区域分离株的基因组结构有较大差异,根据病毒编码区和非编码区核苷酸序列的不同可把病毒分为不同的基因型.对HCV基因型的研究国内外均有报道.本研究采用C区基因的核苷酸序列作为HCV基因分型的依据,对山东省HCV地方株的C区进行了序列测定及分析,以摸清山东省HCV地方株的基因型.
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应用分子生物学方法对黑线姬鼠体内恙虫病东方体基因型分析
从野外优势鼠种黑线姬鼠分离到的恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi,Ot)与恙虫病人Ot分离株血清型别相同.为进一步从分子水平了解黑线姬鼠的宿主作用,采用Nested-PCR结合限制性内切酶片段长度多态分析(RFLP)技术对Ot-Sta56基因型进行分析.
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结核分枝杆菌对乙胺丁醇耐药突变基因检测方法的建立
乙胺丁醇(EMB)是一线抗结核药物,近的研究结果表明,结核分枝杆菌(结核菌)对EMB耐药的产生与阿拉伯糖基转移酶编码基因embB改变有关.其中embB基因(尤其是306位密码子)突变是产生对EMB耐药的主要分子机制.聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)是近年发展起来的常用的基因突变分析技术,结合染色法(silver staining),使其应用前景更为广阔.我们应用PCR-SSCP银染技术和PCR-直接测序法对河南省耐药监测中收集的87株结核分离株embB基因进行了研究.
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儿童肺炎链球菌分离株pbp2B基因突变分析
肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,SP)是引起儿童呼吸道感染的常见病原菌.近年我国多中心研究发现,无论是儿童还是成人所分离到的青霉素耐药SP(penicillin resistant streptococcus pneumoniae,PRSP)已占SP分离总数的10.0%~50.0%,并呈上升趋势[1,2].PRSP主要为青霉素结合蛋白(penicillin-binding proteins,PBPs)编码基因突变所致[3、4].为了解我国耐青霉素SP菌PBPs基因的突变状况,我们对2002年9月至2003年4月28株分离自苏州地区患儿呼吸道的SP菌之PBP2B亚单位编码基因pbp2B进行了套式聚合酶链反应(nested polymerase chain reaction, nPCR)扩增及其产物的全自动DNA序列测定.
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建立快速检验结核分枝杆菌复合群的方法
近年来,非典型结核分枝杆菌感染引起的结核病发病率呈上升趋势。这种病的临床表现,X线特征和痰液涂片抗酸染色与结核病极其相似,很难鉴别。原用的非典型分枝杆菌生化反应方法繁琐[1],历时2个月,影响诊断与治疗。故建立快速检验结核分枝杆菌(结核菌)复合群的方法有极其重要的意义。现将该方法介绍如下。 一、材料与方法 1.标本来源:为本院住院已确诊为肺结核患者痰标本80份。经过L-J氏培养基或米氏7H-10培养基或BACTEC-960培养的分离株,提取分离株DNA(同一般DNA提取法),置零下20℃保存备用。结核标准株(H37RV)与各种非结核标准株由北京结核防治研究所提供。
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两种固体培养基对分枝杆菌培养影响的比较
我们根据文献[1]关于在改良罗氏培养基(L-J)中加入丙酮酸钠的报道,试以丙酮酸钠代替L-J中的甘油,对临床分枝杆菌纯分离株进行了与传统L-J法的比较探讨.经504株临床分枝杆菌分离株的培养比较后发现,用丙酮酸钠代替L-J中的甘油,其无论是培养时间或是菌落形态以及数量,都明显优于传统L-J(P≤0.01).
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多耐药大肠埃希菌尿液分离株毒力基因检出ompT基因新亚型
大肠埃希菌(Escherichia coli,ECO)一般多不致病,为人体肠道中主要和数量多的寄生菌.但某些血清型菌株的致病性很强,可引起严重疾病甚至死亡,被称为致病性ECO,必须进行重点监测和研究.例如2011年肠出血性ECO(EHEC)感染疫情从5月中旬开始在德国蔓延,截止到6月11日疫情已扩散至欧洲和美国等13个国家,已导致25人死亡,近3千人患病.
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727株不同人群艰难梭菌分离株的耐药性特征
艰难梭菌是一种革兰阳性专性厌氧芽孢杆菌,为人类肠道的正常菌群。2003年以来,艰难梭菌感染( Clostridium difficile infection,CDI)的发病率和疾病严重程度在全球范围内呈上升趋势,尤其是艰难梭菌高产毒株( BI/NAP1/027/毒素Ⅲ型)的出现和暴发流行,使得艰难梭菌成为医院获得性腹泻的主要病原菌之一。027型高于毒株对多种抗生素耐药,在其暴发流行中起到了一定的作用[1]。近年来有报道称CDI的传统治疗药物甲硝唑和万古霉素的敏感性有所下降,且治愈后复发率高达25%~60%[2]。国内对CDI的关注也逐渐增多[3-4],但艰难梭菌耐药性方面的相关报道较少,且菌株数量少,标本来源单一。因此,本研究对近年来从河北地区不同人群收集到的艰难梭菌分离株进行抗生素敏感性分析,为临床CDI的预防和治疗提供可靠数据。
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病毒基因分型方法的研究进展及应用
同一种病毒不同分离株(变异株)之间核苷酸序列及抗原性之间的差异造成了各分离株间血清学反应性、致病性、毒力、对治疗的应答、流行区域及分布等的不同.因此,进一步研究病毒分型对流行病学调查、病毒毒力强弱的研究、不同亚型病毒特异疫苗的研制、病毒感染的自然历程及其持续感染在发病过程中的作用、病毒的演变过程、病毒与宿主的相互作用及临床治疗效果等有着十分重要的意义.
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山东地区输血传播病毒(TTV)检测和部分基因克隆及序列测定
[摘要] 目的 了解TTV山东分离株感染状况及基因变异的情况.方法 应用逆转录聚合酶链反应(PCR)检测26例来自山东泰安、莱芜、济宁、菏泽、枣庄及临沂、日照地区非甲~庚型肝炎和12例肝细胞癌患者,其中HBV感染者5例,HCV感染者2例,HBV+HCV+HGV混合感染2例,HBV+HCV+TTV感染者1例,HGV+TTV感染者1例,HEV+HGV感染者1例.
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研究者确定炭疽杆菌基因组序列
近美国一份研究(TD READ et al.Science Express Online:2002.5.9)报道:通过对两种炭疽杆菌株(包括Ames株和佛罗里达炭疽袭击分离株)的基因比对发现:佛罗里达分离株来源于Ames株.此外,该研究还显示了全基因组测序技术和计算法在分析炭疽和其他细菌爆发的研究中的重要意义.
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噬菌体基因有助于链球菌毒性增加
A组链球菌(GAS)是临床上为常见的病原微生物,其引起的疾病包括链球菌性咽喉炎,链球菌性伤口感染,中毒性休克,"食肉"病,猩红热,风湿性关节炎和肾脏病等.美国过敏和传染病研究所(NIAID)科学家为弄清为什么有些GAS株能引起严重感染而另外一些GAS株仅引起轻度感染,对GAS基因组进行了研究.通过比较自不同GAS感染者体内GAS分离株的全基因蓝图,研究者试图找出疾病相关性基因序列.
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SEN病毒核酸异质性及准种现象的观察
目的:报告SEN病毒核苷酸的异质性和准种特点.方法:取深圳地区SEN病毒流行病学调查得到的SENV D型或H型阳性血清各3份进行巢式PCR扩增,阳性PCR产物克隆至T载体,每份随机挑选1-11份阳性克隆进行分别测序,并与GeneBank上的北京株、美国株、意大利株和日本株进行比较分析.结果:挑选的16株克隆中D型和H型分别为13株和3株,均属于SENV序列.来自SZ-54的11株SENVD型克隆中准种占81.8%(9/11).本地3例患者的11株SENVD型阳性克隆与GeneBank的4株异地株,共15株间的同源性为77.7-99.5%.同一宿主9个克隆间的碱基变异个数为8.5±5.2,与同一地区不同宿主的11个克隆间的28.9±3.2和不同地区不同宿主的15个克隆间的29.6±7.8比较,有显著性差异(P均<0.001).3株SENV H型阳性克隆与GeneBank的4株异地株共7株间的同源生为74.6-95.0%.进化分析表明,来自同一宿主的分离株遗传关系近,同地区不同宿主的分离株其次,与4株异地分离株的遗传距离较远.结论:SENV核酸的变异性高,个体间存在较大差异,且在同一个感染者体内也存在大量SENV准种.在检测SENV的方法选择、比较SENV的序列差异和分析SENV的临床意义时应充分考虑到SENV的这种特性.
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不同基因亚型幽门螺杆菌对大蒜素的敏感性
目的:研究不同基因亚型幽门螺杆菌对大蒜素的敏感性.方法:从新鲜胃黏膜中分离、培养出Hpylori共5l株.经聚合酶链反应(PCR)鉴定Hpylori菌株的cagA,vacA(sl,mlb,m2)基因亚型.用琼脂稀释法测定51例Hpylori分离株对大蒜素的低抑菌浓度(MIC),并计算MIC5o值.结果:大蒜素对5l株Hpylori菌株表现出良好的抑菌效果,总抑菌率达92.2%(47/51),其MIC5o值为7.97 mg/L,MIC值范围在1.25-40 mg/L.vacAmlb+基因亚型Hpylori菌株较vacAmlb-基因亚型Hpylori菌株对大蒜素敏感(相对中位数潜力0.55,95%可信区间0.30-0.89);vacAm2+基因亚型Hpylori菌株较vacAm2-基因亚型Hpylori菌株对大蒜素敏感(相对中位数潜力0.67,95%可信区间0.44-0.98).cagA+vacAsl+mlb+、cagA+vacAsl+m2+基因亚型组合Hpylori菌株较cagA+vacAsl-mlb-Hpylori菌株对大蒜素敏感(相对中位数潜力0.38/0.37,95%可信区间0.10-0.78/0.11-0.81).结论:大蒜素对Hpylori菌株有良好的抑菌效果,其MIC5o值为7.97 mg/L,MIC值范围在1.25-40 mg/L.并且其抗菌作用随着大蒜素浓度的增高而加强.不同基因亚型及组合的Hpylori菌株对大蒜素的敏感性不同.
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结核分支杆菌耐乙胺丁醇分离株embB基因突变的测序分析
乙胺丁醇(EMB)是具有广谱抗分支杆菌活性的一线抗结核合成药物,被广泛应用于结核分支杆菌、鸟分支杆菌和堪萨斯分支杆菌等多种非结核分支杆菌的治疗.近年来,EMB在原发和复发结核病患者中的耐药率有上升趋势[1],我们应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)银染技术和PCR-自动测序法对结核分支杆菌embB基因进行了检测,以探讨建立直接快速检测结核分支杆菌EMB药物敏感性的实验方法.
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非结核分枝杆菌与结核分枝杆菌皆培养阳性病例的分析
非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria.NTM)与MTB同属与分枝杆菌属,其主要侵犯脏器也是肺部,因此在临床上NTM肺病易被误诊为肺结核,而肺结核也可同时合并NTM感染[1].据文献报道,我国从MTB分离株中鉴定出NTM菌株的构成比从1979年的4.3%( 29/682)升至2000年的11.1% (49/441)[2].为加强NTM肺病与肺结核的鉴别诊断,我们对91例经NTM和MTB培养均为阳性病例的临床特点进行了研究.
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非结核分支杆菌肺病63例临床分析
随着结核病疫情的下降,非结核分支杆菌肺病有逐渐增加的趋势.据第四次全国结核病流行病学调查结果[1],2000年非结核分支杆菌占分离株的11.1%,较1990年的4.9%明显增加.为了提高对该病的认识,对1998年8月~2001年8月在我院诊治的非结核分支杆菌肺病63例的临床资料分析报道如下.
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替考拉宁临床应用剂量专家共识
金黄色葡萄球菌为社区及医院感染的重要病原菌,甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌( methicillin-resistant staphylococcus aureus ,MRSA)的出现和不断增多给抗感染治疗带来了极大挑战。 MRSA所致感染治疗困难、预后差,发病率和病死率持续居高不下。2005—2014年中国细菌耐药监测网( CHINET )细菌耐药监测项目显示,我国大型教学医院中MRSA占所有金黄色葡萄球菌分离株的45%~69%[1-10]。美国疾病预防与控制中心(CDC)资料显示,2013年美国MRSA感染患者为80461例,其中11285例死亡。