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结核分枝杆菌katG S315T突变频率及突变株特征的研究
近年来分子遗传学研究表明,异烟肼(INH)耐药机制复杂,涉及多个基因,至少包括katG、inhA、kasA以及ahpC等基因[1-3].研究表明,INH耐药与编码过氧化氢酶-过氧化物酶的katG基因突变的联系强[4,5],其中katG基因的一种特定替换,315位密码子的AGC→ACC(Ser→Thr,或katG S315T)颠换报道多.
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天津市耐异烟肼或利福平的结核分枝杆菌相关基因突变特征
目前已知多个基因突变与MTB对异烟肼和利福平的耐药有关,但是不同的基因密码子突变率存在地区差异.为此,我们检测了天津市结核病患者异烟肼耐药株katG和inhA启动子以及利福平耐药株rpoB的突变情况,探讨其耐药相关基因的突变特征及基因突变与耐药表型的相关性.
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CALGB/SWOG 80405:既往未接受治疗 K-RAS野生型转移性结直肠腺癌患者接受FOLFIRI或mFOLFOX 6联合贝伐单抗或西妥昔单抗的Ⅲ期试验
FOLFIRI或mFOLFOX6联合贝伐单抗或西妥昔单抗是转移性结直肠腺癌患者的一线治疗方案,但哪种优尚不明确。2014年ASCO会议报道一项1420例患者入组的临床研究,研究表明对于K-RAS基因第12和13密码子野生型的转移性结直肠癌患者化疗联合贝伐单抗或西妥昔单抗在总生存期方面无显著差异,均可作为一线治疗方案。由于入组患者多为接受FOLFOX方案,未能与FOLFIRI比较哪种化疗方案更优。
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转化生长因子β1基因多态性及血清水平与高血压左室肥厚的关系
高血压是由遗传与环境因素相互作用而导致的多基因遗传病,左室肥厚(LVH)是病程中左室重塑的重要病理改变,包括心肌实质细胞肥大、间质纤维增生和血管重构,体内过量生成的转化生长因子β1(TGF-β1)被认为参与其中[1].近年来随着对TGF-β1的深入研究,发现其系一基因家族编码产物,其基因多态性与高血压左室肥厚的关系尚不清楚.我们检测其第10位密码子+869T/C及第25位密码子+915G/C单核苷酸多态性(SNP)在高血压患者和健康老年人中分布的差异,探讨基因型与表型之间的联系,以期为临床防治高血压及其并发症提供一定的实验依据.
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乳头状甲状腺癌BRAFV600E突变的表达及意义
乳头状甲状腺癌(PTC)是常见的甲状腺癌.多项研究证实,BRAF基因第15外显子1799位点T→A转换(T1799A),即密码子600位的缬氨酸被谷氨酸替代(V600E)是PTC常见的基因变异.本研究对BRAFV600E突变在PTC中的表达及其与不同病理分型的关系做进一步探讨.
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胰腺癌组织中K-ras基因点突变和端粒酶活性的检测与比较
许多近期研究已显示出分子生物学特征在胰腺癌发生发展中起着重要作用,现认为K-ras基因是与胰腺癌高度相关的癌基因,其第一外显子12密码子点突变见于90%左右的胰腺癌,远远高于在其它肿瘤的突变发生率.目前资料也显示,在正常组织中均无端粒酶活性检出,而在绝大多数恶性肿瘤组织均显示明显的端粒酶活性.因此端粒酶激活是癌细胞重要的生物学标记,其检测端粒酶活性对于肿瘤诊断具有重要意义.
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广西原发性肝细胞癌与p53基因72密码子单核苷酸多态性密切相关
临床分子流行病学资料提示,肿瘤抑制基因p53-72密码子的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与某些与人类乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染有关的肿瘤密切相关[1,2];这一多态性还可能增加丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)某些亚型感染的易感性[3],并与慢性肝病等一些因素共同增加原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)的发病危险度[4].我们对这一多态性在广西HCC中的分布进行了初步的研究探讨,现报告如下.
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癌基因BRAF突变在黑色素细胞痣与黑色素瘤中的作用
BRAF(v-raf murine sarcoma viral oncogenehomolog B1)是一种癌基因,位于RAS/RAF/MEK/ERK信号传导通路上.2002年以来,学者们相继发现在黑色素瘤中存在高频率的BRAF突变,这种T到A的突变发生在第15号外显子激酶结构域的单个位点,导致第600个密码子编码的氨基酸发生错义突变(BRAF~(V600E)),从而激活RAS/RAF/MEK/ERK通路,揭示可能与肿瘤发生相关~([1]).
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血清甘露糖结合凝集素水平及其基因点突变与妊娠期糖尿病发病的关系
妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)是妊娠期常见的合并症之一[1],其研究主要集中在胰岛素分泌相对减少和母体、胎盘分泌的抗胰岛素激素和细胞因子等方面.本研究通过检测GDM患者血清甘露糖结合凝集素(mannose binding leetin,MBL)浓度及其基因54位密码子点突变,探讨MBL血清浓度及MBL基因缺陷与GDM发病的关系.
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对"与《产前基因诊断白化病携带者一例》作者商榷"的答复
关于提到的<产前基因诊断白化病携带者一例>一文中的疏误之处,经核对,发现的确存在疏误:(1)tyrosinase,TYR应译为酪氨酸酶;(2)所检测到的突变位点为896位核苷酸,故对应的密码子为299位,核苷酸改变仍为精氨酸→组氨组;(3)TYR基因编码529个氨基酸.
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β珠蛋白基因座控制区缺陷研究进展
人类β珠蛋白基因(简称β基因)位于第11号染色体短臂上,总长度为60Kb,包括ε、Gγ、Aγ、δ和β及两个假基因ψβ2和ψβ1,它们紧密连锁,其边接顺序为5'-ψβ2-ε-Gγ-Aγ-ψβ1-δ-3'.每个β基因有两个非编码区(内含子)IVS-1和IVS-2,其长分别为130bp和850bp,它们分别插入到编码区(外显子)的相应于第30与31和104与105密码子的DNA序列之间.编码区编码β珠蛋白的146个氨基酸.
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甘露糖结合凝集素基因54号密码子多态性与川崎病易感性的研究
目的探讨甘露糖结合凝集素(MBL)基因第54号密码子多态性与中国汉族儿童川崎病的易感性和临床表型的关系.方法应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析,对160例中国汉族健康儿童及95例川崎病患儿的MBL基因多态性进行检测.结果 (1)中国汉族健康儿童MBL基因多态性分布与文献报道的香港华人及高加索人种接近,无统计学差异. (2)川崎病患儿GAC等位基因频率高于健康对照组(0.258 vs 0.138,P<0.01),而GGC等位基因频率低于健康对照组(0.742 vs 0.862,P<0.01).GAC型等位基因与中国汉族儿童川崎病密切相关[OR=2.18,95% CI(OR值的95%置信区间)为1.38~3.44,P<0.05].(3)在川崎病患儿中,GAC型等位基因携带者其病史有前驱感染史者多于GGC纯合子(P<0.01).结论川崎病发病受遗传背景的影响,与 MBL第54号密码子基因多态性密切相关.
关键词: 外源凝集素类 粘膜皮肤淋巴结综合征 基因 多态现象(遗传学) 密码子 -
XRCC3单核苷酸多态性与肺癌放疗近期疗效的相关性研究
一般认为肿瘤细胞DNA损伤修复能力与放射敏感性密切相关.DNA损伤修复过程中许多基因扮演着重要角色,这些基因的单核苷酸多态性(SNP)可改变蛋白质功能,并改变DNA修复能力,从而为通过检测这些基因SNP来预测机体细胞的放射敏感性指明了方向.笔者采用TaqMan-MGB探针技术和等位基因特异适时荧光PCR技术研究XRCC3第241密码子C/T SNP与肺癌放疗疗效的相关性.
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阿尔茨海默病患者早老素-1基因突变检测及其突变后对早老素-1和淀粉样前体蛋白表达功能的影响
目的 探讨阿尔茨海默病(AD)患者早老素-1(PS-1)基因突变情况及PS-1基因起始密码子ATG→GTG突变对PS-1和淀粉样前体蛋白(APP) mRNA水平及PS-1蛋白表达的影响.方法 (1)对2004年7月至2010年6月我院神经内科收治的111例AD患者行PS-1基因突变筛查;(2)将筛查发现的突变型PS-1 c.1A>G和野生型PS-1基因全长cDNA克隆人增强型绿色荧光蛋白表达载体;以空质粒、野生型和突变型PS-1转染人胚肾(HEK) 293和小鼠成神经瘤(N2a)细胞,利用实时荧光定量PCR检测转染后细胞PS-1和APP mRNA水平及蛋白质印迹检测PS-1蛋白的表达,以研究PS-1基因突变后的功能改变原因.结果 (1)1例患者(编号M766)PS-1基因3号外显子起始密码子发生了杂合突变ATG→GTG;(2) PS-1基因mRNA水平在HEK293细胞和N2a细胞中野生型均明显高于突变型(116.8±3.9与49.5 ±3.3,t=13.27,P<0.01;69.0±1.9与29.5±1.3,t=17.20,P<0.01),APP基因mRNA水平突变型和野生型比较差异无统计学意义.蛋白质印迹结果显示野生型和突变型PS-1在HEK293细胞中均表达,且突变型表达量较野生型少,而N2a细胞仅表达野生型PS-1.结论 PS-1基因检测仅发现1个新的杂合突变ATG→GTG,AD患者PS-1基因突变频率很低;PS-1基因起始密码子突变导致PS-1蛋白表达减少,PS-1蛋白部分减少可能不是引起致病的独立因素,但可能是AD的一个危险因子.
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眼脑肾综合征一家系的OCRL基因致病突变检测
目的 探讨眼脑肾综合征一家系的OCRL基因致病突变筛查与检测。方法 采集家系成员外周血及胎儿羊水并提取基因组DNA。在OCRL基因两侧选取微卫星标记进行连锁分析;对患者OCRL基因全部外显子进行PCR扩增和测序;对可能致病突变采用限制酶分析验证。利用连锁分析、直接测序及酶切分析,对胎儿进行产前基因检测。结果 先证者及3名肯定携带者OCRL基因存在无义突变c.2032C--→T(p.R678X);其他7名家系成员及胎儿均不携带此突变。结论 OCRL基因c.2032C→T突变是该家系出现眼脑肾综合征的原因;家系中胎儿不携带此致病突变。
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乙型肝炎病毒表面抗原终止密码子的偏嗜性选择
目的:探究乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)终止密码子的存在状况及偏嗜性.方法:从GenBank中选取各基因型的参考序列共174例;使用生物软件BioEdit进行序列比对,应用RNAdraw构建并分析其RNA二级结构.结果:(1)在174例参考序列中,HBsAg的终止密码子共有TAA和TGA两种形式.其中TAA形式的有124例,占71.26%;TGA形式的有50例,占28.74%.(2)终止密码子的使用存在偏嗜性,并影响RNA的二级结构和蛋白质的编码氨基酸序列.结论:HBsAg终止密码子的使用偏嗜性客观存在,可能与进化过程中RNA结构和蛋白质功能的保守性相关.
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050 胰岛素抵抗的基因学研究
[英]/Pederson O…//Exp Clin Endocrinol Diabetes-1999,107.-113~118 胰岛素敏感性在人群中存在10倍以上的差异,对这种差异原因的解释尚不足1/3。遗传因素可能是这些差异的主要原因,因而也可能是胰岛素抵抗(IR)发生的主要因素。IR可能是许多具有不同功能的突变基因共同作用的结果,每个突变基因仅产生轻微的表现。基因不能从根本上决定IR的发生,而是提供了环境因素发挥作用的基础。目前有3种能够互相补充的研究方法:突变候选基因的直接分析、候选基因或染色体区带与家族性2型糖尿病IR的相关性分析及随机基因组定位图与特性位点定量(QTL)分析。 肥胖的候选基因突变分析显示,肥胖者易于发生IR,因此肥胖基因可能就是引起IR的原因。①在自然发生的单基因突变肥胖动物模型中,如ob/ob和db/db小鼠,人们发现瘦素及其受体的突变会引起肥胖并继发IR和糖尿病,但去除人瘦素和瘦素受体基因并未引起肥胖发生。近对一名瘦素基因无意义突变的纯合子研究报告表明,罕见但严重的先天性瘦素异常能够引起始于儿童期的肥胖。②解偶联蛋白(UCPs)是重要的产热调节者,其基因的异常引起脂肪的储存增加。但对人类UCP1~2基因的突变分析认为它并不是肥胖的主要原因。③β3 肾上腺能受体在控制内脏脂肪分解中有重要作用。其第64位色氨酸可被精氨酸替换,这种突变携带者出现的频率为20%。这种变异,特别是纯合子能够引起腹部脂肪增加、高胰岛素血症和IR。 胰岛素信号传导连锁过程候选基因的突变分析显示,胰岛素受体底物(IRS)-1和磷脂酰肌醇3(PI3)激酶是传导过程的主要成员。IRS-1基因的第972密码子的甘氨酸能够被精氨酸替换,这种突变在高加索人中约占9%。具有这种变异的32-D细胞,其被胰岛素激活的PI3激酶活性不足,伴IRS-1与PL3激酶p85调节亚基结合减少,胰岛素靶细胞内信号传递异常。对380名青年人进行研究,这种纯合子的胰岛素敏感性下降,根据BMI25k/M3分层,肥胖者中,杂合子较野生型的胰岛素敏感性下降50%。体内存在与肥胖有关的对胰岛素信号传导过程有毒性作用的因子如肿瘤坏死因子(TNF)-α。基因突变使IRS-1对这些毒性因子的敏感性增高,IRS-1的丝氨酸磷酸化程度增高,减低了胰岛素受体的活化,从而影响了胰岛素信号的传导。近的研究显示,972密码子和其它IR基因的突变增加了2型糖尿病发生IR的危险性。PI3激酶调节亚基基因:p855亚基第326密码子蛋氨酸能够被异亮氨酸替换,这种变异的纯合子在高加索人中占2%,可出现糖耐量减低。对380名成年人进行研究证明纯合子的糖利用率明显下降。在p855亚基上,326密码子编码的氨基酸与SH2区仅相距6个氨基酸残基。SH2区正是PI3激酶与IRS-1相互作用的部位。糖原相关蛋白磷酸酶-1(PPIG)调节亚基基因:第905密码子的天冬氨酸可被酪氨酸替换,这种变异的杂合子在高加索人中占18%,能够出现组织特异性和途径特异性的IR。 目前尚未发现与高加索人中多基因遗传性IR明显相关的基因位点。随机基因组定位图研究发现4q染色体上的一个基因对胰岛素大作用和空腹血清胰岛素水平有影响。随后进行的突变分析证实脂肪酸结合蛋白的一个氨基酸变异影响了脂代谢和胰岛素敏感性。 结论 与IR有关的重要的等位基因突变存在于胰岛素信号传导连锁过程,包括IRS-1和PI3激酶。遗传性IR将被证明是多种胰岛素信号传导网络成员基因和众多能量代谢过程的调控基因发生微小突变并与环境危险因子相互作用的结果。(马通军摘 尹 潍校)
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9 与2型糖尿病不同,1型糖尿病与脂肪酸结合蛋白2 基因密码子54多态性无关(ADA 2001年会,30-OR)
与野生型(Ala-54/ Ala-54)相比,2型糖尿病(T2DM)脂肪酸结合蛋白(FABP)2基因苏氨酸(Thr)取代丙氨酸(Ala)密码子54多态性与空腹及餐后甘油三酯(TG)水平增加及异常脂血症有关.为评估该多态性是否与1型糖尿病(T1DM)有关(该患者通常无代谢综合征表现),研究者筛查了181例血糖控制与T2DM患者相似的T1DM患者.野生型、杂合子(Ala -54/Thr-54)与纯合子(Thr-54/ Thr-54)间总、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)及非HDL-胆固醇无差别.脂负荷后,血浆、乳糜微粒中TG及极低密度脂蛋白(VLDL)曲线下面积在野生型组与纯合子组中相似.表明与T2DM不同,T1DM与FABP 2基因密码子54多态性引起高TG血症及异常脂血症无关.因两型糖尿病血糖控制相似,故其他因素如年龄和(或)胰岛素抵抗可能参与伴有 FABP2基因密码子54 多态性的T2DM患者异常脂血症的发生.
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直肠癌患者大便中K-ras基因第12位密码子点突变与隐血试验对比
直肠癌是常见的胃肠道肿瘤,如能早期诊断,手术可以根治.对直肠癌可疑患者来说,大便隐血(OB)试验是一种无损伤的筛查方法,但其特异性和敏感性均不能令人满意.本文试图采用错配碱基套式PCR-RFLP检测直肠癌患者大便中K-ras癌基因第12位密码子点突变,并与OB比较,以探讨其临床意义.
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大肠杆菌偏嗜性人γ干扰素基因编码序列的克隆
目的:获得适于大肠杆菌表达的人γ干扰素(hIFN-γ)基因.方法:用大肠杆菌偏嗜性密码子替换已知hIFN-γ基因编码序列中相应的密码子,将重新设计后的编码序列分为六段进行人工化学合成,通过PCR拼接技术扩增出大肠杆菌偏嗜性hIFN-γ基因编码序列,并进行克隆及序列分析.结果:经序列分析证实,重组pGEM-hIFN-γ质粒含有与预期结果一致的hIFN-γ基因编码序列.结论:成功进行了大肠杆菌偏嗜性hIFN-γ基因的克隆,为hIFN-γ基因的体外高表达奠定了基础.