国际药学研究杂志
Journal of International Pharmaceutical Research 국제약학구잡지
- 主管单位： 军事医学科学院
- 主办单位： 军事医学科学院毒物药物研究所，中国药学会
- 影响因子： 0.80
- 审稿时间： 1-3个月
- 国际刊号： 1674-0440
- 国内刊号： 11-5619/R
- 论文标题 期刊级别 审稿状态
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几种海洋天然产物立体结构的确定
有机化合物立体结构的确定是有机化合物结构确定的主要内容之一,许多天然产物都具有α,β-不饱和环酮、α,β-不饱和酮基侧链等结构单元,该类化合物往往可通过圆二色谱(CD)中320～350 nm n→π*跃迁、220～260 nmπ→π*跃迁的Cotton效应曲线来确定绝对构型.本文对具有α,β-不饱和环酮结构单元的化合物、具有α,β-不饱和酮基侧链的六元环类化合物、神经酰胺类化合物、具有环丙烷结构单元的脂肪链类化合物、具有双键的脂肪链类化合物的立体结构的测定方法进行了综述,希望能对这些类型化合物立体结构的确定提供一定的参考.
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海洋天然产物结构解析若干立体化学问题
在天然产物结构解析中,常遇到立体化学问题(手性碳、轴不对称或面不对称).确定其立体化学不仅是天然产物化学的重要内容之一,而且对阐明分子的靶向功能具有重要意义.现代波谱技术为天然产物构型确定提供了可靠的方法.本文结合作者的研究实例,综述应用现代波谱在若干海洋天然产物结构解析中的应用实例.
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几种物理化学技术在天然产物立体结构解析中的应用
阐明天然产物的立体化学尤其是测定绝对构型,往往涉及天然产物结构研究的关键技术和方法,也是天然产物结构解析的技术难点所在.本文结合课题组近期研究工作和相关技术方法基本原理,归纳介绍我们利用钼试剂Mo2(OAc)4诱导CD(ICD,Snatzke法)、部分经典CD经验规则、改良Mosher法、计算ECD、改良Marfey分析法等几种技术解析阐明手性新天然产物立体化学的几个研究实例和我们应用相关技术方法的粗浅体会,以供相关研究者借鉴和参考.
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量子化学计算1H和13C化学位移与1H-1H偶合常数在天然产物结构鉴定中的运用
天然产物结构鉴定对于天然产物化学家来说永远都是首要的任务之一.特别是多手性中心分子的构型确定,因对天然产物研究者极具挑战,已受到越来越多的关注.在过去10年,量子化学计算(quantum chemical calculation)1H和13C化学位移和1H-1H-自旋-自旋偶合常数(spin-spin couping constamts,SSCC)在计算准确度、削减计算成本和可应用性上得到了显著的提升.随着相关理论与技术的不断进步,理论计算辅助结构鉴定必将成为每个化学实验室结构确证的一项标配手段.本文,对计算1H和13C化学位移和SSCC的原理和优势做了简要介绍,并列举几个结构纠正的例子来阐述这些方法在实际结构鉴定中运用.
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电子圆二色谱技术在天然产物绝对构型确定中的应用
天然产物绝对构型的确定是一个重要且长期存在的问题.很多天然产物因其不易结晶或得率甚微,从而无法用单晶X线衍射(XRD)以及Mosher反应等化学方法确定它们的绝对构型.由于在溶液状态下即可进行化合物的圆二色(CD)谱测定,加上测定时样品用量少、不需要标准品以及可回收等特点,使电子圆二色(ECD)谱方法成为天然产物绝对构型确定的有力工具.本文以本课题组发现的活性天然产物链格孢内酰胺(alternarlactam)的绝对构型确定为切入点,通过对其左旋和右旋化合物分别用CD的方法进行计算和比较,有助于理解CD在天然产物绝对构型确定中的应用.
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海洋天然产物立体构型研究进展
海洋天然产物是发现重要新型药物先导化合物的重要资源.海洋天然产物往往具有独特的结构骨架和复杂的立体构型,而化合物的立体构型往往与其生物活性息息相关.所以海洋天然产物的立体构型确定既是化合物结构研究的难点之一,也是天然产物非常重要的研究内容.本文简要综述了目前海洋天然产物立体构型确定的常用方法及其应用研究案例,旨在为天然药物化学研究提供一些参考和借鉴.
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天然产物绝对构型的确定方法
天然产物的物理、化学、生物及药物学性质与其绝对构型紧密相关,而天然产物绝对构型的确定一直都是天然产物化学中面临的巨大挑战,受到科研工作者的广泛关注.人们已经总结出多种确定方法,如X线单晶衍射、基于手性试剂化学反应和核磁共振(NMR)的Mosher法、光谱法(如圆二色谱)及有机合成等方法,对于不同结构特点天然产物的绝对构型确定,这些方法各有利弊.本文综述了这些常用方法的原理、优势和局限性.
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Rh2(OCOCF3)4试剂在仲醇和叔醇类结构绝对构型确定中的应用
天然产物绝对构型的确定是一个令人关注的研究领域.与化合物手性中心直接相关的圆二色(circular dichroism,CD)谱法是确定溶液中手性化合物绝对构型的有效手段之一.国外文献介绍了一种通过使用过渡金属试剂Rh2(OCOCF3)4进行手性仲醇或叔醇结构绝对构型的确定方法,手性仲醇或叔醇与Rh2(OCOCF3)4络合后,其CD图谱在600～270 nm范围内有A～F6个吸收带,其中出现在350 nm处的E带可通过bulkiness规则来确定仲醇或叔醇的绝对构型.本文将对Rh2(OCOCF3)4作为辅助生色团诱导CD,确定天然产物手性仲醇或叔醇结构绝对构型的研究进行系统介绍.
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圆二色谱法在黄酮木脂素绝对构型测定中的应用进展
黄酮木脂素类化合物作为一类特殊类型的天然黄酮类化合物,由于其显著的保肝和抗癌作用,备受人们关注.然而由于其结构的复杂性和相似性,给分离工作和绝对构型的确定带来很大困难.本文综述了近30年来圆二色(CD)谱法在黄酮木脂素类化合物绝对构型测定中的一些规律及应用,以期为该类化合物绝对构型测定提供有益的参考.
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电子圆二色谱计算方法在天然产物绝对构型确定中的应用
电子圆二色(electronic circular dichroism,ECD)谱计算方法是利用量子化学方法计算化合物对映异构体的ECD,对比实验值与2个对映异构体ECD计算图谱的相似性,从而确定手性化合物的绝对构型.随着量子化学的发展,ECD的计算结果的精度越来越高,已成为天然产物绝对构型确定中的重要手段.本文介绍了ECD计算方法中常用的软件与方法,并以本课题组发表的化合物为例,介绍ECD计算在天然产物绝对构型确定的应用.
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偶合常数分析在柔性天然分子相对构型鉴定中的应用
天然产物中的柔性结构片段可自由旋转,其相对构型的确定仍然具有相当的挑战性.基于偶合常数的构型分析方法(JBCA)可有效地解决该类问题.该法主要应用于邻/间二次甲基柔性结构片段,结合氢-氢和碳-氢偶合常数(3JH,H,2,3JH,C)以及核欧沃豪斯效应(NOE)测试对柔性结构片段进行构象分析,进而确定其相对构型.本文简要综述了该法近年来在柔性天然分子结构鉴定中的研究进展,希望为天然产物立体化学研究提供一定参考.
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核磁共振在确定链状化合物相对构型中的应用
随着核磁共振技术的发展,核磁共振光谱广泛用于有机化合物的结构分析和确定.本文综述了运用核磁共振技术确定链状化合物的相对构型的新方法,主要是借助于偶合常数、氢核磁共振技术和碳核磁共振技术进行复杂有机化合物的相对构型的确定,包括运用系统偶合常数大小来确定含1,2-二次甲基,1,3-二次甲基片段和γ-氨基-β-羟基-α-亚甲基羧酸衍生物的相对构型,运用氢化学位移变化确定1,3-二醇类、α-烷基-β-羟基片段的酮类化合物和具有1,3,n-多甲基取代碳链化合物的相对构型,以及运用碳化学位移确定1,3-二醇类化合物的相对构型.
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计算化学在确定天然产物绝对构型中的应用
天然产物所展现出的化学、生物等方面性质与其绝对构型息息相关.对天然产物绝对构型的确定是对天然产物进行全面认识的重要过程.传统的方法存在一定的局限性.然而随着计算机技术及量子化学理论的发展,已能对天然产物的旋光、圆二色谱、核磁共振图谱进行精确的计算模拟.结合了计算与实验光谱的研究方法为确定天然产物绝对构型提供了新的思路.近年来,计算化学手段已经逐渐成为研究天然产物绝对构型的重要工具.本文通过论述近年来计算化学在天然产物绝对构型确定中的研究进展,为研究者合理地选择计算手段用以确定天然产物绝对构型提供参考.
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天然有机手性分子立体构型的若干理论方法进展
天然有机小分子因结构的多样性和复杂性,其立体结构的鉴定一直是研究的难点,也是热点之一.尤其是近年来分离材料的发展,得到的天然产物的结构更趋复杂,且得量少,这给其立体结构的解析带来了更严峻的挑战.随着计算方法的发展和计算技术的进步,利用不同的理论方法来鉴定不同类型的手性分子的立体结构成为可能.主要是通过计算有机分子的13C NMR并与实验结果比较来确定未知结构分子的相对构型,其在分子中的任何一个手性中心绝对构型已知的前提下,计算13C NMR也可用于绝对构型的鉴定.另外,通过计算手性分子的旋光(OR),旋光色散(ORD)、电子圆二色谱(ECD)、振动圆二色谱(VCD)以及手性分子的特征矩阵值,并将这些计算结果与实验值进行比较,也能很好地确定手性分子的绝对构型.目前,利用不同的计算方法来交叉验证同一分子的不同性质,成为一种非常有效的研究模式.
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量子化学辅助计算在解析天然产物化学结构中的应用
天然产物的化学结构鉴定直接影响研究者对其生物活性和靶向作用的深入研究,而准确快捷地解决结构鉴定问题,特别是立体化学问题,却因天然产物结构的复杂性而不断面临挑战.近年来,以Gaussian软件为载体发展的量子化学辅助计算如电子圆二色谱、振动圆二色谱、比旋光度和核磁共振等方法,为解决复杂天然产物结构鉴定提供了一种便捷工具.本文结合近年来一些较复杂天然产物化学结构的成功解析,就Gaussian辅助计算的应用进行简要综述,以期为该类技术的更广泛研究和应用提供一定参考.
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含时密度泛函理论-电子圆二色谱(TDDFT ECD)计算法在判定天然产物绝对构型中的应用
天然产物结构鉴定过程中其立体构型的判定始终是具有挑战性的一个环节.在解决天然产物立体化学问题的众多方法中,利用化合物的电子圆二色谱(ECD)图确定其绝对构型是一个快速、有效而可靠的方法.近年来随着量子化学计算法的发展,含时密度泛函理论-ECD(TDDFTECD)技术逐渐成为化学家用于判定天然产物绝对构型的一种有力手段.根据适用对象的差别,该技术可分为固态TDDFT ECD计算与液态TDDFT ECD计算两种方法.两种方法在应用中均十分直观、明了,简言之是将实测ECD谱图与计算ECD谱图进行比对,二者吻合度越高则判定结果越可靠.受篇幅限制,本文简介TDDFT ECD计算法的原理,并选取几个实例以说明该方法的应用范围.
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